117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3775 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  100 
 
 		 275 aa  556  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  38.17 
 
 		 567 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  38.28 
 
 		 535 aa  85.9  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4928  glycoside hydrolase family 10  37.5 
 
 		 490 aa  83.2  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  36.84 
 
 		 801 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  38.26 
 
 		 468 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  39.32 
 
 		 548 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  36.89 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  37.82 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  38.14 
 
 		 498 aa  80.1  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4882  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.97 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0472231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.84 
 
 		 493 aa  79.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4912  Ricin B lectin  37.29 
 
 		 547 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.365133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6867  Ricin B lectin  33.09 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  39.66 
 
 		 492 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.6 
 
 		 489 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  36.13 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  36.44 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4941  glycoside hydrolase family 11  34.75 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0644483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.58 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  35.4 
 
 		 469 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  36.89 
 
 		 476 aa  72.4  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  35 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3580  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4873  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.9 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.958979  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4910  Glycoside hydrolase family 59  35.96 
 
 		 801 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  36.61 
 
 		 522 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  30.58 
 
 		 634 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  35.48 
 
 		 384 aa  68.9  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4331  glycoside hydrolase family 46  34.71 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4880  Ricin B lectin  31.62 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0253313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  33.9 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7491  Alginate lyase 2  37.19 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2054  Ricin B lectin  34.71 
 
 		 459 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 1072 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4031  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.97 
 
 		 531 aa  66.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192066  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  35.59 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 423 aa  65.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1328  EnvE  32.2 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1940  EnvE  32.2 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1994  glycoside hydrolase family 31  32.23 
 
 		 1207 aa  63.9  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3582  Ricin B lectin  29.51 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.67342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  33.88 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1346  envelope protein EnvE  31.36 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482474  normal  0.0581998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1361  envelope protein EnvE  31.36 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0362665  normal  0.565411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2123  envelope protein EnvE  31.36 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.728766  hitchhiker  0.000157137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  37.93 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  40 
 
 		 436 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  33.33 
 
 		 496 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0324  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  36.27 
 
 		 580 aa  58.9  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0179568 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  33.07 
 
 		 1222 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3581  Glycoside hydrolase family 59  27.49 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5223  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  28.33 
 
 		 627 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.77 
 
 		 933 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1327  Ricin B lectin  35 
 
 		 732 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.12568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  30.95 
 
 		 806 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5941  alpha-1,2-mannosidase  29.51 
 
 		 890 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0456  Ricin B lectin  33.6 
 
 		 568 aa  55.8  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  31.2 
 
 		 644 aa  55.5  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  27.73 
 
 		 1577 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0982  hypothetical protein  34.31 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  30.43 
 
 		 446 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5006  glycoside hydrolase family 5  32.2 
 
 		 516 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.180234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  36.62 
 
 		 803 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6745  hypothetical protein  35.14 
 
 		 653 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419034  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  32.03 
 
 		 1567 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.93 
 
 		 756 aa  53.1  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4641  Ricin B lectin  29.75 
 
 		 574 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0200277  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 		 709 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  32 
 
 		 358 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6873  Ricin B lectin  31.96 
 
 		 589 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.783664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  42.67 
 
 		 487 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  27.87 
 
 		 794 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.93 
 
 		 815 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3796  Ricin B lectin  32.14 
 
 		 597 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.475116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1395  galactose oxidase  30.71 
 
 		 1100 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.610012  normal  0.129659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  30.67 
 
 		 497 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  27.91 
 
 		 672 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  34.57 
 
 		 483 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  40.79 
 
 		 474 aa  48.5  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  36.36 
 
 		 691 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  36.07 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  28.41 
 
 		 824 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.79 
 
 		 520 aa  47  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  32.21 
 
 		 382 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02510  hypothetical protein  30.19 
 
 		 591 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1731  Ricin B lectin  29.87 
 
 		 172 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0110  glycoside hydrolase family 31  30.53 
 
 		 1128 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0156  Ricin B lectin  26.67 
 
 		 187 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151088  normal  0.0518201 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  34.29 
 
 		 806 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  34.29 
 
 		 806 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  34.29 
 
 		 806 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34.29 
 
 		 806 aa  45.4  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  32.1 
 
 		 495 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  34.29 
 
 		 806 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  34.29 
 
 		 806 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6568  hypothetical protein  42.67 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  hitchhiker  0.00578077 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  34.29 
 
 		 806 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4149  Ricin B lectin  33.78 
 
 		 320 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.255794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  26.45 
 
 		 465 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>