More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3730 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  62.52 
 
 		 676 aa  817    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  64.17 
 
 		 671 aa  824    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  61.71 
 
 		 683 aa  810    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  61.86 
 
 		 671 aa  866    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  59.59 
 
 		 686 aa  818    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  64.17 
 
 		 671 aa  825    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  54.49 
 
 		 670 aa  728    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  100 
 
 		 674 aa  1382    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  35.83 
 
 		 645 aa  349  7e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  40.52 
 
 		 676 aa  325  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  32.4 
 
 		 683 aa  324  3e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  33.44 
 
 		 674 aa  319  9e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  31.07 
 
 		 659 aa  250  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  27.84 
 
 		 666 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  29.93 
 
 		 623 aa  219  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  33.26 
 
 		 427 aa  217  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  32.14 
 
 		 602 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  30.18 
 
 		 424 aa  206  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  32.35 
 
 		 813 aa  204  6e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  29.43 
 
 		 424 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  28.38 
 
 		 680 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  28 
 
 		 394 aa  191  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  33.74 
 
 		 469 aa  189  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  28.61 
 
 		 394 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  28.53 
 
 		 394 aa  183  1e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  28.79 
 
 		 394 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  30.39 
 
 		 718 aa  162  2e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  29.15 
 
 		 751 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  28.91 
 
 		 751 aa  157  7e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  29.16 
 
 		 757 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  27.48 
 
 		 863 aa  154  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  29.13 
 
 		 710 aa  151  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  24.77 
 
 		 689 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  28.93 
 
 		 710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  25.64 
 
 		 698 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  27.98 
 
 		 788 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  30.2 
 
 		 715 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  28.03 
 
 		 791 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  25.98 
 
 		 694 aa  144  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  29.57 
 
 		 706 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  26.92 
 
 		 766 aa  142  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1943  ribonuclease II  25.04 
 
 		 735 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  26.95 
 
 		 804 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  27.42 
 
 		 806 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  26.95 
 
 		 810 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  26.16 
 
 		 770 aa  141  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  27.19 
 
 		 792 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  29.36 
 
 		 735 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  26.95 
 
 		 808 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  26.95 
 
 		 808 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  26.95 
 
 		 808 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  26.95 
 
 		 812 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  27.2 
 
 		 774 aa  140  4.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  26.95 
 
 		 806 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  26.67 
 
 		 806 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  26.12 
 
 		 709 aa  140  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  26.95 
 
 		 814 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  27.16 
 
 		 770 aa  139  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  27.75 
 
 		 722 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  25.81 
 
 		 737 aa  139  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  28.75 
 
 		 762 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  26.46 
 
 		 763 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.65 
 
 		 665 aa  137  5e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  25.55 
 
 		 667 aa  137  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  26.61 
 
 		 680 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  28.13 
 
 		 737 aa  135  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  24.3 
 
 		 619 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  25.47 
 
 		 1182 aa  134  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  31.72 
 
 		 535 aa  134  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  25.05 
 
 		 705 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  25.7 
 
 		 777 aa  134  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  26.57 
 
 		 709 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  25.65 
 
 		 726 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1993  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  25.56 
 
 		 701 aa  131  3e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13462  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  28.78 
 
 		 671 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  27.86 
 
 		 737 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  25.2 
 
 		 801 aa  131  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  25.26 
 
 		 813 aa  130  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  26.9 
 
 		 692 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  24.66 
 
 		 815 aa  130  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  29.2 
 
 		 701 aa  130  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  27.59 
 
 		 706 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  26 
 
 		 794 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  27.43 
 
 		 667 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  25.1 
 
 		 763 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  25.9 
 
 		 752 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0179  ribonuclease II  24.79 
 
 		 698 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  25.7 
 
 		 750 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  27.09 
 
 		 759 aa  127  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  27.72 
 
 		 827 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  26.58 
 
 		 716 aa  127  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  25.41 
 
 		 704 aa  127  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  26.39 
 
 		 656 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  25 
 
 		 702 aa  125  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  28.36 
 
 		 678 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2599  ribonuclease II  29.56 
 
 		 615 aa  126  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  24.84 
 
 		 792 aa  125  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  25.72 
 
 		 857 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  24.49 
 
 		 790 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  25.52 
 
 		 795 aa  125  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>