More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1353 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  47.61 
 
 		 790 aa  657    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  44.87 
 
 		 763 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  49.08 
 
 		 792 aa  684    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  53.07 
 
 		 806 aa  773    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  53.21 
 
 		 806 aa  774    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  53.07 
 
 		 808 aa  771    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  53.07 
 
 		 804 aa  772    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  53.07 
 
 		 810 aa  770    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  54.18 
 
 		 758 aa  777    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  53.35 
 
 		 812 aa  772    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  55.32 
 
 		 762 aa  798    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  50.71 
 
 		 706 aa  731    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  53.07 
 
 		 808 aa  771    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  100 
 
 		 722 aa  1452    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  48.51 
 
 		 770 aa  701    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  48.07 
 
 		 716 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  46.05 
 
 		 715 aa  647    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  58.13 
 
 		 757 aa  786    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  47.61 
 
 		 790 aa  657    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  53.5 
 
 		 792 aa  759    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  52.92 
 
 		 808 aa  770    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  54.1 
 
 		 751 aa  754    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  53.95 
 
 		 751 aa  748    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  55.05 
 
 		 788 aa  807    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  51.63 
 
 		 706 aa  721    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  53.07 
 
 		 806 aa  772    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  49.58 
 
 		 903 aa  696    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  57.71 
 
 		 716 aa  810    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  53.35 
 
 		 814 aa  766    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  45.77 
 
 		 709 aa  634  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  44.87 
 
 		 759 aa  627  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  45.13 
 
 		 705 aa  625  1e-178  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  44.95 
 
 		 763 aa  622  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  45.15 
 
 		 752 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  44.36 
 
 		 737 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  43.93 
 
 		 737 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  43.24 
 
 		 766 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  44.4 
 
 		 710 aa  552  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  41.88 
 
 		 777 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  44.4 
 
 		 710 aa  551  1e-155  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  41.3 
 
 		 708 aa  548  1e-154  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  40.34 
 
 		 720 aa  548  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  41.11 
 
 		 801 aa  548  1e-154  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  39.34 
 
 		 801 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  40.42 
 
 		 857 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  40.28 
 
 		 857 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  40.42 
 
 		 857 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  40.08 
 
 		 859 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  40.25 
 
 		 828 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  42.13 
 
 		 749 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  41.99 
 
 		 736 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  40.66 
 
 		 861 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  40 
 
 		 722 aa  529  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  38.15 
 
 		 827 aa  530  1e-149  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  43.09 
 
 		 779 aa  530  1e-149  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  39.7 
 
 		 877 aa  527  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  40.33 
 
 		 877 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  39.66 
 
 		 906 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  40.22 
 
 		 876 aa  522  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  39.66 
 
 		 907 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  38.97 
 
 		 735 aa  520  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  40 
 
 		 937 aa  521  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  42.64 
 
 		 704 aa  519  1e-146  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  40.58 
 
 		 804 aa  519  1e-146  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  42.79 
 
 		 810 aa  521  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  39.89 
 
 		 755 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  43.34 
 
 		 774 aa  518  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  39.63 
 
 		 813 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  40 
 
 		 813 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  39.63 
 
 		 813 aa  512  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  41.5 
 
 		 834 aa  512  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  39.63 
 
 		 813 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  39.63 
 
 		 813 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  37.38 
 
 		 840 aa  515  1e-144  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  38.4 
 
 		 803 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  39.63 
 
 		 813 aa  512  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  43.21 
 
 		 737 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  39.63 
 
 		 813 aa  512  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  39.09 
 
 		 818 aa  509  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  39.63 
 
 		 813 aa  512  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  39.63 
 
 		 813 aa  512  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  38.41 
 
 		 810 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  39.21 
 
 		 812 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  39.21 
 
 		 812 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  40.25 
 
 		 751 aa  509  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  39.21 
 
 		 812 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  39.21 
 
 		 812 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  39.07 
 
 		 812 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  40.25 
 
 		 817 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  37.34 
 
 		 758 aa  505  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  38.8 
 
 		 824 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  39.83 
 
 		 830 aa  504  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  40.38 
 
 		 805 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  39 
 
 		 821 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  37.8 
 
 		 805 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  42.7 
 
 		 801 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  39.26 
 
 		 709 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  40.74 
 
 		 833 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  38.01 
 
 		 746 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  37.52 
 
 		 758 aa  495  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>