More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5232 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  45.37 
 
 		 801 aa  654    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  54.35 
 
 		 792 aa  830    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  75.6 
 
 		 762 aa  1196    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  100 
 
 		 806 aa  1648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  53.07 
 
 		 722 aa  733    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  98.12 
 
 		 808 aa  1555    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  98.5 
 
 		 804 aa  1569    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  98 
 
 		 810 aa  1559    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  54.74 
 
 		 903 aa  749    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  47.68 
 
 		 715 aa  660    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  99.26 
 
 		 806 aa  1639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  99.63 
 
 		 806 aa  1644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  49.43 
 
 		 709 aa  694    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  53.98 
 
 		 757 aa  732    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  47.83 
 
 		 716 aa  665    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  98.12 
 
 		 808 aa  1555    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  90.85 
 
 		 792 aa  1459    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  52.61 
 
 		 716 aa  742    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  95.91 
 
 		 814 aa  1571    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  52.13 
 
 		 770 aa  696    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  98.01 
 
 		 812 aa  1569    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  53.67 
 
 		 790 aa  823    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  51.14 
 
 		 706 aa  728    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  50.63 
 
 		 706 aa  711    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  53.67 
 
 		 790 aa  823    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  52.39 
 
 		 751 aa  741    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  52.11 
 
 		 751 aa  734    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  98.62 
 
 		 808 aa  1560    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  52.61 
 
 		 788 aa  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  46.59 
 
 		 705 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  76.7 
 
 		 758 aa  1160    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  44.49 
 
 		 763 aa  631  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  45.59 
 
 		 759 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  43.8 
 
 		 763 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  45.79 
 
 		 810 aa  618  1e-175  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  42.16 
 
 		 817 aa  609  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  43.81 
 
 		 774 aa  605  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  41.48 
 
 		 801 aa  587  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  43.22 
 
 		 779 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  43.11 
 
 		 726 aa  585  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  45.2 
 
 		 710 aa  566  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  45.26 
 
 		 737 aa  568  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  39.92 
 
 		 801 aa  567  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  42.56 
 
 		 752 aa  562  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  40.4 
 
 		 818 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  45.06 
 
 		 710 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  42.52 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  44.66 
 
 		 737 aa  552  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  39.6 
 
 		 720 aa  547  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  39.92 
 
 		 937 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  41.32 
 
 		 708 aa  532  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  40.4 
 
 		 840 aa  531  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  38.15 
 
 		 857 aa  525  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  40.12 
 
 		 722 aa  528  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  40.93 
 
 		 746 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  40.06 
 
 		 859 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  40.93 
 
 		 746 aa  526  1e-148  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  37.78 
 
 		 857 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  38.02 
 
 		 857 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  38.4 
 
 		 861 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  42.67 
 
 		 766 aa  525  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  39.67 
 
 		 877 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  38.24 
 
 		 828 aa  522  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  39.39 
 
 		 877 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  38.76 
 
 		 813 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  41.42 
 
 		 704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  36.39 
 
 		 833 aa  517  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  36.65 
 
 		 834 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  38.76 
 
 		 813 aa  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  38.76 
 
 		 813 aa  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  39.29 
 
 		 819 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  38.87 
 
 		 834 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  38.76 
 
 		 813 aa  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  38.76 
 
 		 813 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  38.76 
 
 		 813 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  38.9 
 
 		 876 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  38.76 
 
 		 813 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  37.48 
 
 		 833 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  38.76 
 
 		 813 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  38.76 
 
 		 813 aa  515  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  42.34 
 
 		 737 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  37.83 
 
 		 812 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  37.7 
 
 		 812 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  38.22 
 
 		 906 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  37.83 
 
 		 812 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  37.7 
 
 		 812 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  37.83 
 
 		 812 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  37.87 
 
 		 907 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  38.15 
 
 		 828 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  37.42 
 
 		 815 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  39.89 
 
 		 758 aa  508  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  36.38 
 
 		 824 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  39.94 
 
 		 803 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  38.48 
 
 		 830 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  39.28 
 
 		 758 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  41.74 
 
 		 667 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  40.14 
 
 		 818 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  39.75 
 
 		 736 aa  503  1e-141  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  37.36 
 
 		 819 aa  505  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  37.32 
 
 		 808 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>