More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCZK4818 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  45.5 
 
 
801 aa  655    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  54.62 
 
 
792 aa  832    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  98.88 
 
 
806 aa  1573    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  99.13 
 
 
806 aa  1577    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  96.65 
 
 
814 aa  1579    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  98.63 
 
 
808 aa  1560    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  98.88 
 
 
804 aa  1573    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  100 
 
 
810 aa  1657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  99.5 
 
 
806 aa  1581    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  54.12 
 
 
757 aa  734    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  98.63 
 
 
808 aa  1560    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  52.61 
 
 
788 aa  771    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  52.41 
 
 
770 aa  699    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  98.88 
 
 
812 aa  1577    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  90.15 
 
 
792 aa  1462    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  51.14 
 
 
706 aa  728    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  47.97 
 
 
716 aa  666    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  75.73 
 
 
762 aa  1196    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  53.07 
 
 
722 aa  732    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  47.4 
 
 
715 aa  657    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  53.94 
 
 
790 aa  825    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  49.43 
 
 
709 aa  693    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  54.74 
 
 
903 aa  749    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  50.63 
 
 
706 aa  712    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  53.94 
 
 
790 aa  825    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  52.61 
 
 
716 aa  742    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  52.68 
 
 
751 aa  744    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  52.39 
 
 
751 aa  737    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  76.84 
 
 
758 aa  1162    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  98.88 
 
 
808 aa  1565    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  46.73 
 
 
705 aa  640    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  44.63 
 
 
763 aa  631  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  45.73 
 
 
759 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  43.8 
 
 
763 aa  619  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  46.07 
 
 
810 aa  621  1e-176  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  44.2 
 
 
774 aa  609  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  42.2 
 
 
817 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  41.61 
 
 
801 aa  586  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  43.22 
 
 
779 aa  588  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  43.25 
 
 
726 aa  585  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  45.26 
 
 
737 aa  567  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  40.82 
 
 
818 aa  566  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  45.34 
 
 
710 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  40.41 
 
 
801 aa  567  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  45.2 
 
 
710 aa  566  1e-160  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  42.7 
 
 
752 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  42.67 
 
 
777 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  44.66 
 
 
737 aa  551  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  39.75 
 
 
720 aa  548  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  40.33 
 
 
937 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  40.68 
 
 
840 aa  533  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  41.18 
 
 
708 aa  531  1e-149  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  40.55 
 
 
722 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  41.21 
 
 
746 aa  529  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  41.21 
 
 
746 aa  529  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  40.48 
 
 
859 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  40.34 
 
 
857 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  40.34 
 
 
857 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  40.08 
 
 
877 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  42.53 
 
 
766 aa  524  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  38.54 
 
 
861 aa  524  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  38.51 
 
 
828 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  40.2 
 
 
857 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  39.81 
 
 
877 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  37.81 
 
 
833 aa  519  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  36.33 
 
 
833 aa  519  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  38.76 
 
 
813 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  38.76 
 
 
813 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  41.28 
 
 
704 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  38.76 
 
 
813 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  39.29 
 
 
834 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  39.57 
 
 
819 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  36.78 
 
 
834 aa  517  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  38.76 
 
 
813 aa  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  38.76 
 
 
813 aa  514  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  39.17 
 
 
876 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  38.76 
 
 
813 aa  514  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  38.76 
 
 
813 aa  515  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  38.76 
 
 
813 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  38.76 
 
 
813 aa  514  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  38.62 
 
 
906 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  38.27 
 
 
907 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  37.7 
 
 
812 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  39.12 
 
 
755 aa  509  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  37.83 
 
 
812 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  38.9 
 
 
830 aa  510  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  37.7 
 
 
812 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  40.17 
 
 
758 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  45.71 
 
 
737 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  37.83 
 
 
812 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  40.37 
 
 
803 aa  510  1e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  39.71 
 
 
758 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  37.83 
 
 
812 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  37.53 
 
 
819 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  36.18 
 
 
824 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  38.1 
 
 
815 aa  509  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  37.74 
 
 
826 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  41.9 
 
 
667 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  37.8 
 
 
809 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  38.08 
 
 
828 aa  506  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>