More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3367 on replicon NC_014213
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  100 
 
 		 602 aa  1165    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  49.01 
 
 		 469 aa  342  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  34.99 
 
 		 623 aa  333  8e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  32.58 
 
 		 670 aa  223  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  32.28 
 
 		 676 aa  221  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  32.69 
 
 		 674 aa  219  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  31.4 
 
 		 671 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  32.21 
 
 		 671 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  32.04 
 
 		 671 aa  206  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  29.4 
 
 		 686 aa  194  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  28.98 
 
 		 683 aa  187  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  30.03 
 
 		 645 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  34.68 
 
 		 676 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  34.02 
 
 		 674 aa  159  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  34.59 
 
 		 659 aa  157  4e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  28.42 
 
 		 666 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  32.15 
 
 		 683 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  31 
 
 		 680 aa  147  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  24.57 
 
 		 394 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  29.04 
 
 		 427 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0915  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.54 
 
 		 756 aa  133  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  29.93 
 
 		 770 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  28.45 
 
 		 716 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  27.03 
 
 		 722 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  34.4 
 
 		 715 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1129  ribonuclease R  27.59 
 
 		 642 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  30.38 
 
 		 698 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  28 
 
 		 842 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  27.08 
 
 		 701 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  26.35 
 
 		 757 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0037  ribonuclease R  32.85 
 
 		 745 aa  127  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  26.87 
 
 		 394 aa  127  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  26.72 
 
 		 810 aa  125  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  27.95 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  29.49 
 
 		 801 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  25.82 
 
 		 718 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  28.33 
 
 		 394 aa  123  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  30.23 
 
 		 535 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  26.78 
 
 		 716 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  29.46 
 
 		 759 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.17 
 
 		 619 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  28.23 
 
 		 394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  26.79 
 
 		 815 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  27.95 
 
 		 836 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  28.57 
 
 		 842 aa  122  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  26.38 
 
 		 752 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  30.59 
 
 		 746 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  30.59 
 
 		 746 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  26.94 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  28.6 
 
 		 722 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  28.29 
 
 		 758 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  29.22 
 
 		 718 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  25.05 
 
 		 762 aa  120  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  29.77 
 
 		 771 aa  120  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  29.26 
 
 		 770 aa  120  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  30.62 
 
 		 1182 aa  120  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  28.06 
 
 		 838 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  27.71 
 
 		 710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  27.71 
 
 		 710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  28.07 
 
 		 828 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  27.86 
 
 		 714 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  27.21 
 
 		 805 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  26.88 
 
 		 788 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  27.81 
 
 		 737 aa  118  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  27.49 
 
 		 834 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  29.53 
 
 		 906 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3160  ribonuclease R  30.41 
 
 		 701 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  25.96 
 
 		 751 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1983  exoribonuclease II  27.86 
 
 		 744 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0944364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  26.52 
 
 		 705 aa  117  6.9999999999999995e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  26.25 
 
 		 709 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  25.96 
 
 		 751 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  29.38 
 
 		 863 aa  117  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  28.37 
 
 		 750 aa  116  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  29.08 
 
 		 763 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  29.1 
 
 		 818 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  27.64 
 
 		 803 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  29.33 
 
 		 758 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  29.4 
 
 		 706 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  29.53 
 
 		 907 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  27.35 
 
 		 857 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  24.32 
 
 		 708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  28.5 
 
 		 818 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  26.7 
 
 		 801 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  28.53 
 
 		 755 aa  115  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  28.24 
 
 		 819 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  27.07 
 
 		 857 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  30.1 
 
 		 1037 aa  114  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1646  ribonuclease R  30.08 
 
 		 781 aa  114  6e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.353487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  30.6 
 
 		 1055 aa  114  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  27.49 
 
 		 777 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  26.08 
 
 		 749 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  27.07 
 
 		 859 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  25.8 
 
 		 758 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1583  ribonuclease R  30.26 
 
 		 641 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  26.08 
 
 		 736 aa  113  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  28.53 
 
 		 821 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  27.5 
 
 		 861 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  29.31 
 
 		 833 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  26.8 
 
 		 857 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>