262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1389 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 709 aa  1433    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  52.24 
 
 		 831 aa  320  6e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  54.43 
 
 		 676 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  47.81 
 
 		 627 aa  306  9.000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  52.88 
 
 		 930 aa  300  6e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  47.32 
 
 		 579 aa  291  4e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  48.84 
 
 		 668 aa  289  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  50.51 
 
 		 346 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  50.47 
 
 		 930 aa  283  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  49.67 
 
 		 343 aa  276  7e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  45.85 
 
 		 387 aa  269  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  49.07 
 
 		 390 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  49.06 
 
 		 522 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  42.43 
 
 		 752 aa  243  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  43.11 
 
 		 391 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  37.16 
 
 		 1293 aa  225  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  39.1 
 
 		 392 aa  221  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  38.06 
 
 		 588 aa  215  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  40.42 
 
 		 491 aa  207  8e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  36.81 
 
 		 786 aa  182  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  40.09 
 
 		 525 aa  177  5e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  34.1 
 
 		 697 aa  168  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  32.13 
 
 		 307 aa  163  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  30.59 
 
 		 698 aa  160  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  30.31 
 
 		 433 aa  156  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  36.08 
 
 		 1079 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  36.09 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  35.22 
 
 		 646 aa  148  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  33.44 
 
 		 1163 aa  144  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1146 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.01 
 
 		 2296 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1750 aa  138  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 353 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  35.08 
 
 		 963 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  32.8 
 
 		 1140 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  32.04 
 
 		 1051 aa  129  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1026 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 		 850 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1351 aa  121  4.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  28.96 
 
 		 903 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  31 
 
 		 372 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1068 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  30.04 
 
 		 343 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.23 
 
 		 1292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  30.26 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1030 aa  115  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  28.28 
 
 		 1931 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  30.62 
 
 		 343 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  66.22 
 
 		 581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  32.32 
 
 		 664 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  30.61 
 
 		 1056 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  35.9 
 
 		 700 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  29.46 
 
 		 954 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  29.9 
 
 		 461 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  69.86 
 
 		 627 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 		 359 aa  107  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  31.06 
 
 		 1177 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.75 
 
 		 365 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  65.75 
 
 		 735 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  31 
 
 		 1035 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  67.14 
 
 		 787 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  71.64 
 
 		 522 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  65.75 
 
 		 488 aa  104  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  30.17 
 
 		 810 aa  104  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30.38 
 
 		 373 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  65.71 
 
 		 848 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  38.78 
 
 		 355 aa  103  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  33.93 
 
 		 418 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  64 
 
 		 294 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  30.89 
 
 		 447 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1030 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  55.43 
 
 		 958 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  30.14 
 
 		 318 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.74 
 
 		 1130 aa  102  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  61.54 
 
 		 298 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  33 
 
 		 322 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  26.33 
 
 		 892 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  30.9 
 
 		 777 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  26.24 
 
 		 354 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  30.43 
 
 		 652 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.59 
 
 		 899 aa  100  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.03 
 
 		 321 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  61.84 
 
 		 479 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  56.96 
 
 		 468 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  28.81 
 
 		 838 aa  99  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  63.64 
 
 		 919 aa  98.6  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  29.41 
 
 		 635 aa  98.2  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  34.22 
 
 		 368 aa  98.2  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  30.48 
 
 		 361 aa  97.4  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  28.99 
 
 		 363 aa  96.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  60.27 
 
 		 749 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  58.44 
 
 		 403 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  43.93 
 
 		 869 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  28.52 
 
 		 294 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1836  NHL repeat-containing protein  29.41 
 
 		 906 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.7 
 
 		 395 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  59.49 
 
 		 361 aa  95.5  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  28.15 
 
 		 328 aa  95.1  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.9 
 
 		 547 aa  94.7  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>