More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1581 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  100 
 
 		 813 aa  1625    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  57.88 
 
 		 863 aa  909    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  44.65 
 
 		 1182 aa  621  1e-176  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  43.52 
 
 		 706 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  38.84 
 
 		 762 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  41.11 
 
 		 758 aa  501  1e-140  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  41 
 
 		 716 aa  501  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  38.15 
 
 		 788 aa  497  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  38.51 
 
 		 806 aa  489  1e-136  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  38.58 
 
 		 814 aa  486  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  38.38 
 
 		 808 aa  486  1e-136  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  38.38 
 
 		 808 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  38.38 
 
 		 808 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  38.38 
 
 		 806 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  38.48 
 
 		 812 aa  485  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  38.25 
 
 		 806 aa  486  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  38.38 
 
 		 804 aa  486  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  38.38 
 
 		 810 aa  485  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  40.98 
 
 		 757 aa  484  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  42.08 
 
 		 770 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  38.27 
 
 		 792 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  39.75 
 
 		 709 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  39.75 
 
 		 706 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  37.98 
 
 		 751 aa  469  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  37.7 
 
 		 751 aa  465  1e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  39.57 
 
 		 763 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  43.06 
 
 		 715 aa  462  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  39.75 
 
 		 763 aa  457  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  40.47 
 
 		 903 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  36.86 
 
 		 810 aa  455  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  36.59 
 
 		 792 aa  446  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  39.4 
 
 		 759 aa  443  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  38.32 
 
 		 790 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  38.32 
 
 		 790 aa  444  1e-123  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  38.44 
 
 		 722 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  41.98 
 
 		 751 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  39.42 
 
 		 752 aa  433  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  38.94 
 
 		 777 aa  434  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  36.08 
 
 		 742 aa  431  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  36.99 
 
 		 857 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  36.74 
 
 		 857 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  36.62 
 
 		 857 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  38.36 
 
 		 737 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  38.83 
 
 		 737 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  37.13 
 
 		 736 aa  422  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  37.37 
 
 		 859 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  35.28 
 
 		 709 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  35.95 
 
 		 716 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  37.31 
 
 		 749 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  36.78 
 
 		 705 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  37.61 
 
 		 758 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  33.83 
 
 		 735 aa  415  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  33.9 
 
 		 804 aa  416  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  36.81 
 
 		 828 aa  411  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  36.91 
 
 		 705 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  35.67 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  36.25 
 
 		 801 aa  412  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  33.69 
 
 		 827 aa  412  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  36.29 
 
 		 737 aa  411  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  35.28 
 
 		 750 aa  411  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  34.15 
 
 		 708 aa  412  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  36.34 
 
 		 877 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  37.61 
 
 		 805 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  38.39 
 
 		 720 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  37.04 
 
 		 766 aa  408  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  36.9 
 
 		 937 aa  409  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  36.3 
 
 		 840 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  39.49 
 
 		 1055 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  35.92 
 
 		 795 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  37.31 
 
 		 876 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  37.36 
 
 		 828 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  36.2 
 
 		 818 aa  404  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  36.64 
 
 		 895 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  34.22 
 
 		 726 aa  405  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  37.02 
 
 		 833 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  37.92 
 
 		 803 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  37.23 
 
 		 833 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  38.21 
 
 		 861 aa  405  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  37.63 
 
 		 877 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  37.07 
 
 		 827 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  37.07 
 
 		 817 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  37.07 
 
 		 827 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  37.07 
 
 		 817 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  37.07 
 
 		 827 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  36.64 
 
 		 886 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  36.64 
 
 		 812 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  36.18 
 
 		 726 aa  396  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  36.32 
 
 		 726 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  34.73 
 
 		 818 aa  399  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  36.07 
 
 		 870 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  36.64 
 
 		 838 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  36.64 
 
 		 838 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  36.64 
 
 		 896 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  36.5 
 
 		 722 aa  397  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  39.04 
 
 		 794 aa  398  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  36.57 
 
 		 817 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  34.13 
 
 		 876 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  36.64 
 
 		 896 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  36.64 
 
 		 838 aa  399  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  34.88 
 
 		 822 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>