More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3965 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  100 
 
 		 827 aa  1691    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  41.6 
 
 		 763 aa  558  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  40.66 
 
 		 759 aa  558  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  40.23 
 
 		 763 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  39.87 
 
 		 737 aa  535  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  39.7 
 
 		 737 aa  531  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  39.19 
 
 		 716 aa  526  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  38.87 
 
 		 751 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  38.75 
 
 		 751 aa  525  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  40.65 
 
 		 762 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  40.65 
 
 		 758 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  37.68 
 
 		 788 aa  502  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  37.35 
 
 		 752 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  38.06 
 
 		 808 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  38.06 
 
 		 808 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  38.15 
 
 		 722 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  38.06 
 
 		 808 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  38.41 
 
 		 814 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  38.41 
 
 		 812 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  38.06 
 
 		 806 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  37.68 
 
 		 806 aa  491  1e-137  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  38.06 
 
 		 804 aa  492  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  37.94 
 
 		 810 aa  492  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  37.94 
 
 		 806 aa  492  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  38.14 
 
 		 903 aa  491  1e-137  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  37.64 
 
 		 792 aa  491  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  36.56 
 
 		 857 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  36.22 
 
 		 857 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  36.09 
 
 		 857 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  38.19 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  35.09 
 
 		 813 aa  482  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  35.09 
 
 		 813 aa  482  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  35.58 
 
 		 812 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  35.85 
 
 		 877 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  35.87 
 
 		 706 aa  481  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  35.09 
 
 		 813 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  40.35 
 
 		 757 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  35.58 
 
 		 812 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  35.58 
 
 		 812 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  35.09 
 
 		 813 aa  482  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  35.09 
 
 		 813 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  35.09 
 
 		 813 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  35.09 
 
 		 813 aa  482  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  35.09 
 
 		 813 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  35.09 
 
 		 813 aa  482  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  35.58 
 
 		 812 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  35.46 
 
 		 812 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  35.78 
 
 		 828 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  35.22 
 
 		 937 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  35.56 
 
 		 840 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  35.9 
 
 		 859 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  35.61 
 
 		 877 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  34.61 
 
 		 722 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  35.46 
 
 		 876 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  34.85 
 
 		 824 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  36.37 
 
 		 906 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  35.66 
 
 		 861 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  36.25 
 
 		 907 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  34.96 
 
 		 821 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  35.21 
 
 		 801 aa  467  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  36.74 
 
 		 817 aa  466  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  36.34 
 
 		 720 aa  464  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  34.55 
 
 		 705 aa  466  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  36.24 
 
 		 810 aa  465  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  34.62 
 
 		 818 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  35.81 
 
 		 838 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  35.81 
 
 		 896 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  35.81 
 
 		 812 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  35.12 
 
 		 834 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  35.81 
 
 		 896 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  35.81 
 
 		 838 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  36.07 
 
 		 715 aa  461  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  34.74 
 
 		 818 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  35.82 
 
 		 895 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  35.81 
 
 		 838 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  35 
 
 		 736 aa  460  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  35.81 
 
 		 886 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  35.93 
 
 		 755 aa  456  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  36.17 
 
 		 827 aa  458  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  35.59 
 
 		 726 aa  456  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  36.31 
 
 		 805 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  33.99 
 
 		 746 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  36.17 
 
 		 827 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  33.99 
 
 		 746 aa  457  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  35.12 
 
 		 749 aa  458  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  36.17 
 
 		 827 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  35.7 
 
 		 792 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  34.57 
 
 		 830 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  35.9 
 
 		 828 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  35.02 
 
 		 828 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  35.22 
 
 		 726 aa  452  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  35.51 
 
 		 790 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  35.44 
 
 		 758 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  35.82 
 
 		 735 aa  449  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  35.54 
 
 		 876 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  35.51 
 
 		 790 aa  450  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  36.01 
 
 		 817 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  35.18 
 
 		 804 aa  452  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  36.01 
 
 		 817 aa  452  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  36.44 
 
 		 833 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>