More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl209 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl209  virulence associated protein, ribonuclease R  100 
 
 		 704 aa  1426    Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000726605  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0097  3'-5' exoribonuclease  59.86 
 
 		 704 aa  883    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  35.49 
 
 		 790 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  35.49 
 
 		 790 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  35.52 
 
 		 806 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  34.45 
 
 		 792 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  34.25 
 
 		 801 aa  378  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  35.04 
 
 		 792 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  34.45 
 
 		 814 aa  374  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  34.22 
 
 		 808 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  35.09 
 
 		 804 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  35.09 
 
 		 810 aa  375  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  35.09 
 
 		 806 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  34.12 
 
 		 758 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  34.22 
 
 		 808 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  35.09 
 
 		 808 aa  375  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  34.45 
 
 		 812 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  35.23 
 
 		 806 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  32.67 
 
 		 762 aa  370  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  37.73 
 
 		 695 aa  359  9.999999999999999e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  33.84 
 
 		 774 aa  358  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  33.08 
 
 		 726 aa  356  8.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  33.98 
 
 		 751 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  35.19 
 
 		 708 aa  352  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  32.55 
 
 		 715 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  33.7 
 
 		 751 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  34.99 
 
 		 716 aa  347  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  33.79 
 
 		 788 aa  347  5e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0063  ribonuclease R  34.5 
 
 		 721 aa  346  8e-94  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  31.92 
 
 		 752 aa  345  1e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  31.54 
 
 		 801 aa  345  2e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  33.64 
 
 		 706 aa  344  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  33.66 
 
 		 779 aa  343  5e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  31.69 
 
 		 720 aa  343  8e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  32.41 
 
 		 817 aa  341  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  33.79 
 
 		 757 aa  339  9e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  32.5 
 
 		 818 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  31.55 
 
 		 771 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  32.31 
 
 		 763 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  34.35 
 
 		 722 aa  337  5.999999999999999e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  33.49 
 
 		 910 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  31.55 
 
 		 770 aa  337  7e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  33.38 
 
 		 810 aa  336  7.999999999999999e-91  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  39.46 
 
 		 710 aa  336  9e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  34.39 
 
 		 709 aa  335  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  39.46 
 
 		 710 aa  335  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  33.08 
 
 		 763 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  34.04 
 
 		 705 aa  334  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  31.21 
 
 		 770 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  31.87 
 
 		 759 aa  331  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  33.24 
 
 		 706 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  31.94 
 
 		 903 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  32.87 
 
 		 858 aa  324  4e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  33.29 
 
 		 766 aa  321  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  32.72 
 
 		 770 aa  322  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  31.95 
 
 		 737 aa  321  3e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  31.99 
 
 		 749 aa  320  3.9999999999999996e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  33.18 
 
 		 857 aa  320  5e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  31.99 
 
 		 736 aa  320  5e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  32.77 
 
 		 857 aa  320  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  30.09 
 
 		 937 aa  318  2e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  30.55 
 
 		 777 aa  317  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  33.23 
 
 		 716 aa  317  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  32.04 
 
 		 737 aa  316  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  30.77 
 
 		 801 aa  316  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  30.34 
 
 		 870 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  32.48 
 
 		 718 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  30.95 
 
 		 828 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  32.08 
 
 		 751 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  30.61 
 
 		 876 aa  312  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  32.56 
 
 		 819 aa  310  9e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  31.74 
 
 		 667 aa  309  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  29.6 
 
 		 758 aa  308  3e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  37.64 
 
 		 704 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  29.99 
 
 		 805 aa  307  5.0000000000000004e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  30.9 
 
 		 861 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.58 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  33.09 
 
 		 694 aa  305  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  30.06 
 
 		 1055 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  31.04 
 
 		 880 aa  304  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  29.59 
 
 		 813 aa  303  9e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  30.21 
 
 		 906 aa  303  9e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2540  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  29.32 
 
 		 833 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548982  normal  0.714199 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  30.82 
 
 		 804 aa  302  1e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  29.45 
 
 		 813 aa  302  1e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  29.45 
 
 		 813 aa  302  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  29.45 
 
 		 813 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  29.45 
 
 		 813 aa  302  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  32.62 
 
 		 701 aa  301  2e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  29.45 
 
 		 813 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  29.45 
 
 		 813 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  29.45 
 
 		 813 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.45 
 
 		 813 aa  301  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  29.42 
 
 		 864 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4729  exoribonuclease R  29.63 
 
 		 812 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  29.29 
 
 		 812 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4646  exoribonuclease R  29.63 
 
 		 812 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  36.19 
 
 		 810 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4786  exoribonuclease R  29.63 
 
 		 812 aa  301  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.717168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  29.91 
 
 		 907 aa  301  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>