More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1138 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  100 
 
 		 674 aa  1338    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  60.06 
 
 		 676 aa  785    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  49.63 
 
 		 683 aa  614  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  36.76 
 
 		 670 aa  323  5e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  34.88 
 
 		 671 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  33.44 
 
 		 674 aa  305  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  32.61 
 
 		 671 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  32.61 
 
 		 671 aa  286  9e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  37.62 
 
 		 686 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  36.09 
 
 		 427 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  33.12 
 
 		 676 aa  266  8e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  36.47 
 
 		 683 aa  256  7e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  30.36 
 
 		 424 aa  253  6e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  35.79 
 
 		 645 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  30.87 
 
 		 424 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  28.93 
 
 		 394 aa  218  4e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  29.48 
 
 		 394 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  29.48 
 
 		 394 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  27.27 
 
 		 394 aa  207  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  34.72 
 
 		 659 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  31.91 
 
 		 666 aa  170  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  33.1 
 
 		 469 aa  158  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  29.06 
 
 		 623 aa  156  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  34.02 
 
 		 602 aa  150  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  30.36 
 
 		 680 aa  147  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  29.81 
 
 		 646 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  29.71 
 
 		 692 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  26.85 
 
 		 705 aa  140  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  28.06 
 
 		 766 aa  132  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  27.42 
 
 		 709 aa  130  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  26.42 
 
 		 791 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  28.47 
 
 		 1182 aa  129  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  28.8 
 
 		 770 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  28.26 
 
 		 704 aa  127  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  25 
 
 		 737 aa  127  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  28.2 
 
 		 702 aa  127  9e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  29.91 
 
 		 750 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  27.16 
 
 		 665 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  30.08 
 
 		 716 aa  125  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  29.18 
 
 		 709 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  25.68 
 
 		 810 aa  124  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  27.15 
 
 		 716 aa  124  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1710  exoribonuclease II  31.18 
 
 		 657 aa  124  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128406  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  30.59 
 
 		 689 aa  123  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  25 
 
 		 735 aa  123  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  24.95 
 
 		 762 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  28.28 
 
 		 825 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  29.74 
 
 		 813 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  25.18 
 
 		 742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  27.16 
 
 		 817 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  26.45 
 
 		 698 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  27.06 
 
 		 718 aa  122  3e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  27.3 
 
 		 667 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  26.33 
 
 		 656 aa  121  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  27.88 
 
 		 801 aa  120  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  27.49 
 
 		 751 aa  120  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  28.31 
 
 		 757 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  28.23 
 
 		 794 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  24.58 
 
 		 581 aa  120  9.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  25.42 
 
 		 726 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  26.83 
 
 		 813 aa  120  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1904  exoribonuclease II  30.11 
 
 		 644 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.629828  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  28.32 
 
 		 828 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  28.78 
 
 		 735 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  28.09 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  29.09 
 
 		 774 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  24.65 
 
 		 619 aa  118  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  25.98 
 
 		 708 aa  118  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  27.36 
 
 		 705 aa  118  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  27.17 
 
 		 791 aa  119  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  27.89 
 
 		 680 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  27.59 
 
 		 863 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4448  ribonuclease II  30.66 
 
 		 617 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  24.78 
 
 		 710 aa  117  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  24.78 
 
 		 710 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.72 
 
 		 670 aa  116  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2244  exoribonuclease II  30.97 
 
 		 644 aa  116  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.469162  normal  0.153134 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2599  ribonuclease II  27.18 
 
 		 615 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  28.08 
 
 		 815 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2016  exoribonuclease II  30.97 
 
 		 644 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134803  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  26.26 
 
 		 752 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  27.47 
 
 		 751 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  23.87 
 
 		 806 aa  115  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1743  exoribonuclease II  31.86 
 
 		 643 aa  115  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  26.67 
 
 		 671 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  23.94 
 
 		 808 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  23.94 
 
 		 810 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  26.94 
 
 		 838 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  27.16 
 
 		 751 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  27.83 
 
 		 788 aa  115  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  23.94 
 
 		 806 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  27.91 
 
 		 779 aa  114  6e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0297  exoribonuclease II  29.64 
 
 		 645 aa  114  7.000000000000001e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  23.94 
 
 		 812 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  26.23 
 
 		 801 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04620  exoribonuclease II, putative  28.37 
 
 		 999 aa  114  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2638  exoribonuclease II  27.39 
 
 		 644 aa  114  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.76344  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  26.75 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  27.65 
 
 		 819 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  25.42 
 
 		 795 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>