More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1124 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  58.69 
 
 		 671 aa  791    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  56.58 
 
 		 671 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  56.73 
 
 		 671 aa  707    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  56.19 
 
 		 686 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  56.34 
 
 		 683 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  100 
 
 		 670 aa  1353    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  56.28 
 
 		 676 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  54.49 
 
 		 674 aa  720    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  35.19 
 
 		 645 aa  355  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  36.76 
 
 		 674 aa  341  2.9999999999999998e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  32.95 
 
 		 676 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  33.48 
 
 		 683 aa  315  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  28.88 
 
 		 666 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  32.06 
 
 		 680 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  33.57 
 
 		 427 aa  223  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  30.02 
 
 		 424 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  32.58 
 
 		 602 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  31.34 
 
 		 659 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  29.1 
 
 		 424 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  33.33 
 
 		 813 aa  208  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  29.29 
 
 		 623 aa  205  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  26.52 
 
 		 394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  27.78 
 
 		 394 aa  194  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  28.03 
 
 		 394 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  33.92 
 
 		 469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  28.03 
 
 		 394 aa  189  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  28.92 
 
 		 718 aa  156  1e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  28.94 
 
 		 680 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  27.39 
 
 		 692 aa  151  5e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  28.39 
 
 		 710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  29.06 
 
 		 762 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  29.09 
 
 		 709 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  28.39 
 
 		 710 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  26.6 
 
 		 705 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  31.22 
 
 		 735 aa  147  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  30.4 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  29.94 
 
 		 671 aa  144  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  26.26 
 
 		 689 aa  144  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  27.91 
 
 		 751 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  29.92 
 
 		 763 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  25.06 
 
 		 665 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  28.93 
 
 		 704 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  30.82 
 
 		 678 aa  142  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  28.12 
 
 		 774 aa  141  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  31.52 
 
 		 757 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  27.65 
 
 		 751 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  27.64 
 
 		 758 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  24.14 
 
 		 709 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  29.89 
 
 		 766 aa  139  2e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  28.95 
 
 		 863 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  27.51 
 
 		 794 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  28.53 
 
 		 667 aa  138  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  27.57 
 
 		 770 aa  138  4e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  28.81 
 
 		 706 aa  138  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  27.73 
 
 		 667 aa  138  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  29.98 
 
 		 706 aa  137  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  25.49 
 
 		 808 aa  137  9e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  25.49 
 
 		 808 aa  137  9e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  27.95 
 
 		 788 aa  137  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  25.49 
 
 		 804 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  25.49 
 
 		 810 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  25.49 
 
 		 806 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  25.49 
 
 		 808 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  26.98 
 
 		 716 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  25.49 
 
 		 812 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  25.73 
 
 		 806 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  30.69 
 
 		 751 aa  136  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  26.1 
 
 		 814 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  25.67 
 
 		 792 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  28.04 
 
 		 716 aa  134  5e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  25.67 
 
 		 806 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  26.58 
 
 		 722 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  24.5 
 
 		 694 aa  134  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  25.15 
 
 		 702 aa  132  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1225  exoribonuclease II  31.18 
 
 		 646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  26.73 
 
 		 770 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  27.08 
 
 		 581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1089  ribonuclease II  27.9 
 
 		 691 aa  132  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  23.7 
 
 		 619 aa  132  3e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  27.03 
 
 		 705 aa  130  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  27.21 
 
 		 859 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  27.82 
 
 		 759 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  31.18 
 
 		 535 aa  130  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  25.94 
 
 		 791 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  26.98 
 
 		 857 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  29.77 
 
 		 646 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  27.2 
 
 		 801 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  27.05 
 
 		 771 aa  128  3e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  25.51 
 
 		 708 aa  128  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  27.27 
 
 		 910 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  27.63 
 
 		 737 aa  128  4.0000000000000003e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  26.74 
 
 		 857 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  27.05 
 
 		 770 aa  127  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2195  ribonuclease II  27.13 
 
 		 702 aa  127  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  24.88 
 
 		 726 aa  127  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  26.74 
 
 		 857 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  28.16 
 
 		 1182 aa  127  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  23.71 
 
 		 810 aa  126  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  24.42 
 
 		 792 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  26.11 
 
 		 817 aa  126  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>