More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNG02350 on replicon NC_006692
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_01158  cell wall biogenesis protein phosphatase Ssd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11420)  47.29 
 
 		 1374 aa  695    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  100 
 
 		 1671 aa  3441    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82373  Exosomal 3'-5' exoribonuclease complex, subunit Rrp44/Dis3  40.79 
 
 		 1251 aa  565  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0228634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23306  predicted protein  32.93 
 
 		 908 aa  342  5e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103886  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43971  predicted protein  36.65 
 
 		 962 aa  317  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_582  predicted protein  38.28 
 
 		 538 aa  307  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000266967 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03657  putative TeaA receptor TeaR (Eurofung)  30.39 
 
 		 1015 aa  304  9e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.902934 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86849  3'-5' exoribonuclease required for 3 end formation of 5.8S rRNA  29.54 
 
 		 989 aa  285  6.000000000000001e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00800  conserved hypothetical protein  29.93 
 
 		 1002 aa  276  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123934  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26775  predicted protein  34.99 
 
 		 593 aa  275  4.0000000000000004e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_10027  predicted protein  33.78 
 
 		 668 aa  274  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000299968  normal  0.0425653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  33.48 
 
 		 709 aa  259  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  35.55 
 
 		 735 aa  255  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  34.6 
 
 		 726 aa  246  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  33.48 
 
 		 750 aa  244  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  31.77 
 
 		 702 aa  243  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  31.45 
 
 		 795 aa  241  5.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  33.03 
 
 		 705 aa  239  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  33.65 
 
 		 742 aa  239  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  30.63 
 
 		 795 aa  238  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.65 
 
 		 762 aa  236  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  33.26 
 
 		 718 aa  235  5e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  31.19 
 
 		 709 aa  234  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  30.81 
 
 		 794 aa  234  9e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  33.82 
 
 		 716 aa  234  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  30.49 
 
 		 751 aa  234  9e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  29.96 
 
 		 770 aa  234  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  30.42 
 
 		 795 aa  233  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  30.72 
 
 		 791 aa  233  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.63 
 
 		 751 aa  231  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  31.26 
 
 		 766 aa  231  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  31.67 
 
 		 751 aa  228  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  31.89 
 
 		 825 aa  226  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  31.46 
 
 		 1182 aa  224  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  29.47 
 
 		 791 aa  218  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  30.44 
 
 		 863 aa  216  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  34.57 
 
 		 817 aa  216  2.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  33.5 
 
 		 810 aa  213  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  27.84 
 
 		 814 aa  212  6e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  30.69 
 
 		 763 aa  211  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  27.98 
 
 		 812 aa  211  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  27.98 
 
 		 806 aa  211  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  27.98 
 
 		 810 aa  210  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  27.98 
 
 		 806 aa  210  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  32 
 
 		 706 aa  210  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  29.64 
 
 		 704 aa  210  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  27.98 
 
 		 808 aa  210  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  27.79 
 
 		 806 aa  209  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  28.18 
 
 		 804 aa  209  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  33.25 
 
 		 801 aa  208  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  30.64 
 
 		 758 aa  208  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  27.98 
 
 		 808 aa  208  9e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  27.98 
 
 		 808 aa  208  9e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  30.86 
 
 		 757 aa  206  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0915  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.26 
 
 		 756 aa  206  4e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  29.67 
 
 		 762 aa  206  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  27.76 
 
 		 792 aa  205  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  30.16 
 
 		 737 aa  205  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  30.45 
 
 		 903 aa  205  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  30.12 
 
 		 813 aa  202  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  30.64 
 
 		 710 aa  202  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  30.64 
 
 		 710 aa  203  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  29.98 
 
 		 788 aa  203  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  32.02 
 
 		 770 aa  202  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  34.36 
 
 		 665 aa  202  5e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30.92 
 
 		 759 aa  201  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  28.65 
 
 		 720 aa  199  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  28.1 
 
 		 706 aa  198  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  30.61 
 
 		 790 aa  197  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  30.61 
 
 		 790 aa  197  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  32.68 
 
 		 715 aa  197  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09080  VacB/RNase II-like 3'-5' exoribonuclease  36.39 
 
 		 670 aa  196  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  28.73 
 
 		 701 aa  196  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  31.39 
 
 		 774 aa  196  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  28.78 
 
 		 792 aa  194  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  29.29 
 
 		 755 aa  193  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  27.66 
 
 		 815 aa  192  7e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  29.42 
 
 		 821 aa  191  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  31.36 
 
 		 708 aa  191  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  31.03 
 
 		 722 aa  190  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  31.59 
 
 		 716 aa  190  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  33.14 
 
 		 695 aa  190  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  31.71 
 
 		 801 aa  189  3e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  30.19 
 
 		 842 aa  189  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  31.62 
 
 		 705 aa  188  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  28.85 
 
 		 763 aa  188  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  31.62 
 
 		 667 aa  187  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  28.8 
 
 		 818 aa  187  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  28.89 
 
 		 803 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  27.97 
 
 		 833 aa  187  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  26.73 
 
 		 810 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  28.27 
 
 		 828 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  27.4 
 
 		 907 aa  185  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  30.12 
 
 		 737 aa  185  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  27.84 
 
 		 824 aa  184  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  28.14 
 
 		 826 aa  184  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  28.34 
 
 		 834 aa  184  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  28.57 
 
 		 840 aa  184  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0576  ribonuclease R  26.93 
 
 		 749 aa  183  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  30.59 
 
 		 827 aa  183  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>