More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1129 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1583  ribonuclease R  66.61 
 
 		 641 aa  847    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0734  RNB-like protein  60.47 
 
 		 644 aa  747    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2000  hypothetical protein  64.95 
 
 		 639 aa  819    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0949  ribonuclease R  59.25 
 
 		 646 aa  754    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0865  Exoribonuclease II  52.47 
 
 		 648 aa  670    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1368  RNB-like protein  60.62 
 
 		 644 aa  748    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.346055  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0659  RNB-like protein  60.31 
 
 		 644 aa  748    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.635937  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1129  ribonuclease R  100 
 
 		 642 aa  1310    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0372  ribonuclease R  61.99 
 
 		 641 aa  799    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0543  exoribonuclease II  45.6 
 
 		 649 aa  521  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  30.73 
 
 		 736 aa  251  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  30.73 
 
 		 749 aa  251  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  32.15 
 
 		 709 aa  240  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  29.79 
 
 		 810 aa  239  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  29.25 
 
 		 907 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  28.92 
 
 		 906 aa  236  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4951  ribonuclease R  35.73 
 
 		 865 aa  234  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  32.07 
 
 		 752 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  27.99 
 
 		 861 aa  234  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  30.56 
 
 		 937 aa  233  7.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  29.12 
 
 		 805 aa  233  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  28.11 
 
 		 857 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  28.32 
 
 		 857 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  27.99 
 
 		 859 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  28.11 
 
 		 857 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  31.84 
 
 		 714 aa  231  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  28.15 
 
 		 758 aa  230  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  30.2 
 
 		 726 aa  230  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  31.06 
 
 		 788 aa  230  8e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  29.87 
 
 		 726 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  32.57 
 
 		 722 aa  229  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  31.18 
 
 		 706 aa  229  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  32.42 
 
 		 695 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  29.6 
 
 		 813 aa  228  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  29.6 
 
 		 813 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  28.32 
 
 		 828 aa  228  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  29.6 
 
 		 813 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  29.6 
 
 		 813 aa  227  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  29.6 
 
 		 813 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  29.6 
 
 		 813 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  29.6 
 
 		 813 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  29.6 
 
 		 813 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.6 
 
 		 813 aa  227  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  29.26 
 
 		 819 aa  226  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  32.25 
 
 		 757 aa  226  9e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  28.14 
 
 		 877 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  27.91 
 
 		 877 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  29.29 
 
 		 817 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  29.42 
 
 		 824 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  29.74 
 
 		 838 aa  223  6e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1240  ribonuclease R  34.11 
 
 		 764 aa  223  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  28.76 
 
 		 833 aa  223  7e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  29.66 
 
 		 795 aa  223  8e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  28.64 
 
 		 801 aa  223  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2568  ribonuclease R  34.11 
 
 		 764 aa  223  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0166651 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  29.31 
 
 		 870 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  27.84 
 
 		 876 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  29.38 
 
 		 722 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  29.74 
 
 		 720 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  29.89 
 
 		 876 aa  222  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.25 
 
 		 791 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  30.41 
 
 		 828 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  29.65 
 
 		 794 aa  221  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  31.51 
 
 		 770 aa  221  3e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  30.02 
 
 		 1055 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  30.29 
 
 		 808 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  30.2 
 
 		 758 aa  220  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  32.78 
 
 		 716 aa  220  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  30.12 
 
 		 791 aa  220  6e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  28.74 
 
 		 812 aa  220  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  32.58 
 
 		 836 aa  220  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  31.36 
 
 		 763 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  30.67 
 
 		 751 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  31.56 
 
 		 910 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  29.57 
 
 		 833 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  31.85 
 
 		 834 aa  219  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  29.28 
 
 		 824 aa  219  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  30.04 
 
 		 817 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  30.22 
 
 		 827 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  30.93 
 
 		 821 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  30.22 
 
 		 827 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  30.04 
 
 		 817 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  30.22 
 
 		 827 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1686  ribonuclease R  30.6 
 
 		 818 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.133651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  28.66 
 
 		 755 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  27.98 
 
 		 842 aa  218  2e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  30.5 
 
 		 746 aa  219  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  30.5 
 
 		 746 aa  219  2e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  29.91 
 
 		 818 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.13 
 
 		 833 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  29.34 
 
 		 829 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  28.74 
 
 		 812 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  29.77 
 
 		 762 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  28.74 
 
 		 812 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  30.07 
 
 		 819 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.41 
 
 		 735 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  31.95 
 
 		 858 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  28.74 
 
 		 812 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  33.04 
 
 		 710 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  28.74 
 
 		 812 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>