More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf396 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  100 
 
 		 718 aa  1442    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  36.36 
 
 		 758 aa  361  3e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  31.91 
 
 		 790 aa  359  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  31.91 
 
 		 790 aa  359  8e-98  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  36.48 
 
 		 710 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  34.84 
 
 		 814 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  36.48 
 
 		 710 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  33.92 
 
 		 762 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  34.66 
 
 		 806 aa  357  5e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  34.48 
 
 		 806 aa  356  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  34.45 
 
 		 808 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  34.48 
 
 		 804 aa  356  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  34.4 
 
 		 810 aa  356  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  34.45 
 
 		 808 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  34.4 
 
 		 808 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  34.48 
 
 		 812 aa  356  1e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  34.66 
 
 		 806 aa  355  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  31.4 
 
 		 792 aa  350  5e-95  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  34.7 
 
 		 792 aa  350  8e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  32.92 
 
 		 801 aa  349  9e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  31.64 
 
 		 801 aa  348  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  33.28 
 
 		 817 aa  347  4e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  39.34 
 
 		 704 aa  345  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  33.44 
 
 		 709 aa  340  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  33.23 
 
 		 716 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  32.99 
 
 		 715 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  34.01 
 
 		 810 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  33.71 
 
 		 779 aa  332  1e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  31.35 
 
 		 763 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  29.46 
 
 		 720 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  32.57 
 
 		 910 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  34.07 
 
 		 774 aa  327  7e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  36.01 
 
 		 708 aa  321  3e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  29.13 
 
 		 752 aa  321  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  40.09 
 
 		 766 aa  321  3e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  31.07 
 
 		 705 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  31.42 
 
 		 759 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  30.53 
 
 		 737 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  40.67 
 
 		 737 aa  315  1.9999999999999998e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  29.75 
 
 		 706 aa  314  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  30.44 
 
 		 737 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  30.37 
 
 		 857 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  32.35 
 
 		 751 aa  313  6.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  32.27 
 
 		 706 aa  312  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  31.3 
 
 		 788 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  30.19 
 
 		 858 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  32.35 
 
 		 751 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0097  3'-5' exoribonuclease  32.39 
 
 		 704 aa  311  4e-83  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  34.57 
 
 		 757 aa  311  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  29.56 
 
 		 714 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  31.05 
 
 		 857 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  31.74 
 
 		 818 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl209  virulence associated protein, ribonuclease R  32.48 
 
 		 704 aa  305  3.0000000000000004e-81  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000726605  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  32.39 
 
 		 695 aa  303  5.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  32.05 
 
 		 716 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  31.98 
 
 		 805 aa  303  7.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  27.48 
 
 		 777 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  30.18 
 
 		 903 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  29.91 
 
 		 810 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  38.12 
 
 		 763 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  34.84 
 
 		 863 aa  298  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  29.76 
 
 		 828 aa  297  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  30.41 
 
 		 726 aa  297  5e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  31.55 
 
 		 667 aa  296  9e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  28.45 
 
 		 836 aa  296  1e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  29.27 
 
 		 886 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  29.11 
 
 		 1182 aa  294  3e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  32.85 
 
 		 770 aa  294  4e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  28.45 
 
 		 838 aa  293  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  29.28 
 
 		 801 aa  293  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  31.9 
 
 		 726 aa  293  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  31.95 
 
 		 726 aa  292  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  33.75 
 
 		 840 aa  291  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  36.05 
 
 		 619 aa  288  2.9999999999999996e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  31.87 
 
 		 1037 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  29.68 
 
 		 857 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  29.68 
 
 		 857 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  32.06 
 
 		 722 aa  287  5.999999999999999e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  29.97 
 
 		 857 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  28.65 
 
 		 842 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  36.4 
 
 		 833 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  30.27 
 
 		 819 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  28.55 
 
 		 937 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3602  exoribonuclease R  29.66 
 
 		 818 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  29.06 
 
 		 876 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3785  ribonuclease R  29.23 
 
 		 748 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  29.86 
 
 		 818 aa  283  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  29.42 
 
 		 819 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  30.76 
 
 		 815 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  29.57 
 
 		 733 aa  282  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  28.65 
 
 		 859 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  29.55 
 
 		 709 aa  281  2e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  28.02 
 
 		 876 aa  282  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  30.82 
 
 		 822 aa  282  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  28.79 
 
 		 833 aa  281  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  27.21 
 
 		 770 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  36.55 
 
 		 819 aa  281  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  36.63 
 
 		 817 aa  281  3e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  27.13 
 
 		 870 aa  281  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  33.04 
 
 		 758 aa  280  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>