More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_09941 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  88.58 
 
 		 394 aa  702    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  93.65 
 
 		 394 aa  740    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  100 
 
 		 394 aa  778    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  65.48 
 
 		 394 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  31 
 
 		 676 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  31.42 
 
 		 683 aa  220  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  35.44 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  28.93 
 
 		 674 aa  218  2e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  29.5 
 
 		 671 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  35.81 
 
 		 424 aa  212  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  35.42 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  32.47 
 
 		 676 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  27.66 
 
 		 683 aa  186  7e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  27.59 
 
 		 686 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  32.29 
 
 		 671 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  27.78 
 
 		 670 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  32.01 
 
 		 671 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  26.63 
 
 		 469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  32.63 
 
 		 674 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  27.61 
 
 		 666 aa  129  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  27.99 
 
 		 659 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  28.57 
 
 		 623 aa  117  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  28.33 
 
 		 602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  25.91 
 
 		 645 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  28.52 
 
 		 680 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  27.66 
 
 		 716 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  26.63 
 
 		 777 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  26.33 
 
 		 762 aa  102  1e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  25.37 
 
 		 791 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  24.4 
 
 		 692 aa  101  3e-20  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  27.95 
 
 		 709 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  27.24 
 
 		 695 aa  98.2  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  28.05 
 
 		 751 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  27.74 
 
 		 751 aa  96.7  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  25.94 
 
 		 718 aa  96.7  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  26.87 
 
 		 710 aa  96.3  8e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  26.87 
 
 		 710 aa  96.3  8e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  29.72 
 
 		 704 aa  96.3  9e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  24.55 
 
 		 791 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  25.51 
 
 		 770 aa  95.5  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  25.07 
 
 		 817 aa  94.7  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  25.36 
 
 		 821 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  26.86 
 
 		 830 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  27.78 
 
 		 708 aa  94  4e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  25.6 
 
 		 801 aa  94  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  27.38 
 
 		 824 aa  94.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0692  exoribonuclease R  25.38 
 
 		 844 aa  93.6  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3646  exoribonuclease R  25.38 
 
 		 844 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  25.96 
 
 		 667 aa  94  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3791  exoribonuclease R  25.38 
 
 		 844 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  26.71 
 
 		 774 aa  93.2  6e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  25.63 
 
 		 815 aa  93.2  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  26.46 
 
 		 680 aa  92.8  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  27.11 
 
 		 722 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  27.95 
 
 		 581 aa  93.2  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0215  ribonuclease II  25.57 
 
 		 676 aa  92.8  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.81 
 
 		 619 aa  92.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  25.8 
 
 		 795 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  26.52 
 
 		 833 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  28.09 
 
 		 706 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  24.93 
 
 		 819 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  27.46 
 
 		 716 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  25.29 
 
 		 689 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  25.08 
 
 		 794 aa  90.9  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  26.09 
 
 		 819 aa  91.3  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  26.4 
 
 		 705 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3785  ribonuclease R  25.23 
 
 		 748 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  26.48 
 
 		 705 aa  91.3  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  25 
 
 		 813 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  25.68 
 
 		 770 aa  90.5  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4710  exoribonuclease R  25.23 
 
 		 813 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  25 
 
 		 813 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3814  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  25 
 
 		 813 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04008  hypothetical protein  25 
 
 		 813 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.863156  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  24.69 
 
 		 749 aa  90.5  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  26.45 
 
 		 737 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  24.69 
 
 		 736 aa  90.1  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4422  exoribonuclease R  25 
 
 		 813 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3834  exoribonuclease R  25 
 
 		 813 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000264601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  25 
 
 		 813 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  25 
 
 		 813 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2180  exoribonuclease II  22.7 
 
 		 644 aa  90.1  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801772 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  26.52 
 
 		 826 aa  89.7  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4636  exoribonuclease R  25.46 
 
 		 812 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4765  exoribonuclease R  25.46 
 
 		 812 aa  89.7  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.57696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  23.29 
 
 		 806 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  25.46 
 
 		 824 aa  89.4  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1583  ribonuclease R  29.07 
 
 		 641 aa  89.4  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  24.53 
 
 		 763 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  23.46 
 
 		 906 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0767  exoribonuclease R  25.6 
 
 		 822 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.630081  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  26.51 
 
 		 834 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  23.17 
 
 		 907 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2000  hypothetical protein  28 
 
 		 639 aa  88.6  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  25.08 
 
 		 807 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  24.56 
 
 		 706 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2016  exoribonuclease II  23.6 
 
 		 644 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2244  exoribonuclease II  23.6 
 
 		 644 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.469162  normal  0.153134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  23.48 
 
 		 814 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  22.6 
 
 		 726 aa  88.2  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>