More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26775 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_26775  predicted protein  100 
 
 		 593 aa  1236    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_582  predicted protein  41.05 
 
 		 538 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000266967 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_10027  predicted protein  37.55 
 
 		 668 aa  276  8e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000299968  normal  0.0425653 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  33.15 
 
 		 1671 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00800  conserved hypothetical protein  33.95 
 
 		 1002 aa  263  8.999999999999999e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43971  predicted protein  36.05 
 
 		 962 aa  261  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03657  putative TeaA receptor TeaR (Eurofung)  33.39 
 
 		 1015 aa  253  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.902934 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86849  3'-5' exoribonuclease required for 3 end formation of 5.8S rRNA  32.23 
 
 		 989 aa  252  1e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23306  predicted protein  32.56 
 
 		 908 aa  247  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103886  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  31.83 
 
 		 750 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  35.14 
 
 		 825 aa  236  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  33.27 
 
 		 726 aa  235  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  31.24 
 
 		 735 aa  234  3e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01158  cell wall biogenesis protein phosphatase Ssd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11420)  32.52 
 
 		 1374 aa  231  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  35.27 
 
 		 742 aa  231  3e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  34.05 
 
 		 709 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  35.89 
 
 		 795 aa  226  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  31.36 
 
 		 795 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  34.32 
 
 		 791 aa  207  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  34.18 
 
 		 762 aa  205  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  32.33 
 
 		 770 aa  205  2e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  34.18 
 
 		 794 aa  203  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  30.2 
 
 		 718 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  31.99 
 
 		 702 aa  201  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  31.75 
 
 		 705 aa  201  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  31.18 
 
 		 795 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  30.31 
 
 		 788 aa  198  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  31.28 
 
 		 716 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.57 
 
 		 791 aa  197  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  32.65 
 
 		 814 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  32.19 
 
 		 806 aa  194  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  33.26 
 
 		 751 aa  193  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  32.19 
 
 		 804 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  32.19 
 
 		 812 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  31.96 
 
 		 806 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  32.19 
 
 		 808 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  32.19 
 
 		 810 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  32.19 
 
 		 808 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  32.19 
 
 		 808 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  32.19 
 
 		 806 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  33.11 
 
 		 762 aa  190  5e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  31.47 
 
 		 813 aa  190  7e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  31.98 
 
 		 709 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  30.63 
 
 		 810 aa  188  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  32.65 
 
 		 758 aa  187  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  32.81 
 
 		 792 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  34.05 
 
 		 667 aa  186  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  30.56 
 
 		 757 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  30 
 
 		 863 aa  184  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  30.33 
 
 		 766 aa  182  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  30.48 
 
 		 710 aa  182  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09080  VacB/RNase II-like 3'-5' exoribonuclease  32.3 
 
 		 670 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.132674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  30.65 
 
 		 751 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  30.29 
 
 		 710 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.96 
 
 		 751 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  29.59 
 
 		 1182 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82373  Exosomal 3'-5' exoribonuclease complex, subunit Rrp44/Dis3  27.83 
 
 		 1251 aa  175  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0228634  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  31.54 
 
 		 665 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  31.66 
 
 		 903 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  28.88 
 
 		 705 aa  174  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1482  VacB/Rnb family exoribonuclease  32.88 
 
 		 801 aa  173  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0098629  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  30.72 
 
 		 842 aa  173  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.59 
 
 		 670 aa  172  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  30.39 
 
 		 692 aa  171  4e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  30.1 
 
 		 759 aa  170  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  32.45 
 
 		 801 aa  169  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  27.63 
 
 		 704 aa  169  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  31.39 
 
 		 790 aa  169  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  31.39 
 
 		 790 aa  169  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  31.27 
 
 		 716 aa  167  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  32.93 
 
 		 715 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  31.19 
 
 		 792 aa  164  3e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  29.05 
 
 		 737 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  31.22 
 
 		 770 aa  163  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  28.88 
 
 		 737 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  29.75 
 
 		 722 aa  163  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  29.67 
 
 		 706 aa  163  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  28.78 
 
 		 695 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  29.07 
 
 		 763 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2449  ribonuclease R  31.75 
 
 		 808 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.162395  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  28.04 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  28.54 
 
 		 737 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  27.63 
 
 		 810 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  28.1 
 
 		 763 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  29.16 
 
 		 694 aa  160  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  28.98 
 
 		 581 aa  160  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  28.9 
 
 		 708 aa  159  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  31.72 
 
 		 817 aa  159  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4734  ribonuclease R  31.49 
 
 		 792 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2380  ribonuclease R  32.88 
 
 		 788 aa  158  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.736062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2657  ribonuclease R  32.88 
 
 		 788 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2337  ribonuclease R  32.97 
 
 		 795 aa  157  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  29.48 
 
 		 842 aa  157  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  28.49 
 
 		 706 aa  157  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3785  ribonuclease R  31.61 
 
 		 748 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  31.44 
 
 		 774 aa  156  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3864  ribonuclease R  29.52 
 
 		 776 aa  156  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7411  ribonuclease R  30.19 
 
 		 762 aa  156  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00900108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  29.63 
 
 		 733 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  31.17 
 
 		 838 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>