More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0933 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  88.32 
 
 		 394 aa  695    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  88.58 
 
 		 394 aa  702    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  100 
 
 		 394 aa  783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  65.48 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  31.54 
 
 		 676 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  31.97 
 
 		 683 aa  226  8e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  29.48 
 
 		 674 aa  215  9e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  29.24 
 
 		 671 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  34.68 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  35.55 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  34.78 
 
 		 427 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  28.75 
 
 		 683 aa  190  4e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  28.1 
 
 		 686 aa  186  8e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  32.47 
 
 		 676 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  31.82 
 
 		 671 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  28.03 
 
 		 670 aa  179  9e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  31.53 
 
 		 671 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  27.94 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  32.98 
 
 		 674 aa  173  3.9999999999999995e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  29.73 
 
 		 659 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  29.15 
 
 		 666 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  29.05 
 
 		 623 aa  118  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  26.28 
 
 		 602 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  28.77 
 
 		 680 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  25.96 
 
 		 645 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  27.69 
 
 		 667 aa  103  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  27.96 
 
 		 716 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  30.4 
 
 		 704 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  24.77 
 
 		 777 aa  101  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  25.62 
 
 		 718 aa  99.8  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  27.36 
 
 		 709 aa  98.6  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  27.62 
 
 		 751 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  25.31 
 
 		 774 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  27.35 
 
 		 751 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2180  exoribonuclease II  24.04 
 
 		 644 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801772 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  23.08 
 
 		 692 aa  94  4e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  25.07 
 
 		 817 aa  93.6  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  26.77 
 
 		 824 aa  93.6  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  24.46 
 
 		 763 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  29.18 
 
 		 581 aa  93.2  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  27.69 
 
 		 788 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  25.55 
 
 		 807 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  27.64 
 
 		 708 aa  92.4  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  25.23 
 
 		 736 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  24.92 
 
 		 808 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  25.23 
 
 		 749 aa  91.7  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  25.31 
 
 		 821 aa  92  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  25.55 
 
 		 807 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0215  ribonuclease II  25.57 
 
 		 676 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  25.55 
 
 		 807 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  25.55 
 
 		 807 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  24.7 
 
 		 791 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  25.7 
 
 		 680 aa  90.5  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  25.23 
 
 		 807 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  26.87 
 
 		 710 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  26.87 
 
 		 710 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  25 
 
 		 810 aa  90.5  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  25.39 
 
 		 819 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  25.16 
 
 		 824 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  24.07 
 
 		 844 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  22.84 
 
 		 759 aa  90.1  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  24.07 
 
 		 844 aa  90.1  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  24.07 
 
 		 844 aa  90.1  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  24.84 
 
 		 813 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  24.84 
 
 		 813 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  25.08 
 
 		 830 aa  89.7  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  24.84 
 
 		 813 aa  89.7  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  25.62 
 
 		 808 aa  89.7  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  25.08 
 
 		 808 aa  89.7  7e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  25.08 
 
 		 808 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  24.84 
 
 		 813 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  24.92 
 
 		 809 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  24.84 
 
 		 813 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  24.84 
 
 		 813 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  24.77 
 
 		 813 aa  89.4  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  23.64 
 
 		 762 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  24.84 
 
 		 813 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  24.84 
 
 		 813 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  27.61 
 
 		 619 aa  88.6  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  24.53 
 
 		 812 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2244  exoribonuclease II  22.98 
 
 		 644 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.469162  normal  0.153134 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  24.53 
 
 		 812 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  27.69 
 
 		 757 aa  88.6  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  21.41 
 
 		 907 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  24.01 
 
 		 819 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1904  exoribonuclease II  22.98 
 
 		 644 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.629828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  27.22 
 
 		 695 aa  87.8  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2016  exoribonuclease II  22.98 
 
 		 644 aa  87.8  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  27.16 
 
 		 706 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  26.23 
 
 		 705 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  21.91 
 
 		 726 aa  87.8  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  24.64 
 
 		 689 aa  87.4  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  22.71 
 
 		 806 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  23.44 
 
 		 805 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  24.55 
 
 		 715 aa  86.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  25.6 
 
 		 801 aa  86.7  7e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  24.22 
 
 		 812 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  24.22 
 
 		 812 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  24.22 
 
 		 812 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  24.62 
 
 		 833 aa  86.3  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>