More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43971 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03657  putative TeaA receptor TeaR (Eurofung)  41.87 
 
 		 1015 aa  653    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.902934 
 
 
-
 
NC_006686  CND00800  conserved hypothetical protein  40.14 
 
 		 1002 aa  640    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.123934  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86849  3'-5' exoribonuclease required for 3 end formation of 5.8S rRNA  40.45 
 
 		 989 aa  643    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.188778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_43971  predicted protein  100 
 
 		 962 aa  1971    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23306  predicted protein  40.02 
 
 		 908 aa  598  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103886  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_10027  predicted protein  36.67 
 
 		 668 aa  394  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000299968  normal  0.0425653 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02350  SSD1 protein, putative  36.65 
 
 		 1671 aa  317  7e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_582  predicted protein  34.07 
 
 		 538 aa  275  3e-72  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000266967 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26775  predicted protein  36.05 
 
 		 593 aa  261  4e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  31.89 
 
 		 795 aa  239  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  36.02 
 
 		 702 aa  229  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  31.03 
 
 		 709 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01158  cell wall biogenesis protein phosphatase Ssd1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11420)  28.68 
 
 		 1374 aa  222  3e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.17 
 
 		 762 aa  221  6e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  32.39 
 
 		 735 aa  218  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  34.2 
 
 		 726 aa  218  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  31.16 
 
 		 825 aa  216  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  32.59 
 
 		 750 aa  214  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  30.6 
 
 		 791 aa  213  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  30.08 
 
 		 718 aa  213  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  28.99 
 
 		 742 aa  212  3e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  30.16 
 
 		 706 aa  212  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  31.05 
 
 		 770 aa  210  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  30.3 
 
 		 791 aa  209  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  30.94 
 
 		 705 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  29.67 
 
 		 716 aa  196  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  32.28 
 
 		 751 aa  194  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  28.28 
 
 		 794 aa  192  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  29.96 
 
 		 795 aa  190  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  31.12 
 
 		 752 aa  188  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  32.85 
 
 		 795 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  26.05 
 
 		 806 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  29.97 
 
 		 777 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  25.72 
 
 		 806 aa  181  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  25.56 
 
 		 814 aa  181  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  25.72 
 
 		 808 aa  181  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  25.72 
 
 		 804 aa  181  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  25.72 
 
 		 808 aa  181  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  27.78 
 
 		 766 aa  180  9e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  25.56 
 
 		 806 aa  180  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  25.56 
 
 		 810 aa  180  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  25.56 
 
 		 808 aa  180  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  28.22 
 
 		 863 aa  180  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  25.56 
 
 		 812 aa  180  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  27.19 
 
 		 709 aa  179  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  27.36 
 
 		 704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  27.8 
 
 		 710 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  27.8 
 
 		 710 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  28.44 
 
 		 759 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  27.03 
 
 		 757 aa  174  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  25.78 
 
 		 788 aa  174  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  25.88 
 
 		 792 aa  174  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  25.9 
 
 		 667 aa  173  2e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  28.02 
 
 		 701 aa  172  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  27.18 
 
 		 762 aa  172  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  27.22 
 
 		 737 aa  171  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.58 
 
 		 665 aa  170  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2663  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.38 
 
 		 833 aa  170  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  29.11 
 
 		 763 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  29.21 
 
 		 751 aa  169  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82373  Exosomal 3'-5' exoribonuclease complex, subunit Rrp44/Dis3  25.27 
 
 		 1251 aa  168  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0228634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  27.43 
 
 		 706 aa  168  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  27.72 
 
 		 722 aa  168  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  27.71 
 
 		 758 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  29.25 
 
 		 801 aa  167  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  30.25 
 
 		 737 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  28.75 
 
 		 763 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0356  ribonuclease R  33 
 
 		 778 aa  166  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0063  ribonuclease R  25.7 
 
 		 721 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  29.65 
 
 		 715 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  27.01 
 
 		 810 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  28.39 
 
 		 705 aa  165  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  29.26 
 
 		 708 aa  165  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  29.89 
 
 		 737 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  28.68 
 
 		 813 aa  165  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  29.34 
 
 		 720 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  27.09 
 
 		 819 aa  164  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.34 
 
 		 751 aa  164  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2830  ribonuclease R  29.69 
 
 		 782 aa  164  7e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.120928  normal  0.835648 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  28.88 
 
 		 692 aa  163  1e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  25.81 
 
 		 619 aa  162  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  28.72 
 
 		 805 aa  162  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  28.67 
 
 		 695 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2449  ribonuclease R  31.37 
 
 		 808 aa  161  4e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  28.21 
 
 		 770 aa  161  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0050  ribonuclease R  31.76 
 
 		 750 aa  160  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.3 
 
 		 670 aa  160  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2994  RNAse R  31.03 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  27.06 
 
 		 779 aa  159  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  26.3 
 
 		 716 aa  159  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2598  ribonuclease R  29.57 
 
 		 869 aa  159  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000938061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1353  ribonuclease R  31.28 
 
 		 765 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1126  RNAse R  31.38 
 
 		 752 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  29.23 
 
 		 746 aa  157  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  29.23 
 
 		 746 aa  157  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  31.67 
 
 		 754 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1294  ribonuclease R  29.38 
 
 		 790 aa  157  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501938  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2787  ribonuclease R  31.38 
 
 		 752 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  32.02 
 
 		 801 aa  156  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  28.71 
 
 		 1182 aa  156  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>