More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1336 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  60.09 
 
 		 674 aa  794    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  100 
 
 		 676 aa  1333    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  47.94 
 
 		 683 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  36.8 
 
 		 671 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  35.18 
 
 		 674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  33.53 
 
 		 670 aa  314  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  38.26 
 
 		 686 aa  294  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  33.12 
 
 		 671 aa  274  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  33.12 
 
 		 671 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  39.65 
 
 		 676 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  34.9 
 
 		 683 aa  272  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  34.34 
 
 		 427 aa  255  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  38.01 
 
 		 645 aa  254  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  30.23 
 
 		 394 aa  248  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  31.95 
 
 		 424 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  32.21 
 
 		 424 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  31 
 
 		 394 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  31 
 
 		 394 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  31.54 
 
 		 394 aa  232  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  36.83 
 
 		 659 aa  196  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  34.62 
 
 		 666 aa  178  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  33.51 
 
 		 469 aa  160  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  31.27 
 
 		 623 aa  154  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  34.68 
 
 		 602 aa  153  8e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  31.28 
 
 		 680 aa  153  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  27.05 
 
 		 766 aa  141  3e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  28.75 
 
 		 581 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  29.3 
 
 		 716 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  25.31 
 
 		 705 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  28.47 
 
 		 770 aa  137  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  31.9 
 
 		 689 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  25.46 
 
 		 810 aa  136  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  25.71 
 
 		 737 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  28.29 
 
 		 704 aa  135  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.06 
 
 		 665 aa  135  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  28 
 
 		 806 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  26.24 
 
 		 817 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  27.73 
 
 		 762 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  29.04 
 
 		 777 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  28.6 
 
 		 709 aa  132  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  27.78 
 
 		 806 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  27.78 
 
 		 810 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  26.02 
 
 		 710 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  27.78 
 
 		 808 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  28.94 
 
 		 705 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  27.6 
 
 		 795 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  26.79 
 
 		 791 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  26.02 
 
 		 710 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  27.78 
 
 		 812 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  27.78 
 
 		 804 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  27.56 
 
 		 808 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  24.4 
 
 		 801 aa  129  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  27.56 
 
 		 808 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  29.59 
 
 		 750 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  27.54 
 
 		 702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  27.13 
 
 		 751 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  27.65 
 
 		 806 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  28.39 
 
 		 680 aa  128  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  28.12 
 
 		 667 aa  128  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  27.8 
 
 		 814 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  26.67 
 
 		 751 aa  128  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  27.6 
 
 		 709 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0179  ribonuclease II  27.93 
 
 		 698 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  30.59 
 
 		 813 aa  127  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  28.36 
 
 		 735 aa  127  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  29.22 
 
 		 794 aa  127  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  29.13 
 
 		 792 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  27.4 
 
 		 716 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  27.4 
 
 		 698 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.85 
 
 		 619 aa  125  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  28.73 
 
 		 825 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  29.4 
 
 		 813 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  30.25 
 
 		 791 aa  124  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  30.14 
 
 		 646 aa  124  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1743  exoribonuclease II  32.16 
 
 		 643 aa  124  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  27.68 
 
 		 692 aa  124  7e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  27.75 
 
 		 1182 aa  124  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2638  exoribonuclease II  31.11 
 
 		 644 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.76344  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1710  exoribonuclease II  31.58 
 
 		 657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128406  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  28.88 
 
 		 842 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  26.75 
 
 		 762 aa  122  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  26.14 
 
 		 718 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  27.5 
 
 		 758 aa  121  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  26.92 
 
 		 656 aa  121  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  27.07 
 
 		 790 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  27.07 
 
 		 790 aa  120  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  28.05 
 
 		 801 aa  120  9e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  26.5 
 
 		 857 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  26.31 
 
 		 857 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  30.25 
 
 		 766 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  29.51 
 
 		 774 aa  120  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  26.16 
 
 		 857 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  28 
 
 		 757 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  29.34 
 
 		 861 aa  119  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  26.76 
 
 		 671 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  26.86 
 
 		 792 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  25.99 
 
 		 722 aa  118  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  26.72 
 
 		 735 aa  117  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1904  exoribonuclease II  30.03 
 
 		 644 aa  117  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.629828  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  28.31 
 
 		 751 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>