More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0973 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  59.83 
 
 		 710 aa  839    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  56.9 
 
 		 704 aa  741    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  55.68 
 
 		 766 aa  764    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  100 
 
 		 737 aa  1492    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  59.68 
 
 		 710 aa  837    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  43.64 
 
 		 762 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  44.6 
 
 		 716 aa  543  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  43 
 
 		 759 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  43.35 
 
 		 758 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  41.68 
 
 		 763 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  41.54 
 
 		 792 aa  511  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  42.82 
 
 		 806 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  45.71 
 
 		 806 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  42.9 
 
 		 808 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  42.82 
 
 		 810 aa  511  1e-143  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  43.04 
 
 		 808 aa  510  1e-143  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  42.9 
 
 		 808 aa  509  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  42.67 
 
 		 812 aa  509  1e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  42.34 
 
 		 806 aa  511  1e-143  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  42.67 
 
 		 903 aa  511  1e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  45.54 
 
 		 804 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  41.25 
 
 		 706 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  42.88 
 
 		 814 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  45.05 
 
 		 792 aa  497  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  40.14 
 
 		 790 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  41.33 
 
 		 751 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  41.18 
 
 		 751 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  40.14 
 
 		 790 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  41.48 
 
 		 716 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  42.58 
 
 		 810 aa  491  1e-137  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  42.42 
 
 		 757 aa  485  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  40.45 
 
 		 788 aa  485  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  40.31 
 
 		 763 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  41.87 
 
 		 706 aa  479  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  40.21 
 
 		 715 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  41.26 
 
 		 709 aa  478  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  39.75 
 
 		 801 aa  479  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  43.21 
 
 		 722 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  40.38 
 
 		 752 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  39.27 
 
 		 770 aa  464  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  39.91 
 
 		 737 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  39.77 
 
 		 737 aa  458  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  37.55 
 
 		 777 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  41.9 
 
 		 817 aa  449  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  41.12 
 
 		 801 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  39.16 
 
 		 705 aa  446  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  38.49 
 
 		 779 aa  438  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  37.28 
 
 		 758 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  33.62 
 
 		 827 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  38.88 
 
 		 774 aa  434  1e-120  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  36.47 
 
 		 726 aa  428  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  36.61 
 
 		 726 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  38.95 
 
 		 726 aa  427  1e-118  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  35.92 
 
 		 857 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  35.77 
 
 		 857 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  35.63 
 
 		 857 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  36.44 
 
 		 801 aa  423  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  36.83 
 
 		 722 aa  422  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  39.33 
 
 		 751 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  39.19 
 
 		 708 aa  421  1e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  34.99 
 
 		 863 aa  419  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  35.21 
 
 		 859 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  36.32 
 
 		 736 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  36.32 
 
 		 749 aa  416  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  34.97 
 
 		 828 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  35.48 
 
 		 840 aa  414  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  34.93 
 
 		 746 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  34.42 
 
 		 720 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  35.61 
 
 		 818 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  34.93 
 
 		 746 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  35.94 
 
 		 735 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  35.93 
 
 		 709 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  36.58 
 
 		 810 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  34.82 
 
 		 937 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  34.7 
 
 		 906 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  34.65 
 
 		 755 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  34.36 
 
 		 877 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  34.36 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  37.26 
 
 		 805 aa  405  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  33.24 
 
 		 870 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  36.39 
 
 		 1055 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  35.54 
 
 		 804 aa  402  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  34.56 
 
 		 907 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  34.01 
 
 		 819 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  35.02 
 
 		 818 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  36.29 
 
 		 813 aa  400  9.999999999999999e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  34.88 
 
 		 818 aa  402  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  34.5 
 
 		 876 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  33.07 
 
 		 876 aa  400  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  33.71 
 
 		 758 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  33.88 
 
 		 842 aa  397  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  35.4 
 
 		 822 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  33.75 
 
 		 861 aa  398  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  34.91 
 
 		 733 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  34.84 
 
 		 813 aa  394  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  33.61 
 
 		 895 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  34.09 
 
 		 817 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  34.11 
 
 		 819 aa  394  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  35.41 
 
 		 828 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  34.84 
 
 		 813 aa  393  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>