More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1229 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  72.8 
 
 		 671 aa  972    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  60.94 
 
 		 683 aa  800    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  58.81 
 
 		 686 aa  823    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  72.8 
 
 		 671 aa  973    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  56.28 
 
 		 670 aa  746    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  60.84 
 
 		 671 aa  825    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  62.52 
 
 		 674 aa  849    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  100 
 
 		 676 aa  1373    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  34.19 
 
 		 645 aa  346  8e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  37.92 
 
 		 676 aa  302  1e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  33.12 
 
 		 674 aa  300  6e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  30.71 
 
 		 683 aa  288  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  31.16 
 
 		 666 aa  234  6e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  32 
 
 		 659 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  31.68 
 
 		 602 aa  221  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  31.67 
 
 		 424 aa  220  5e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  32.48 
 
 		 424 aa  220  7e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  33.58 
 
 		 427 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  29.03 
 
 		 680 aa  210  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  33.45 
 
 		 813 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  32.33 
 
 		 394 aa  207  5e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  29.01 
 
 		 623 aa  206  9e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  32.6 
 
 		 394 aa  202  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  32.33 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  30.41 
 
 		 394 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  34.63 
 
 		 469 aa  199  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  27.75 
 
 		 718 aa  156  1e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  31.91 
 
 		 667 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  29.88 
 
 		 671 aa  154  7e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  32.45 
 
 		 678 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  28.11 
 
 		 706 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  25.6 
 
 		 689 aa  145  2e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  27.07 
 
 		 680 aa  145  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  28.09 
 
 		 751 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  29.03 
 
 		 762 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  30.34 
 
 		 774 aa  141  3.9999999999999997e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.43 
 
 		 665 aa  141  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  27.87 
 
 		 751 aa  139  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  28.38 
 
 		 692 aa  139  2e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  29.52 
 
 		 863 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  28.82 
 
 		 710 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  28.82 
 
 		 710 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  28.45 
 
 		 656 aa  138  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  25.04 
 
 		 698 aa  137  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2180  exoribonuclease II  31.13 
 
 		 644 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801772 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  27 
 
 		 735 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  26.95 
 
 		 722 aa  135  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1943  ribonuclease II  24.4 
 
 		 735 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  27.15 
 
 		 813 aa  135  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  26.59 
 
 		 709 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  29.36 
 
 		 646 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  26.56 
 
 		 757 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1710  exoribonuclease II  30.73 
 
 		 657 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1225  exoribonuclease II  28.57 
 
 		 646 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1825  exoribonuclease II  30.08 
 
 		 644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.517880000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1520  exoribonuclease II  29.48 
 
 		 644 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  26.24 
 
 		 763 aa  132  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1841  exoribonuclease II  29.48 
 
 		 644 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.816503  hitchhiker  0.00000000000000293222 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1630  exoribonuclease II  29.81 
 
 		 644 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000100585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1830  exoribonuclease II  29.81 
 
 		 644 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.336461  hitchhiker  0.00426066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1448  exoribonuclease II  29.81 
 
 		 644 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0894921  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1887  exoribonuclease II  29.81 
 
 		 644 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0154652  hitchhiker  0.00000000880902 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  29.28 
 
 		 715 aa  131  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1923  exoribonuclease II  29.48 
 
 		 644 aa  132  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0111084  hitchhiker  0.000000000153264 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  27.02 
 
 		 766 aa  132  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2360  exoribonuclease II  29.48 
 
 		 644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1399  exoribonuclease II  29.48 
 
 		 644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0060132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1491  exoribonuclease II  29.48 
 
 		 644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0726624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2339  exoribonuclease II  29.48 
 
 		 644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185583 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  26.97 
 
 		 810 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  28.09 
 
 		 794 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  28.23 
 
 		 758 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  25.66 
 
 		 581 aa  130  6e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  26.48 
 
 		 791 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  25.37 
 
 		 705 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01263  exoribonuclease II  29.24 
 
 		 644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01274  hypothetical protein  29.24 
 
 		 644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  26.44 
 
 		 716 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  27.62 
 
 		 714 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0215  ribonuclease II  23.82 
 
 		 676 aa  128  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.35 
 
 		 670 aa  128  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  29.95 
 
 		 762 aa  127  7e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  27.72 
 
 		 759 aa  126  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2244  exoribonuclease II  30.14 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.469162  normal  0.153134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  27.34 
 
 		 1182 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  29.48 
 
 		 792 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  26.9 
 
 		 704 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  27.03 
 
 		 814 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2016  exoribonuclease II  30.14 
 
 		 644 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  26.65 
 
 		 792 aa  126  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  27.52 
 
 		 806 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  27.32 
 
 		 788 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3909  ribonuclease II  25.44 
 
 		 637 aa  124  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1089  ribonuclease II  28.32 
 
 		 691 aa  125  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  27.3 
 
 		 770 aa  124  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  27.52 
 
 		 808 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.55 
 
 		 619 aa  124  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  27.52 
 
 		 808 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  26.53 
 
 		 801 aa  124  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4011  exoribonuclease II  27.03 
 
 		 490 aa  124  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>