More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0734 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1583  ribonuclease R  64.9 
 
 		 641 aa  791    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1368  RNB-like protein  96.12 
 
 		 644 aa  1242    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.346055  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0734  RNB-like protein  100 
 
 		 644 aa  1301    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0865  Exoribonuclease II  53.41 
 
 		 648 aa  653    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0949  ribonuclease R  72.78 
 
 		 646 aa  937    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0372  ribonuclease R  56.74 
 
 		 641 aa  704    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0659  RNB-like protein  97.67 
 
 		 644 aa  1254    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.635937  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2000  hypothetical protein  65.52 
 
 		 639 aa  802    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1129  ribonuclease R  60.47 
 
 		 642 aa  760    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0543  exoribonuclease II  44.85 
 
 		 649 aa  521  1e-146  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  31.4 
 
 		 805 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  31.23 
 
 		 749 aa  244  1.9999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  31.23 
 
 		 736 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  28.44 
 
 		 752 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  29.93 
 
 		 861 aa  243  7e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4951  ribonuclease R  32.6 
 
 		 865 aa  243  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  30.38 
 
 		 937 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  30.69 
 
 		 810 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2568  ribonuclease R  30.84 
 
 		 764 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0166651 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1240  ribonuclease R  30.84 
 
 		 764 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  29.39 
 
 		 795 aa  240  6.999999999999999e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  28.41 
 
 		 758 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  32.22 
 
 		 733 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  29.17 
 
 		 828 aa  238  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  32.96 
 
 		 833 aa  238  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  29.83 
 
 		 710 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  28.64 
 
 		 746 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  30.68 
 
 		 813 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  28.64 
 
 		 746 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  30.68 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.68 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  30.68 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  30.68 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  30.02 
 
 		 726 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  30.68 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  30.68 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  30.68 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  30.68 
 
 		 813 aa  235  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  29.68 
 
 		 710 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  29.84 
 
 		 726 aa  234  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  30.05 
 
 		 819 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  31.12 
 
 		 826 aa  233  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  28.36 
 
 		 877 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  30.09 
 
 		 840 aa  233  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3785  ribonuclease R  30.27 
 
 		 748 aa  233  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  29.46 
 
 		 818 aa  233  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  32.44 
 
 		 821 aa  232  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  31.24 
 
 		 857 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.96 
 
 		 877 aa  232  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  29.6 
 
 		 737 aa  232  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  31.24 
 
 		 859 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  33.78 
 
 		 834 aa  232  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  29.5 
 
 		 794 aa  231  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  29.33 
 
 		 906 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  29.64 
 
 		 907 aa  231  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  30.44 
 
 		 863 aa  231  5e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  31.03 
 
 		 857 aa  230  6e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  30.76 
 
 		 1055 aa  230  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  33.11 
 
 		 836 aa  229  9e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  31.03 
 
 		 857 aa  229  9e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  29.77 
 
 		 812 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2988  ribonuclease R  30.91 
 
 		 771 aa  229  1e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216479 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.3 
 
 		 791 aa  228  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  30.44 
 
 		 720 aa  228  3e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  29.78 
 
 		 812 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2700  ribonuclease R  27.89 
 
 		 796 aa  228  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.749256  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2438  ribonuclease R  29.93 
 
 		 719 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  30.54 
 
 		 876 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  29.26 
 
 		 770 aa  227  4e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  30.59 
 
 		 755 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  29.78 
 
 		 812 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  29.78 
 
 		 812 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  29.78 
 
 		 812 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1976  ribonuclease R  30.99 
 
 		 746 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00374672  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1425  ribonuclease R  30.33 
 
 		 752 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  29.55 
 
 		 876 aa  226  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  28.46 
 
 		 770 aa  226  1e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  29.44 
 
 		 766 aa  226  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  29.1 
 
 		 771 aa  226  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  30.09 
 
 		 870 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  32.88 
 
 		 838 aa  226  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  29.92 
 
 		 751 aa  226  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  29.48 
 
 		 795 aa  225  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  31.57 
 
 		 824 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  33.49 
 
 		 834 aa  224  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  29.77 
 
 		 833 aa  223  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  32.75 
 
 		 808 aa  223  7e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  32.74 
 
 		 830 aa  223  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  30.68 
 
 		 871 aa  223  9e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  29.77 
 
 		 817 aa  223  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  29.26 
 
 		 714 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  30.82 
 
 		 694 aa  223  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  32.3 
 
 		 757 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.34 
 
 		 833 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  29.77 
 
 		 819 aa  223  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1271  ribonuclease R  31.88 
 
 		 795 aa  222  1.9999999999999999e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30.91 
 
 		 805 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  29.98 
 
 		 828 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  29.57 
 
 		 822 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  31.89 
 
 		 842 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>