More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_14771 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  100 
 
 		 683 aa  1365    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  49.63 
 
 		 674 aa  614  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  47.94 
 
 		 676 aa  592  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  32.89 
 
 		 671 aa  330  5.0000000000000004e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  32.76 
 
 		 674 aa  312  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  33.48 
 
 		 670 aa  301  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  31.08 
 
 		 683 aa  283  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  39.95 
 
 		 686 aa  280  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  34.78 
 
 		 671 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  34.98 
 
 		 427 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  34.78 
 
 		 671 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  31.4 
 
 		 676 aa  264  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  35.59 
 
 		 424 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  35.03 
 
 		 424 aa  245  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  32.79 
 
 		 394 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  29.04 
 
 		 394 aa  227  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  31.97 
 
 		 394 aa  226  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  34.29 
 
 		 645 aa  223  7e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  31.42 
 
 		 394 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  34.55 
 
 		 666 aa  167  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  35.03 
 
 		 659 aa  163  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  33.8 
 
 		 469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  28.37 
 
 		 623 aa  147  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  32.15 
 
 		 602 aa  146  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  28.96 
 
 		 709 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  28.13 
 
 		 692 aa  145  3e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  30.7 
 
 		 791 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  30.72 
 
 		 750 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  31.31 
 
 		 680 aa  138  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.75 
 
 		 762 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  30.33 
 
 		 689 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  28.78 
 
 		 770 aa  135  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  29.22 
 
 		 791 aa  133  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  30.24 
 
 		 705 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  29.37 
 
 		 680 aa  132  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  28.06 
 
 		 813 aa  131  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  28.65 
 
 		 702 aa  129  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  29.5 
 
 		 795 aa  128  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  29.65 
 
 		 794 aa  126  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  26.42 
 
 		 581 aa  127  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  27.37 
 
 		 656 aa  126  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  26.37 
 
 		 737 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  28.91 
 
 		 716 aa  124  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  29.15 
 
 		 766 aa  123  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  23.43 
 
 		 742 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  28.93 
 
 		 709 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  25.79 
 
 		 751 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  28.65 
 
 		 795 aa  120  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  25.79 
 
 		 751 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.6 
 
 		 670 aa  119  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  26.07 
 
 		 718 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  28.14 
 
 		 795 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  28.83 
 
 		 704 aa  118  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  31.34 
 
 		 535 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.97 
 
 		 665 aa  117  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  29.8 
 
 		 813 aa  117  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  26.77 
 
 		 817 aa  117  7.999999999999999e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  28.29 
 
 		 646 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  27.42 
 
 		 825 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  28.57 
 
 		 735 aa  115  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  24.85 
 
 		 667 aa  114  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04620  exoribonuclease II, putative  28.3 
 
 		 999 aa  114  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  27.75 
 
 		 1182 aa  114  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  26.27 
 
 		 705 aa  114  8.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  24.04 
 
 		 726 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  26.52 
 
 		 788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2244  exoribonuclease II  28.48 
 
 		 644 aa  111  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.469162  normal  0.153134 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  26.14 
 
 		 695 aa  111  5e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0179  ribonuclease II  24.71 
 
 		 698 aa  111  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1904  exoribonuclease II  28.48 
 
 		 644 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.629828  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  25.08 
 
 		 708 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2016  exoribonuclease II  28.48 
 
 		 644 aa  110  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134803  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  29.43 
 
 		 722 aa  110  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09080  VacB/RNase II-like 3'-5' exoribonuclease  27.91 
 
 		 670 aa  110  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132674 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  24.11 
 
 		 671 aa  109  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1502  ribonuclease R  29.5 
 
 		 777 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.68898  normal  0.0835717 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  25.3 
 
 		 716 aa  109  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  28.12 
 
 		 735 aa  109  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  24.36 
 
 		 619 aa  108  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  28.93 
 
 		 698 aa  108  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  24.62 
 
 		 762 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1710  exoribonuclease II  27.88 
 
 		 657 aa  108  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  25.82 
 
 		 757 aa  107  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1993  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  27.64 
 
 		 701 aa  107  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13462  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  27.76 
 
 		 718 aa  106  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  24.62 
 
 		 801 aa  106  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1511  RNAse R  26.89 
 
 		 766 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.193382 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  24.49 
 
 		 694 aa  106  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  27.3 
 
 		 710 aa  105  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  28.21 
 
 		 1671 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  27.3 
 
 		 710 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3160  ribonuclease R  28.57 
 
 		 701 aa  106  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  25.74 
 
 		 722 aa  105  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  29.6 
 
 		 758 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  26.87 
 
 		 863 aa  104  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  26.77 
 
 		 752 aa  104  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  25.64 
 
 		 726 aa  104  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3792  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  27.86 
 
 		 660 aa  104  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  27.95 
 
 		 678 aa  103  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  25.36 
 
 		 830 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>