More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2857 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  49.76 
 
 		 1062 aa  962    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  56.29 
 
 		 1081 aa  1183    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1148 aa  2348    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  50.05 
 
 		 1068 aa  983    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  47.37 
 
 		 1056 aa  915    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  43.54 
 
 		 1086 aa  823    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  47.23 
 
 		 1176 aa  1005    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1130 aa  572  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1033 aa  542  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1006 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.66 
 
 		 1109 aa  513  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  31.59 
 
 		 1123 aa  511  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1027 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1043 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1145 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1036 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1094 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 1018 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 1029 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  32.07 
 
 		 953 aa  395  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 1093 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2139  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 		 1131 aa  390  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0246116  normal  0.23403 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  30.49 
 
 		 1056 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 1033 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 		 937 aa  367  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1116 aa  363  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 1086 aa  360  7e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 1056 aa  355  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 1144 aa  353  8.999999999999999e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1045 aa  351  4e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1146 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  28.44 
 
 		 1095 aa  342  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1155 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.53 
 
 		 1020 aa  336  1e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 1130 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.03 
 
 		 1061 aa  336  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 1079 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2722  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 		 1139 aa  333  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.784353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1132 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1038 aa  329  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1026 aa  328  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 1047 aa  327  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  25.9 
 
 		 1148 aa  322  3.9999999999999996e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1142 aa  320  9e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 1049 aa  320  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 1026 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1177 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 1192 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2249  TonB-dependent receptor plug  26.87 
 
 		 1190 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.520087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1148 aa  307  7e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  27.94 
 
 		 1181 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 1025 aa  307  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 		 1217 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1079 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  28.08 
 
 		 1168 aa  304  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  28.06 
 
 		 1038 aa  301  3e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 1029 aa  301  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 1050 aa  292  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 913 aa  290  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1161 aa  290  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.4 
 
 		 1039 aa  290  1e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 1084 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 1188 aa  287  7e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 1058 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 1175 aa  285  4.0000000000000003e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  26.08 
 
 		 986 aa  282  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 1202 aa  281  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 1114 aa  280  8e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  26.96 
 
 		 1019 aa  279  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 929 aa  278  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1023 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1071 aa  274  7e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1137 aa  274  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 1160 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 1037 aa  273  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1189 aa  271  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  27.41 
 
 		 1100 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 1066 aa  270  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3773  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 1120 aa  269  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  27.36 
 
 		 1052 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 1129 aa  268  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1008 aa  268  5.999999999999999e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1006 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 1043 aa  265  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 1087 aa  265  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 1164 aa  264  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1028 aa  263  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 1128 aa  263  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 1097 aa  262  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1800  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1058 aa  260  1e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.33 
 
 		 1043 aa  259  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1024 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1119 aa  259  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 1071 aa  259  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  27 
 
 		 1119 aa  259  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 1039 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1010 aa  257  9e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 999 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1104 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  24.88 
 
 		 1154 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>