More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0915 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0915  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  100 
 
 		 756 aa  1550    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  33.74 
 
 		 716 aa  398  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  32.57 
 
 		 762 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  31.98 
 
 		 812 aa  383  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  32.07 
 
 		 806 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  31.85 
 
 		 808 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  31.98 
 
 		 806 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  31.72 
 
 		 804 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  31.98 
 
 		 810 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  32.45 
 
 		 758 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  31.98 
 
 		 806 aa  382  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  32.11 
 
 		 814 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  31.94 
 
 		 808 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  31.94 
 
 		 808 aa  379  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  33.97 
 
 		 763 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  32.42 
 
 		 792 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  35.06 
 
 		 763 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  32.11 
 
 		 788 aa  365  2e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  36.01 
 
 		 759 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  34.82 
 
 		 777 aa  363  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  32.26 
 
 		 801 aa  356  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  32.65 
 
 		 705 aa  355  1e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.95 
 
 		 751 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  30.95 
 
 		 751 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  32.75 
 
 		 706 aa  353  8e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  34.94 
 
 		 752 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  32.93 
 
 		 720 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  31.4 
 
 		 801 aa  348  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  34.24 
 
 		 737 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  32.53 
 
 		 903 aa  342  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  34.24 
 
 		 737 aa  341  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  32.88 
 
 		 805 aa  340  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  32.51 
 
 		 758 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2449  ribonuclease R  33.16 
 
 		 808 aa  337  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.162395  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  31.52 
 
 		 757 aa  337  5e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  30.41 
 
 		 792 aa  336  9e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2663  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  37.01 
 
 		 833 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  31.99 
 
 		 766 aa  334  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.88 
 
 		 735 aa  334  3e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  31.92 
 
 		 722 aa  334  4e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  32.81 
 
 		 709 aa  332  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  31.71 
 
 		 840 aa  331  3e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  32.8 
 
 		 710 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  32.8 
 
 		 710 aa  328  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  29.23 
 
 		 827 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  32.6 
 
 		 701 aa  328  3e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  32.1 
 
 		 706 aa  327  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  33.29 
 
 		 755 aa  327  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  32.87 
 
 		 818 aa  326  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  30.19 
 
 		 708 aa  324  4e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1164  ribonuclease R  31.85 
 
 		 848 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.284134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  30.05 
 
 		 790 aa  323  8e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  30.05 
 
 		 790 aa  323  8e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  34.27 
 
 		 751 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1228  exoribonuclease RNase R  31.72 
 
 		 871 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00057752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1072  ribonuclease R  31.72 
 
 		 864 aa  321  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  32.63 
 
 		 770 aa  320  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  34.72 
 
 		 715 aa  320  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  34.78 
 
 		 714 aa  318  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  30.97 
 
 		 876 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  31.86 
 
 		 825 aa  318  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  31.07 
 
 		 815 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  33.74 
 
 		 795 aa  318  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  30.43 
 
 		 828 aa  317  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  32.58 
 
 		 705 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  30.27 
 
 		 716 aa  317  7e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  31.59 
 
 		 750 aa  317  8e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  32.34 
 
 		 736 aa  316  9e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  32.25 
 
 		 870 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  32.34 
 
 		 749 aa  316  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  31.35 
 
 		 774 aa  316  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  30.99 
 
 		 857 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  29.78 
 
 		 709 aa  313  7.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  31.02 
 
 		 694 aa  312  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  31.87 
 
 		 1055 aa  311  2e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  31.71 
 
 		 838 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  31.71 
 
 		 838 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  31.71 
 
 		 838 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  32.05 
 
 		 805 aa  310  6.999999999999999e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  30.6 
 
 		 857 aa  310  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  31.71 
 
 		 812 aa  310  8e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  31.71 
 
 		 896 aa  310  9e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  31.71 
 
 		 896 aa  310  9e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  30.6 
 
 		 857 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  31.71 
 
 		 886 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  29.58 
 
 		 704 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07620  ribonuclease R  30.96 
 
 		 861 aa  309  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  31.76 
 
 		 827 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  31.76 
 
 		 827 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  31.76 
 
 		 827 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  31.58 
 
 		 895 aa  306  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  30.83 
 
 		 828 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  30.83 
 
 		 726 aa  306  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0608  RNAse R  31.33 
 
 		 758 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  30.04 
 
 		 859 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  31.58 
 
 		 906 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  31.85 
 
 		 907 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  31.11 
 
 		 695 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  30.36 
 
 		 937 aa  305  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  30.56 
 
 		 726 aa  304  3.0000000000000004e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>