More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04620 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL04620  exoribonuclease II, putative  100 
 
 		 999 aa  2038    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09151  mitochondrial exoribonuclease Cyt-4, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01550)  24.27 
 
 		 1050 aa  162  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.361435 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  26.4 
 
 		 686 aa  127  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  27.79 
 
 		 683 aa  115  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  27.87 
 
 		 645 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  28.37 
 
 		 674 aa  114  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  28.3 
 
 		 683 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  26.6 
 
 		 671 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  25.59 
 
 		 676 aa  107  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  27.35 
 
 		 674 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  26.08 
 
 		 671 aa  101  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  26.08 
 
 		 671 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  27.75 
 
 		 676 aa  99.8  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  25.06 
 
 		 670 aa  98.6  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83466  3'-5' RNA exonuclease complex component  25.61 
 
 		 1146 aa  96.3  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00000298042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  24.07 
 
 		 770 aa  85.1  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  25.93 
 
 		 863 aa  84.7  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  21.65 
 
 		 619 aa  84.3  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  23.34 
 
 		 813 aa  81.6  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  22.78 
 
 		 817 aa  81.3  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  22.07 
 
 		 763 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  22.31 
 
 		 777 aa  80.9  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  23.1 
 
 		 424 aa  80.9  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  22.76 
 
 		 791 aa  80.9  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  28.82 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  23.25 
 
 		 819 aa  79.7  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  23.53 
 
 		 722 aa  79.7  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  24.2 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  21.72 
 
 		 791 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  23.66 
 
 		 788 aa  78.6  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  22.04 
 
 		 722 aa  78.2  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  26.16 
 
 		 659 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  22.97 
 
 		 720 aa  77.4  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  22.82 
 
 		 709 aa  76.6  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  21.71 
 
 		 751 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  21.45 
 
 		 751 aa  77  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  22.63 
 
 		 810 aa  77  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  23.14 
 
 		 757 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  24.22 
 
 		 737 aa  75.9  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  23.1 
 
 		 716 aa  75.5  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  21.86 
 
 		 762 aa  74.7  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  23.95 
 
 		 704 aa  75.1  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  22.47 
 
 		 394 aa  75.1  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  21.38 
 
 		 763 aa  75.1  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  22.56 
 
 		 842 aa  74.7  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  22.27 
 
 		 762 aa  73.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  22.95 
 
 		 666 aa  74.3  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  21.58 
 
 		 758 aa  74.3  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  22.99 
 
 		 752 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  24.59 
 
 		 766 aa  72.8  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  21.93 
 
 		 755 aa  72.4  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  22.86 
 
 		 737 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  24.15 
 
 		 838 aa  72  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  23.86 
 
 		 750 aa  72  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  21.79 
 
 		 759 aa  72  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  23 
 
 		 706 aa  71.2  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  22.14 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  21.25 
 
 		 424 aa  70.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  21.39 
 
 		 706 aa  70.1  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  23.7 
 
 		 715 aa  69.7  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  22.13 
 
 		 394 aa  70.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4960  ribonuclease R  25.06 
 
 		 1004 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.51612 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  21.96 
 
 		 692 aa  69.7  0.0000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  23.22 
 
 		 825 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  21.05 
 
 		 818 aa  69.3  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  24.14 
 
 		 623 aa  68.9  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  22.19 
 
 		 737 aa  68.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  21.52 
 
 		 801 aa  68.2  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  21.4 
 
 		 795 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  22.45 
 
 		 758 aa  67.4  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  22.02 
 
 		 801 aa  67.4  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2195  ribonuclease II  23.99 
 
 		 702 aa  67.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  23.62 
 
 		 836 aa  67.4  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  21.76 
 
 		 705 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  22.03 
 
 		 795 aa  66.6  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  21.88 
 
 		 667 aa  66.6  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  24.1 
 
 		 733 aa  66.2  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  21.8 
 
 		 804 aa  66.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  21.8 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  21.8 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  21.8 
 
 		 812 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  22.16 
 
 		 794 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  24.53 
 
 		 770 aa  65.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4734  ribonuclease R  22.83 
 
 		 792 aa  66.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  21.8 
 
 		 808 aa  66.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  20.16 
 
 		 842 aa  65.9  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  21.8 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  20.68 
 
 		 718 aa  65.9  0.000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  23.04 
 
 		 701 aa  65.9  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  21.28 
 
 		 1182 aa  65.9  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  21.8 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  21.8 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  24.07 
 
 		 709 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  22.25 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  22.25 
 
 		 708 aa  65.1  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2449  ribonuclease R  22.8 
 
 		 808 aa  65.5  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.162395  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  21.46 
 
 		 813 aa  65.1  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  21.13 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  21.63 
 
 		 806 aa  65.1  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  21.83 
 
 		 814 aa  64.7  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>