More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_09491 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  100 
 
 		 394 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  65.48 
 
 		 394 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  65.48 
 
 		 394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  65.74 
 
 		 394 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  30.23 
 
 		 676 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  29.04 
 
 		 683 aa  227  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  29.05 
 
 		 671 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  27.27 
 
 		 674 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  33.79 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  32.92 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  26.58 
 
 		 686 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  26.45 
 
 		 670 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  32.82 
 
 		 424 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  30.17 
 
 		 676 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  27.41 
 
 		 683 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  31.03 
 
 		 671 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  31.03 
 
 		 671 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  28.69 
 
 		 674 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  26.67 
 
 		 469 aa  163  6e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  23.98 
 
 		 602 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  27.65 
 
 		 659 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  29.02 
 
 		 666 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  30.95 
 
 		 623 aa  122  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  27.46 
 
 		 680 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  27.32 
 
 		 762 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  25.65 
 
 		 645 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  27.73 
 
 		 791 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  29.14 
 
 		 706 aa  113  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  25.93 
 
 		 770 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  25.35 
 
 		 795 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  27.96 
 
 		 718 aa  107  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  30.24 
 
 		 694 aa  106  6e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  31.31 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  25.77 
 
 		 794 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  24.93 
 
 		 791 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  25.98 
 
 		 709 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  28.88 
 
 		 708 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  26.46 
 
 		 692 aa  102  1e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  26.54 
 
 		 788 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  25.96 
 
 		 813 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  26.19 
 
 		 810 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  26.01 
 
 		 722 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  26.89 
 
 		 805 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  26.67 
 
 		 716 aa  99  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  28.96 
 
 		 705 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  25.08 
 
 		 777 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0215  ribonuclease II  25.32 
 
 		 676 aa  97.8  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  25.97 
 
 		 751 aa  97.8  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  24.58 
 
 		 795 aa  97.1  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  27.52 
 
 		 736 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.44 
 
 		 665 aa  97.1  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  27.22 
 
 		 749 aa  96.7  6e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  25.37 
 
 		 808 aa  96.3  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  26.75 
 
 		 807 aa  96.3  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  26.75 
 
 		 807 aa  96.3  9e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2180  exoribonuclease II  25 
 
 		 644 aa  96.3  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  26.75 
 
 		 807 aa  95.9  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  26.71 
 
 		 715 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  26.75 
 
 		 807 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  26.04 
 
 		 762 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  26.75 
 
 		 807 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  24.48 
 
 		 806 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  24.18 
 
 		 808 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  25.07 
 
 		 814 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  24.48 
 
 		 806 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  24.18 
 
 		 808 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  26.14 
 
 		 770 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  24.93 
 
 		 750 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  27.61 
 
 		 619 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  25.67 
 
 		 808 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  25.67 
 
 		 808 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  24.48 
 
 		 812 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  24.48 
 
 		 806 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  24.48 
 
 		 804 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  23.49 
 
 		 689 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  24.48 
 
 		 810 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  26.25 
 
 		 857 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  25.15 
 
 		 906 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  26.65 
 
 		 757 aa  94.7  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  26.38 
 
 		 763 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  25.15 
 
 		 907 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  24.48 
 
 		 808 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  25.37 
 
 		 809 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  25.96 
 
 		 819 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  26.17 
 
 		 705 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  25.52 
 
 		 737 aa  94  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  24.69 
 
 		 910 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  25 
 
 		 737 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  26.25 
 
 		 857 aa  94  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1225  exoribonuclease II  23.82 
 
 		 646 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  25.82 
 
 		 709 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09080  VacB/RNase II-like 3'-5' exoribonuclease  24.26 
 
 		 670 aa  93.2  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  25.23 
 
 		 808 aa  93.2  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  25.16 
 
 		 763 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  26.39 
 
 		 857 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1993  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  22.16 
 
 		 701 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13462  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  24.85 
 
 		 801 aa  92.8  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  26.71 
 
 		 751 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  23.66 
 
 		 702 aa  91.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  24.85 
 
 		 759 aa  91.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>