More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1583 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1368  RNB-like protein  64.74 
 
 		 644 aa  795    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.346055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0734  RNB-like protein  64.9 
 
 		 644 aa  794    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1583  ribonuclease R  100 
 
 		 641 aa  1296    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0659  RNB-like protein  64.9 
 
 		 644 aa  795    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.635937  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0372  ribonuclease R  65.2 
 
 		 641 aa  833    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0949  ribonuclease R  64.12 
 
 		 646 aa  810    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0865  Exoribonuclease II  51.93 
 
 		 648 aa  640    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1129  ribonuclease R  66.61 
 
 		 642 aa  858    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2000  hypothetical protein  83.54 
 
 		 639 aa  1072    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0543  exoribonuclease II  45.08 
 
 		 649 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  31.74 
 
 		 906 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  31.67 
 
 		 907 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  32.32 
 
 		 709 aa  263  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  31.63 
 
 		 749 aa  255  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  31.63 
 
 		 736 aa  255  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  31.41 
 
 		 805 aa  251  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  29.66 
 
 		 861 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  28.51 
 
 		 758 aa  252  2e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  30.83 
 
 		 937 aa  251  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  30.86 
 
 		 733 aa  250  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4951  ribonuclease R  33.6 
 
 		 865 aa  249  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408138 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  31.58 
 
 		 794 aa  249  9e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  29.63 
 
 		 877 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  31.98 
 
 		 1055 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  31.13 
 
 		 726 aa  248  3e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  29.24 
 
 		 857 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  30.96 
 
 		 726 aa  247  4.9999999999999997e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  28.48 
 
 		 805 aa  246  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  29.01 
 
 		 877 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.95 
 
 		 791 aa  246  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  29.48 
 
 		 876 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  29.08 
 
 		 857 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  28.99 
 
 		 840 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  31.65 
 
 		 833 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3785  ribonuclease R  31.3 
 
 		 748 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  29.24 
 
 		 857 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  28.85 
 
 		 828 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30 
 
 		 813 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  30.28 
 
 		 755 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  31.78 
 
 		 870 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  29.76 
 
 		 810 aa  244  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  31.33 
 
 		 833 aa  244  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4617  ribonuclease R  31.33 
 
 		 826 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  30 
 
 		 813 aa  243  6e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  30 
 
 		 813 aa  243  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  30 
 
 		 813 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  30 
 
 		 813 aa  243  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  30 
 
 		 813 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  30 
 
 		 813 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  31.59 
 
 		 812 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  30 
 
 		 813 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  30 
 
 		 813 aa  243  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  28.96 
 
 		 834 aa  243  7.999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  31.59 
 
 		 896 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  31.59 
 
 		 886 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  31.59 
 
 		 896 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  31.78 
 
 		 895 aa  242  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  31.59 
 
 		 838 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  31.59 
 
 		 838 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  31.59 
 
 		 838 aa  243  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  30.08 
 
 		 819 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  28.64 
 
 		 859 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  29.13 
 
 		 817 aa  241  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  32.12 
 
 		 876 aa  241  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  31.08 
 
 		 827 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  30.59 
 
 		 864 aa  241  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  31.08 
 
 		 827 aa  241  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  31.08 
 
 		 827 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  29.03 
 
 		 807 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  28.92 
 
 		 830 aa  240  6.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  28.93 
 
 		 826 aa  239  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  28.93 
 
 		 833 aa  239  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  31.08 
 
 		 828 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  29.11 
 
 		 871 aa  239  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  34.39 
 
 		 722 aa  239  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2438  ribonuclease R  32.47 
 
 		 719 aa  239  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  29.35 
 
 		 808 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  34.52 
 
 		 771 aa  238  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  29.35 
 
 		 808 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  29.35 
 
 		 808 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  30.55 
 
 		 770 aa  238  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  35.19 
 
 		 757 aa  238  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  30.51 
 
 		 812 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  29.82 
 
 		 829 aa  238  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  31.63 
 
 		 758 aa  237  4e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  31.66 
 
 		 818 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  30.51 
 
 		 812 aa  237  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  34.52 
 
 		 770 aa  237  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  30.68 
 
 		 848 aa  237  6e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  28.64 
 
 		 807 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  28.64 
 
 		 807 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  28.64 
 
 		 807 aa  236  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1697  ribonuclease R  30.87 
 
 		 817 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892677 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  35.34 
 
 		 716 aa  236  8e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.71 
 
 		 735 aa  236  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  30.51 
 
 		 812 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  29.76 
 
 		 752 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  30.51 
 
 		 812 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  30.5 
 
 		 817 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  30.51 
 
 		 812 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>