More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0711 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  100 
 
 		 619 aa  1228    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  41.45 
 
 		 695 aa  442  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  32.65 
 
 		 806 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  32.64 
 
 		 806 aa  344  2e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  32.49 
 
 		 808 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  32.49 
 
 		 804 aa  345  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  32.49 
 
 		 808 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  32.48 
 
 		 806 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  32.48 
 
 		 810 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  32.33 
 
 		 808 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  32.17 
 
 		 812 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  31.85 
 
 		 814 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  36.95 
 
 		 801 aa  338  9.999999999999999e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  32.33 
 
 		 792 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  32.38 
 
 		 752 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  33.44 
 
 		 706 aa  333  8e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  31.37 
 
 		 777 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  32.8 
 
 		 762 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  34.49 
 
 		 792 aa  328  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  32.96 
 
 		 758 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  35.31 
 
 		 706 aa  327  3e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  35.3 
 
 		 757 aa  328  3e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  33.66 
 
 		 788 aa  327  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  33.44 
 
 		 710 aa  324  3e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  33.44 
 
 		 710 aa  323  5e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  33.92 
 
 		 790 aa  323  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  33.92 
 
 		 790 aa  323  6e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  33.55 
 
 		 705 aa  322  1.9999999999999998e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  31.05 
 
 		 903 aa  321  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  32.45 
 
 		 763 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  34.67 
 
 		 737 aa  320  3.9999999999999996e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  35.16 
 
 		 716 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  35.33 
 
 		 708 aa  318  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  36.67 
 
 		 722 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  31.01 
 
 		 715 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  32.89 
 
 		 737 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  36.44 
 
 		 763 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30.79 
 
 		 759 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  34.34 
 
 		 704 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  31.45 
 
 		 737 aa  308  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  33.5 
 
 		 716 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  32.76 
 
 		 766 aa  302  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0097  3'-5' exoribonuclease  39.78 
 
 		 704 aa  298  2e-79  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  30.88 
 
 		 770 aa  298  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  35.25 
 
 		 810 aa  298  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  37.23 
 
 		 694 aa  297  5e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  33.17 
 
 		 751 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  31.21 
 
 		 863 aa  294  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  36.46 
 
 		 726 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  33.17 
 
 		 751 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  36.25 
 
 		 726 aa  292  1e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl209  virulence associated protein, ribonuclease R  33.11 
 
 		 704 aa  292  2e-77  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000726605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.03 
 
 		 735 aa  291  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  30.33 
 
 		 1055 aa  291  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  32.42 
 
 		 779 aa  291  3e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  31.11 
 
 		 709 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  34.42 
 
 		 755 aa  289  1e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  31.55 
 
 		 705 aa  289  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  35.41 
 
 		 722 aa  288  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  35.18 
 
 		 720 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  36.05 
 
 		 718 aa  288  2e-76  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  32.73 
 
 		 701 aa  288  2e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  34.32 
 
 		 758 aa  287  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  28.07 
 
 		 857 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  28.57 
 
 		 818 aa  286  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  31.32 
 
 		 801 aa  286  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  30.54 
 
 		 758 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  31.22 
 
 		 762 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  27.92 
 
 		 857 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  33.06 
 
 		 819 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  30.56 
 
 		 817 aa  283  5.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  27.62 
 
 		 857 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  33.74 
 
 		 805 aa  282  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.1 
 
 		 791 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  32.54 
 
 		 714 aa  281  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  34.73 
 
 		 824 aa  280  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  31.75 
 
 		 795 aa  280  7e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  28.19 
 
 		 910 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  31.85 
 
 		 770 aa  279  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  33.55 
 
 		 822 aa  279  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  34.39 
 
 		 774 aa  279  1e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  34.05 
 
 		 807 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  34.05 
 
 		 807 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  27.83 
 
 		 828 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  27.77 
 
 		 859 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  27.5 
 
 		 857 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  29.15 
 
 		 801 aa  277  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  29.23 
 
 		 810 aa  276  7e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  33.84 
 
 		 807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  33.84 
 
 		 807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  33.84 
 
 		 807 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  32.15 
 
 		 751 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  31.39 
 
 		 795 aa  275  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  29.15 
 
 		 880 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  27.88 
 
 		 1037 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  29.74 
 
 		 844 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  32.01 
 
 		 791 aa  275  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  29.74 
 
 		 844 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  29.74 
 
 		 844 aa  274  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  28.68 
 
 		 861 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>