More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_34816 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  100 
 
 		 645 aa  1307    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  37.08 
 
 		 671 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  34.53 
 
 		 686 aa  353  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  35.19 
 
 		 670 aa  352  1e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  35.83 
 
 		 674 aa  333  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  35.77 
 
 		 683 aa  328  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  34.95 
 
 		 671 aa  326  9e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  34.79 
 
 		 671 aa  324  3e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  33.55 
 
 		 676 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  38.01 
 
 		 676 aa  253  7e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  35.79 
 
 		 674 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  34.29 
 
 		 683 aa  224  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  28.65 
 
 		 666 aa  204  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  28.37 
 
 		 424 aa  183  7e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  27.93 
 
 		 424 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  28.4 
 
 		 623 aa  176  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  30.14 
 
 		 659 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  29.44 
 
 		 602 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  28.6 
 
 		 813 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  28.02 
 
 		 680 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  31.82 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  31.18 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  28.76 
 
 		 1182 aa  136  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.57 
 
 		 665 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  28.68 
 
 		 757 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  27.64 
 
 		 716 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  25.22 
 
 		 692 aa  126  1e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  27.6 
 
 		 794 aa  125  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  26.68 
 
 		 718 aa  125  3e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  27.59 
 
 		 788 aa  125  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  25.85 
 
 		 581 aa  124  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  28.32 
 
 		 763 aa  124  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  28.74 
 
 		 706 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  28.68 
 
 		 886 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  28.21 
 
 		 706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  24.76 
 
 		 813 aa  121  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  29.16 
 
 		 774 aa  121  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  26.72 
 
 		 751 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  25.76 
 
 		 770 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  30.77 
 
 		 752 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  26.29 
 
 		 709 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  26.72 
 
 		 751 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3909  ribonuclease II  25 
 
 		 637 aa  117  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  25.71 
 
 		 771 aa  117  6e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  29.28 
 
 		 777 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  27.27 
 
 		 694 aa  117  6e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  25.31 
 
 		 770 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  25.91 
 
 		 815 aa  117  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  26.6 
 
 		 726 aa  117  7.999999999999999e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  25 
 
 		 857 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  25.24 
 
 		 857 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  26.72 
 
 		 722 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  25.06 
 
 		 758 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  27.76 
 
 		 825 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3160  ribonuclease R  27.34 
 
 		 701 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  24.71 
 
 		 762 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  24.32 
 
 		 708 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  25.65 
 
 		 394 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  25 
 
 		 857 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  28.46 
 
 		 759 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  29.18 
 
 		 864 aa  115  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  26.32 
 
 		 716 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  24.71 
 
 		 806 aa  114  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  25.06 
 
 		 814 aa  114  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04620  exoribonuclease II, putative  27.87 
 
 		 999 aa  114  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  24.71 
 
 		 808 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  24.71 
 
 		 808 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  25.93 
 
 		 806 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  24.71 
 
 		 806 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  24.71 
 
 		 804 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  25.23 
 
 		 828 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  27.23 
 
 		 735 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  28.91 
 
 		 848 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  24.71 
 
 		 808 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  24.71 
 
 		 812 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  24.71 
 
 		 810 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  27.75 
 
 		 689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1710  exoribonuclease II  27.97 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  25.32 
 
 		 859 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  28.38 
 
 		 870 aa  112  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  25.91 
 
 		 394 aa  112  3e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  23.24 
 
 		 795 aa  111  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  27.03 
 
 		 715 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0536  ribonuclease II  25.46 
 
 		 617 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  25.49 
 
 		 705 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2195  ribonuclease II  27.63 
 
 		 702 aa  111  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  28.11 
 
 		 710 aa  110  6e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  27.01 
 
 		 805 aa  110  6e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  28.11 
 
 		 710 aa  110  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3678  ribonuclease II  26.71 
 
 		 635 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  25.87 
 
 		 750 aa  110  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  26.46 
 
 		 705 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  24.59 
 
 		 792 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  26.65 
 
 		 770 aa  110  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  25.34 
 
 		 801 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.33 
 
 		 670 aa  109  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  26.42 
 
 		 791 aa  110  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1948  ribonuclease R  26.83 
 
 		 759 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.45898  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  25 
 
 		 704 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  29.72 
 
 		 535 aa  110  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>