More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23306 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_23306  predicted protein  100 
 
 		 908 aa  1878    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103886  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03657  putative TeaA receptor TeaR (Eurofung)  37.99 
 
 		 1015 aa  595  1e-169  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.902934 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43971  predicted protein  40.02 
 
 		 962 aa  598  1e-169  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86849  3'-5' exoribonuclease required for 3 end formation of 5.8S rRNA  38.41 
 
 		 989 aa  575  1.0000000000000001e-162  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188778  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00800  conserved hypothetical protein  37.74 
 
 		 1002 aa  566  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_10027  predicted protein  35.38 
 
 		 668 aa  335  2e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000299968  normal  0.0425653 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  32.28 
 
 		 1671 aa  335  3e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_582  predicted protein  39.29 
 
 		 538 aa  294  5e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000266967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  33.69 
 
 		 750 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  34.19 
 
 		 726 aa  266  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  32.74 
 
 		 742 aa  265  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  34.36 
 
 		 718 aa  261  5.0000000000000005e-68  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  35.21 
 
 		 795 aa  255  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26775  predicted protein  32.56 
 
 		 593 aa  247  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  31.13 
 
 		 735 aa  247  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  36.59 
 
 		 709 aa  245  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  32.46 
 
 		 825 aa  240  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  34.2 
 
 		 702 aa  238  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  32.97 
 
 		 795 aa  236  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01158  cell wall biogenesis protein phosphatase Ssd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11420)  27.08 
 
 		 1374 aa  232  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  37.91 
 
 		 751 aa  228  4e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  31.58 
 
 		 794 aa  228  6e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  31.23 
 
 		 705 aa  227  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  30.2 
 
 		 791 aa  224  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  32.16 
 
 		 795 aa  220  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  32.19 
 
 		 770 aa  219  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.72 
 
 		 762 aa  215  2.9999999999999995e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  32.45 
 
 		 813 aa  211  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  29.51 
 
 		 757 aa  210  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  29.48 
 
 		 709 aa  208  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  31.62 
 
 		 716 aa  207  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  30.51 
 
 		 766 aa  206  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  30.22 
 
 		 791 aa  205  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  29.39 
 
 		 806 aa  202  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  30 
 
 		 751 aa  201  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  31.51 
 
 		 751 aa  201  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  28.52 
 
 		 806 aa  201  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  29.39 
 
 		 812 aa  200  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  29.39 
 
 		 808 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  29.39 
 
 		 804 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  29.39 
 
 		 810 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  29.39 
 
 		 808 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  30.89 
 
 		 788 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  29.39 
 
 		 806 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  29.39 
 
 		 808 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  29.18 
 
 		 814 aa  199  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  30.77 
 
 		 706 aa  197  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  29.28 
 
 		 763 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  29.3 
 
 		 827 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  30.4 
 
 		 762 aa  197  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  28.54 
 
 		 792 aa  196  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  30.94 
 
 		 817 aa  196  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  30.02 
 
 		 876 aa  194  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  28.49 
 
 		 706 aa  194  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  29.74 
 
 		 810 aa  194  6e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  31.32 
 
 		 801 aa  194  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  28.73 
 
 		 715 aa  193  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  30.2 
 
 		 758 aa  192  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  29 
 
 		 705 aa  189  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  29.64 
 
 		 694 aa  189  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  29.67 
 
 		 805 aa  189  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  30.26 
 
 		 861 aa  188  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  30.59 
 
 		 828 aa  187  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  27.93 
 
 		 701 aa  187  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  28.86 
 
 		 903 aa  187  9e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  30.69 
 
 		 763 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  32.44 
 
 		 710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  31.75 
 
 		 803 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  31.34 
 
 		 758 aa  185  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  30.35 
 
 		 863 aa  185  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  30.38 
 
 		 815 aa  184  7e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  32.2 
 
 		 710 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  30.51 
 
 		 801 aa  184  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  29.94 
 
 		 877 aa  184  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  28.6 
 
 		 870 aa  184  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  29.39 
 
 		 801 aa  183  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  28.6 
 
 		 736 aa  183  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  28.6 
 
 		 749 aa  182  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  30.39 
 
 		 667 aa  182  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.28 
 
 		 877 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  30.14 
 
 		 876 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  30.15 
 
 		 704 aa  181  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  27.77 
 
 		 722 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1993  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.59 
 
 		 701 aa  181  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.13462  normal  0.124011 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  30.22 
 
 		 708 aa  181  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  33.09 
 
 		 774 aa  180  9e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  32.37 
 
 		 790 aa  180  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  28.33 
 
 		 716 aa  180  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  32.37 
 
 		 790 aa  180  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  30.12 
 
 		 804 aa  179  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  29.73 
 
 		 726 aa  179  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  32.99 
 
 		 754 aa  178  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  29.33 
 
 		 871 aa  178  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  29.73 
 
 		 726 aa  178  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  29.79 
 
 		 906 aa  178  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  33.33 
 
 		 1182 aa  178  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  29.57 
 
 		 810 aa  177  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  30.02 
 
 		 907 aa  177  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  29.48 
 
 		 827 aa  177  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  29.48 
 
 		 827 aa  177  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>