More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1009 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  100 
 
 		 581 aa  1158    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  41.75 
 
 		 665 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  35.81 
 
 		 751 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  35.81 
 
 		 751 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  36.87 
 
 		 757 aa  286  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  37.32 
 
 		 708 aa  281  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  36.57 
 
 		 706 aa  280  7e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  34 
 
 		 788 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  32.78 
 
 		 762 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  33.4 
 
 		 763 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  33.87 
 
 		 715 aa  273  9e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  33.68 
 
 		 716 aa  272  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  32.23 
 
 		 763 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  33.46 
 
 		 795 aa  270  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  35.27 
 
 		 716 aa  270  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  33.53 
 
 		 792 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  30.49 
 
 		 806 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  32.26 
 
 		 706 aa  266  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  30.71 
 
 		 808 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  30.71 
 
 		 804 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  30.71 
 
 		 808 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  31.11 
 
 		 814 aa  266  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  30.71 
 
 		 806 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  30.71 
 
 		 806 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  30.71 
 
 		 810 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  30.71 
 
 		 812 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  30.71 
 
 		 808 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  31.73 
 
 		 758 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  30.3 
 
 		 792 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  31.79 
 
 		 759 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  34.33 
 
 		 770 aa  261  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  31.05 
 
 		 709 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  33.07 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  33.07 
 
 		 790 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  33.12 
 
 		 709 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  31.36 
 
 		 801 aa  257  3e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  33.67 
 
 		 794 aa  257  3e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  31.61 
 
 		 795 aa  254  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  30.27 
 
 		 817 aa  254  3e-66  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  33.27 
 
 		 791 aa  252  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  35.25 
 
 		 694 aa  252  2e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  31.99 
 
 		 903 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  32.2 
 
 		 705 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  31.66 
 
 		 777 aa  250  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  32.47 
 
 		 770 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  31.87 
 
 		 737 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  34.06 
 
 		 701 aa  248  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  31.83 
 
 		 833 aa  247  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  32.32 
 
 		 770 aa  248  3e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  32.65 
 
 		 818 aa  247  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.21 
 
 		 791 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  30.52 
 
 		 819 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  30.34 
 
 		 810 aa  246  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  29.4 
 
 		 742 aa  246  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.95 
 
 		 670 aa  245  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  30.8 
 
 		 824 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  30.43 
 
 		 752 aa  244  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  32.06 
 
 		 770 aa  244  3e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  32.06 
 
 		 771 aa  244  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  33.05 
 
 		 758 aa  243  5e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  31.4 
 
 		 801 aa  243  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  31.67 
 
 		 840 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  32.05 
 
 		 726 aa  243  7.999999999999999e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  31.14 
 
 		 702 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  30.54 
 
 		 858 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  30.95 
 
 		 726 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  30.81 
 
 		 737 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  30.8 
 
 		 826 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  32 
 
 		 667 aa  241  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  30.63 
 
 		 705 aa  240  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  30.53 
 
 		 750 aa  240  5e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  33.55 
 
 		 762 aa  240  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  33.2 
 
 		 722 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  30.6 
 
 		 857 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  32.08 
 
 		 751 aa  238  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  31.32 
 
 		 829 aa  237  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  31.09 
 
 		 735 aa  237  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  33.19 
 
 		 718 aa  236  6e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  32.35 
 
 		 810 aa  236  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  30.14 
 
 		 808 aa  236  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  31.79 
 
 		 838 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  30.77 
 
 		 910 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  29.94 
 
 		 807 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  29.79 
 
 		 906 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  31.79 
 
 		 836 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  29.84 
 
 		 907 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  30.39 
 
 		 857 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  29.74 
 
 		 807 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  29.74 
 
 		 807 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  29.74 
 
 		 807 aa  233  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  29.54 
 
 		 861 aa  233  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  29.83 
 
 		 720 aa  233  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  29.54 
 
 		 808 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  29.54 
 
 		 808 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  28.79 
 
 		 828 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  31.7 
 
 		 795 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  29.54 
 
 		 807 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  30.55 
 
 		 842 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  30.52 
 
 		 817 aa  231  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  30.85 
 
 		 805 aa  231  3e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>