More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2219 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  58.08 
 
 		 813 aa  887    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  100 
 
 		 863 aa  1747    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  49.28 
 
 		 1182 aa  622  1e-177  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  41.45 
 
 		 716 aa  509  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  37.36 
 
 		 788 aa  496  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  41.2 
 
 		 706 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  39.87 
 
 		 777 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  38.9 
 
 		 763 aa  481  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  38.25 
 
 		 757 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  37.41 
 
 		 806 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  39.35 
 
 		 759 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  37.13 
 
 		 806 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  37.27 
 
 		 808 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  37.27 
 
 		 804 aa  474  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  37.27 
 
 		 810 aa  474  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  37.27 
 
 		 808 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  37.27 
 
 		 808 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  37.27 
 
 		 806 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  37.27 
 
 		 814 aa  473  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  37.13 
 
 		 812 aa  472  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  37.13 
 
 		 706 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  36.02 
 
 		 762 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  38.11 
 
 		 758 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  38.58 
 
 		 763 aa  466  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  36.86 
 
 		 792 aa  465  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  37.61 
 
 		 751 aa  463  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  42.96 
 
 		 751 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  40.26 
 
 		 752 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  40.14 
 
 		 903 aa  462  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  40.69 
 
 		 715 aa  460  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  37.32 
 
 		 751 aa  457  1e-127  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  39.25 
 
 		 770 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  36.12 
 
 		 709 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  35.85 
 
 		 792 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  39.23 
 
 		 710 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  36.14 
 
 		 810 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  37.09 
 
 		 805 aa  437  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  39.09 
 
 		 710 aa  439  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  36.03 
 
 		 790 aa  436  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  36.03 
 
 		 790 aa  436  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  37.33 
 
 		 818 aa  431  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  36.98 
 
 		 722 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  40.06 
 
 		 791 aa  424  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  39.12 
 
 		 842 aa  423  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  36.72 
 
 		 766 aa  423  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  33.15 
 
 		 735 aa  421  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  37.72 
 
 		 737 aa  422  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  34.39 
 
 		 825 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  39.03 
 
 		 1055 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  36.43 
 
 		 840 aa  422  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  34.4 
 
 		 709 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  35.99 
 
 		 750 aa  422  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  34.47 
 
 		 742 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  35.84 
 
 		 716 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  37.71 
 
 		 795 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  39.38 
 
 		 836 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  35.96 
 
 		 833 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  34.99 
 
 		 737 aa  416  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  39.41 
 
 		 838 aa  419  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  36.01 
 
 		 826 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  37.72 
 
 		 737 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  37.3 
 
 		 726 aa  414  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  32.62 
 
 		 708 aa  415  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  38.18 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  38.07 
 
 		 791 aa  416  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  35.94 
 
 		 705 aa  416  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  36.95 
 
 		 808 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  36.97 
 
 		 857 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  37.87 
 
 		 795 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  37.2 
 
 		 857 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  37.16 
 
 		 726 aa  412  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  39.26 
 
 		 704 aa  411  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  34.19 
 
 		 824 aa  412  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  37.1 
 
 		 794 aa  410  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  36.44 
 
 		 801 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  35.11 
 
 		 859 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  36.83 
 
 		 857 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  36.06 
 
 		 834 aa  411  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  36.41 
 
 		 828 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  34.35 
 
 		 801 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  37.18 
 
 		 735 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  36.55 
 
 		 827 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  37.04 
 
 		 821 aa  409  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  36.55 
 
 		 827 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  34.21 
 
 		 804 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  35.47 
 
 		 705 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  36.55 
 
 		 827 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  36.41 
 
 		 817 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  36.41 
 
 		 895 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  36.14 
 
 		 830 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  38.01 
 
 		 819 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  33.98 
 
 		 937 aa  404  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  36.21 
 
 		 834 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  38.56 
 
 		 770 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  34.64 
 
 		 819 aa  405  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  36.41 
 
 		 817 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  35.24 
 
 		 833 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  35.05 
 
 		 758 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  36.07 
 
 		 833 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  34.33 
 
 		 817 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>