16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02510 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02510  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1233    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  37.33 
 
 
492 aa  53.9  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4872  Ricin B lectin  38.67 
 
 
489 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1665  Alpha-galactosidase  32.91 
 
 
567 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6907  Ricin B lectin  33.33 
 
 
469 aa  47.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00437458  decreased coverage  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3775  Ricin B lectin  30.19 
 
 
275 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.776108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  33.33 
 
 
368 aa  47  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  33.77 
 
 
468 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7918  Alpha-galactosidase  32.43 
 
 
535 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.542076  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2634  family 10 glycoside hydrolase  36.11 
 
 
497 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.760387 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  28.57 
 
 
239 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  39.22 
 
 
603 aa  44.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3106  Ricin B lectin  34.67 
 
 
548 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0930028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0964  Ricin B lectin  27.78 
 
 
240 aa  43.9  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7107  Galactosylceramidase  31.71 
 
 
803 aa  43.9  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0521566  normal  0.686545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  37.97 
 
 
374 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>