More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0901 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  62.05 
 
 		 671 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  60.27 
 
 		 686 aa  831    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  58.69 
 
 		 670 aa  777    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  62.05 
 
 		 671 aa  799    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  100 
 
 		 671 aa  1373    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  61.86 
 
 		 674 aa  843    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  60.84 
 
 		 676 aa  768    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  61.45 
 
 		 683 aa  822    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  37.08 
 
 		 645 aa  386  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  32.89 
 
 		 683 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  40.73 
 
 		 676 aa  320  7.999999999999999e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  34.88 
 
 		 674 aa  317  3e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  30.62 
 
 		 666 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  32.94 
 
 		 659 aa  236  9e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  31.32 
 
 		 680 aa  232  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  31.8 
 
 		 427 aa  226  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  29.05 
 
 		 394 aa  221  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  28.15 
 
 		 623 aa  217  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  33.68 
 
 		 813 aa  216  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  29.5 
 
 		 394 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  29.24 
 
 		 394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  31.4 
 
 		 602 aa  211  5e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  29.5 
 
 		 394 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  28.93 
 
 		 424 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  28.93 
 
 		 424 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  32.67 
 
 		 469 aa  189  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  30.08 
 
 		 718 aa  150  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  30.71 
 
 		 706 aa  148  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  28.75 
 
 		 692 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  29.86 
 
 		 770 aa  146  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  31.94 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  28.32 
 
 		 751 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  26.15 
 
 		 698 aa  144  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  28.06 
 
 		 751 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  28.3 
 
 		 813 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  30.75 
 
 		 757 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  31.84 
 
 		 706 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  28.06 
 
 		 689 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  28.27 
 
 		 709 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  25.52 
 
 		 619 aa  139  1e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  30.41 
 
 		 704 aa  139  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  26.68 
 
 		 680 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  31.34 
 
 		 678 aa  137  9e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  32.24 
 
 		 710 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  31.86 
 
 		 710 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  26.24 
 
 		 709 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  28.93 
 
 		 766 aa  135  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  29.97 
 
 		 671 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  31.32 
 
 		 667 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  27.27 
 
 		 716 aa  135  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  30.46 
 
 		 735 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  29.09 
 
 		 763 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  26.22 
 
 		 788 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1520  exoribonuclease II  32.02 
 
 		 644 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  29 
 
 		 762 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  30.59 
 
 		 815 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  28.5 
 
 		 824 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  28.25 
 
 		 774 aa  132  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1923  exoribonuclease II  31.72 
 
 		 644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0111084  hitchhiker  0.000000000153264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1841  exoribonuclease II  31.72 
 
 		 644 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.816503  hitchhiker  0.00000000000000293222 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2360  exoribonuclease II  31.72 
 
 		 644 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00712354  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1491  exoribonuclease II  31.72 
 
 		 644 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0726624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2339  exoribonuclease II  31.72 
 
 		 644 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1399  exoribonuclease II  31.72 
 
 		 644 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0060132  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3056  ribonuclease II  27.14 
 
 		 712 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.235713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  27.4 
 
 		 656 aa  130  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  26.27 
 
 		 750 aa  130  7.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01263  exoribonuclease II  31.07 
 
 		 644 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01274  hypothetical protein  31.07 
 
 		 644 aa  130  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  26.68 
 
 		 833 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  24.05 
 
 		 667 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  26.75 
 
 		 817 aa  128  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  30.35 
 
 		 808 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  26.24 
 
 		 795 aa  128  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  30.2 
 
 		 886 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  26.85 
 
 		 722 aa  128  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  27.04 
 
 		 826 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  29.23 
 
 		 777 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  28.53 
 
 		 863 aa  127  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  30.12 
 
 		 646 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  25.78 
 
 		 716 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.34 
 
 		 665 aa  127  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  27.76 
 
 		 791 aa  127  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2180  exoribonuclease II  29.94 
 
 		 644 aa  127  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3023  ribonuclease II  26.94 
 
 		 698 aa  127  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  25.83 
 
 		 770 aa  127  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1887  exoribonuclease II  30 
 
 		 644 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0154652  hitchhiker  0.00000000880902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1630  exoribonuclease II  30 
 
 		 644 aa  127  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000100585 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1830  exoribonuclease II  30 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.336461  hitchhiker  0.00426066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1448  exoribonuclease II  30 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0894921  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  26.16 
 
 		 814 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  31.87 
 
 		 751 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1943  ribonuclease II  27.94 
 
 		 735 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1825  exoribonuclease II  30.29 
 
 		 644 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.517880000000001e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  26.21 
 
 		 806 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  24.02 
 
 		 763 aa  126  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  26.6 
 
 		 694 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  28.8 
 
 		 859 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  28.65 
 
 		 857 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  29.03 
 
 		 535 aa  126  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>