More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0341 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  100 
 
 		 424 aa  852    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  96.7 
 
 		 424 aa  824    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  37.44 
 
 		 427 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  30.12 
 
 		 674 aa  250  4e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  35.03 
 
 		 683 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  32.21 
 
 		 676 aa  240  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  31.7 
 
 		 686 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  35.81 
 
 		 394 aa  212  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  35.55 
 
 		 394 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  31.45 
 
 		 683 aa  210  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  35.81 
 
 		 394 aa  209  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  32.48 
 
 		 671 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  32.23 
 
 		 671 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  29.1 
 
 		 670 aa  204  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  32.48 
 
 		 676 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  29.92 
 
 		 674 aa  201  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  28.93 
 
 		 671 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  32.82 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  27.93 
 
 		 645 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  29.7 
 
 		 623 aa  137  4e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  27.69 
 
 		 469 aa  136  7.000000000000001e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  26.01 
 
 		 659 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  27.98 
 
 		 666 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  28.61 
 
 		 708 aa  125  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  30.34 
 
 		 718 aa  125  2e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  28.23 
 
 		 813 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  27.23 
 
 		 680 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  28.91 
 
 		 667 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  28.01 
 
 		 694 aa  119  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  27.68 
 
 		 737 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  27.08 
 
 		 751 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  27.95 
 
 		 602 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  27.71 
 
 		 535 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  26.13 
 
 		 751 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.21 
 
 		 619 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  25.45 
 
 		 709 aa  115  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1993  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  25.94 
 
 		 701 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13462  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  25.54 
 
 		 705 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  24.18 
 
 		 705 aa  112  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  24.94 
 
 		 706 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  31.29 
 
 		 581 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  27.3 
 
 		 777 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  25.58 
 
 		 722 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  25.22 
 
 		 817 aa  109  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  28.02 
 
 		 752 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  24.55 
 
 		 670 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  26.45 
 
 		 692 aa  107  3e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  24.28 
 
 		 813 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  25.6 
 
 		 814 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  26.19 
 
 		 804 aa  106  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  26.19 
 
 		 810 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  24.77 
 
 		 759 aa  106  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  26.19 
 
 		 808 aa  106  7e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  26.19 
 
 		 812 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  26.19 
 
 		 806 aa  106  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  25.89 
 
 		 808 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  25.89 
 
 		 808 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  26.85 
 
 		 646 aa  105  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  26.77 
 
 		 701 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  27.17 
 
 		 829 aa  105  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  25 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  25.89 
 
 		 806 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  26.11 
 
 		 817 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0576  ribonuclease R  25.85 
 
 		 749 aa  105  2e-21  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  25.39 
 
 		 788 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09080  VacB/RNase II-like 3'-5' exoribonuclease  25.37 
 
 		 670 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  24.68 
 
 		 810 aa  104  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  26.63 
 
 		 801 aa  104  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1225  exoribonuclease II  24.23 
 
 		 646 aa  104  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  26.02 
 
 		 702 aa  103  6e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  25.31 
 
 		 1037 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  24.25 
 
 		 722 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  27.81 
 
 		 665 aa  102  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  26.89 
 
 		 863 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  26.45 
 
 		 757 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  27.22 
 
 		 695 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  24.72 
 
 		 818 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4583  Exoribonuclease II  25.84 
 
 		 601 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.370367 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  25.69 
 
 		 706 aa  101  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3160  ribonuclease R  26.54 
 
 		 701 aa  102  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  26.67 
 
 		 710 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  25.08 
 
 		 762 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  24.76 
 
 		 726 aa  102  2e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  24.58 
 
 		 822 aa  100  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  26.81 
 
 		 763 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  25.41 
 
 		 844 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  25.46 
 
 		 709 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  26.67 
 
 		 710 aa  101  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  25.41 
 
 		 844 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  25.41 
 
 		 844 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0438  exoribonuclease R  25.14 
 
 		 828 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.845016  unclonable  0.0000000698245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  25.78 
 
 		 737 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  25.39 
 
 		 716 aa  100  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  26.28 
 
 		 720 aa  99.4  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  25 
 
 		 737 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  24.32 
 
 		 792 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  25.86 
 
 		 829 aa  99  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  25.76 
 
 		 714 aa  98.6  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  24.93 
 
 		 763 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  26.71 
 
 		 790 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>