More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0821 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  53.5 
 
 		 808 aa  830    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  87.18 
 
 		 792 aa  1393    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  53.1 
 
 		 806 aa  830    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  56.28 
 
 		 762 aa  875    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  49.44 
 
 		 716 aa  660    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  53.63 
 
 		 808 aa  832    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  53.63 
 
 		 804 aa  832    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  100 
 
 		 790 aa  1620    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  53.37 
 
 		 810 aa  829    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  53.88 
 
 		 792 aa  828    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  53.37 
 
 		 812 aa  832    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  100 
 
 		 790 aa  1620    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  53.63 
 
 		 806 aa  833    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  45.65 
 
 		 801 aa  639    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  53.63 
 
 		 808 aa  832    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  47.96 
 
 		 903 aa  643    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  53.37 
 
 		 806 aa  832    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  52.15 
 
 		 814 aa  834    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  56.46 
 
 		 758 aa  862    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  43.79 
 
 		 788 aa  637    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  46.63 
 
 		 751 aa  635    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  46.02 
 
 		 810 aa  649    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  46.21 
 
 		 751 aa  634  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  43.36 
 
 		 817 aa  628  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  46.56 
 
 		 706 aa  625  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  44.85 
 
 		 801 aa  624  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  46.63 
 
 		 716 aa  624  1e-177  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  47.39 
 
 		 757 aa  620  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  45.58 
 
 		 709 aa  615  9.999999999999999e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  43.48 
 
 		 770 aa  609  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  47.61 
 
 		 722 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  46.69 
 
 		 774 aa  606  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  43.54 
 
 		 706 aa  601  1e-170  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  42.24 
 
 		 763 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  43.13 
 
 		 759 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  43.19 
 
 		 779 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  41.71 
 
 		 715 aa  570  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  42.09 
 
 		 705 aa  567  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  40.25 
 
 		 763 aa  556  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  41.95 
 
 		 752 aa  552  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  43.97 
 
 		 726 aa  554  1e-156  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  42.22 
 
 		 710 aa  547  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  42.08 
 
 		 710 aa  545  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  39.62 
 
 		 777 aa  536  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  42.65 
 
 		 737 aa  532  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  43.49 
 
 		 737 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  41.18 
 
 		 708 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  41.51 
 
 		 766 aa  516  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  41.74 
 
 		 704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  38.01 
 
 		 937 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  38.88 
 
 		 709 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  37.27 
 
 		 720 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  40.14 
 
 		 737 aa  492  1e-137  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  36.04 
 
 		 801 aa  486  1e-136  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  40.22 
 
 		 751 aa  489  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  37.38 
 
 		 818 aa  483  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  36.59 
 
 		 857 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  36.46 
 
 		 857 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  40.4 
 
 		 667 aa  479  1e-134  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  36.16 
 
 		 857 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  36.33 
 
 		 859 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  36.59 
 
 		 833 aa  472  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  35.89 
 
 		 828 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  36.26 
 
 		 819 aa  467  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  38.27 
 
 		 726 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  37.99 
 
 		 726 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  34.59 
 
 		 877 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  35.84 
 
 		 821 aa  463  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  35.96 
 
 		 834 aa  461  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  36.97 
 
 		 834 aa  462  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  37.26 
 
 		 803 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  37.2 
 
 		 758 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  36.83 
 
 		 830 aa  457  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  37.43 
 
 		 746 aa  458  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  37.43 
 
 		 746 aa  458  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  37.21 
 
 		 722 aa  459  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  37.25 
 
 		 742 aa  458  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  36.23 
 
 		 1055 aa  456  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  38.59 
 
 		 805 aa  458  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  35.56 
 
 		 810 aa  458  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  37.67 
 
 		 750 aa  459  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  34.96 
 
 		 871 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  36.07 
 
 		 877 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  33.33 
 
 		 876 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  35.61 
 
 		 861 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  35.03 
 
 		 826 aa  452  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  34.29 
 
 		 870 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  37.9 
 
 		 736 aa  450  1e-125  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  37.27 
 
 		 836 aa  449  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  34.44 
 
 		 818 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  36.45 
 
 		 848 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  36.97 
 
 		 840 aa  451  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  35.74 
 
 		 864 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  34.95 
 
 		 906 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  34.29 
 
 		 876 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  35.26 
 
 		 827 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  35.84 
 
 		 804 aa  451  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  34.37 
 
 		 833 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  34.65 
 
 		 818 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  34.95 
 
 		 907 aa  451  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>