More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1526 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  94.93 
 
 		 857 aa  1434    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  94 
 
 		 858 aa  1442    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  100 
 
 		 857 aa  1669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  72.6 
 
 		 910 aa  1063    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  40.47 
 
 		 763 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  41.41 
 
 		 763 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  41.79 
 
 		 752 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  44.82 
 
 		 737 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  44.17 
 
 		 737 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  40.77 
 
 		 777 aa  468  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  39.97 
 
 		 759 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  41.72 
 
 		 758 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  40.13 
 
 		 720 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  39.04 
 
 		 762 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  37.2 
 
 		 792 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  41.47 
 
 		 840 aa  446  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  42.26 
 
 		 803 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  39.62 
 
 		 870 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  38 
 
 		 828 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  36.66 
 
 		 790 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  36.66 
 
 		 790 aa  434  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  40.59 
 
 		 876 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  38.1 
 
 		 804 aa  435  1e-120  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4951  ribonuclease R  40.27 
 
 		 865 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408138 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  41.32 
 
 		 871 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  37.7 
 
 		 806 aa  430  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  41.06 
 
 		 861 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  39.28 
 
 		 906 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  37.22 
 
 		 812 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  39.14 
 
 		 907 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  41.49 
 
 		 1055 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  42.96 
 
 		 715 aa  428  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  37.7 
 
 		 806 aa  428  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  37.55 
 
 		 808 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  37.55 
 
 		 804 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  37.7 
 
 		 810 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2568  ribonuclease R  39.18 
 
 		 764 aa  427  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0166651 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  40.33 
 
 		 706 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  37.55 
 
 		 808 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  37.55 
 
 		 808 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  37.7 
 
 		 806 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  38.09 
 
 		 814 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  36.55 
 
 		 833 aa  429  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  36.92 
 
 		 824 aa  429  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  38.25 
 
 		 751 aa  426  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1240  ribonuclease R  39.12 
 
 		 764 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  37.7 
 
 		 792 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2988  ribonuclease R  38.79 
 
 		 771 aa  427  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216479 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  37.17 
 
 		 857 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  38.2 
 
 		 805 aa  423  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  40.78 
 
 		 758 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  37.98 
 
 		 876 aa  426  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  36.79 
 
 		 818 aa  424  1e-117  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  37.53 
 
 		 857 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  40.95 
 
 		 848 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  40.52 
 
 		 810 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  38.1 
 
 		 751 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  37.5 
 
 		 774 aa  426  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4617  ribonuclease R  40.67 
 
 		 826 aa  422  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  37.19 
 
 		 857 aa  422  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  40.5 
 
 		 864 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  40.15 
 
 		 805 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  35.66 
 
 		 817 aa  421  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  41.32 
 
 		 819 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  35.47 
 
 		 722 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  40.06 
 
 		 812 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1976  ribonuclease R  37.7 
 
 		 746 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00374672  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  37.4 
 
 		 834 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  37.4 
 
 		 819 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  39.91 
 
 		 812 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  38.62 
 
 		 788 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  39.91 
 
 		 812 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  38.28 
 
 		 826 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  36.52 
 
 		 819 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  35.81 
 
 		 808 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  35.81 
 
 		 808 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  38.08 
 
 		 829 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  40.06 
 
 		 812 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  39.91 
 
 		 812 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  40.21 
 
 		 813 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  40.12 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  36.35 
 
 		 859 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  40.12 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  37.61 
 
 		 808 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  38.54 
 
 		 877 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  36.65 
 
 		 877 aa  416  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  40.12 
 
 		 844 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  38.15 
 
 		 818 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1425  ribonuclease R  39.12 
 
 		 752 aa  416  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1707  ribonuclease R  39.49 
 
 		 833 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  36.08 
 
 		 937 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  39.64 
 
 		 833 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  36.69 
 
 		 817 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  38.41 
 
 		 801 aa  416  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  40.21 
 
 		 813 aa  413  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  35.81 
 
 		 809 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  40.12 
 
 		 896 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  40.12 
 
 		 896 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  40.21 
 
 		 813 aa  412  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  40.12 
 
 		 838 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>