More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_5174 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  100 
 
 		 683 aa  1407    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  87.67 
 
 		 686 aa  1222    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  60.94 
 
 		 676 aa  794    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  56.34 
 
 		 670 aa  754    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  61.44 
 
 		 671 aa  809    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  61.44 
 
 		 671 aa  810    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  61.71 
 
 		 674 aa  837    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  61.45 
 
 		 671 aa  867    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  35.77 
 
 		 645 aa  351  3e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  31.08 
 
 		 683 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  37.95 
 
 		 676 aa  300  6e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  36.47 
 
 		 674 aa  286  1.0000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  31.89 
 
 		 659 aa  233  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  29.03 
 
 		 666 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  34.65 
 
 		 427 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  31.76 
 
 		 424 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  31.45 
 
 		 424 aa  227  6e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  30.48 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  30.73 
 
 		 813 aa  205  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  29.01 
 
 		 394 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  34.31 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  29.19 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  27.92 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  27.66 
 
 		 394 aa  197  7e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  29.48 
 
 		 602 aa  191  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  26.26 
 
 		 680 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.26 
 
 		 665 aa  153  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  30.65 
 
 		 718 aa  153  1e-35  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  27.21 
 
 		 751 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  27.01 
 
 		 709 aa  146  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  26.98 
 
 		 751 aa  146  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  29.38 
 
 		 791 aa  145  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  32.96 
 
 		 715 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  27.63 
 
 		 788 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  30.71 
 
 		 706 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  25.5 
 
 		 705 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  30.5 
 
 		 671 aa  142  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  27.68 
 
 		 770 aa  141  4.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  30.77 
 
 		 667 aa  140  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  28.29 
 
 		 762 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  29.86 
 
 		 774 aa  139  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  28.28 
 
 		 692 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  30.88 
 
 		 678 aa  138  4e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  27.05 
 
 		 770 aa  137  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  28.34 
 
 		 710 aa  137  9e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  27.59 
 
 		 766 aa  137  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  28.37 
 
 		 710 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  26.37 
 
 		 581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  27.7 
 
 		 794 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0037  ribonuclease R  30.56 
 
 		 745 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  31.84 
 
 		 706 aa  135  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  31.25 
 
 		 535 aa  133  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  25.79 
 
 		 759 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  24.28 
 
 		 709 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  25.09 
 
 		 813 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  28.19 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.37 
 
 		 619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  26.47 
 
 		 814 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  27.42 
 
 		 750 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  26.23 
 
 		 806 aa  130  6e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  29.53 
 
 		 805 aa  130  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  28.53 
 
 		 863 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  23.26 
 
 		 702 aa  130  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  26.23 
 
 		 808 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  26.23 
 
 		 804 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  30.24 
 
 		 722 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  26.23 
 
 		 808 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  26.2 
 
 		 716 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  29.61 
 
 		 718 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  26.23 
 
 		 806 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  25.98 
 
 		 806 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1646  ribonuclease R  28.12 
 
 		 781 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.353487 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  26.23 
 
 		 810 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  26.23 
 
 		 808 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  26.23 
 
 		 812 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  27.32 
 
 		 758 aa  129  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1225  exoribonuclease II  29.44 
 
 		 646 aa  127  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  26.52 
 
 		 722 aa  127  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1887  exoribonuclease II  29.02 
 
 		 644 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0154652  hitchhiker  0.00000000880902 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  25.67 
 
 		 716 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  28.69 
 
 		 752 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  25.74 
 
 		 792 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1630  exoribonuclease II  29.02 
 
 		 644 aa  127  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000100585 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  25.55 
 
 		 810 aa  127  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1938  ribonuclease R  28.36 
 
 		 829 aa  126  1e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.751615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1520  exoribonuclease II  31.33 
 
 		 644 aa  127  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2853  ribonuclease R  28.02 
 
 		 754 aa  127  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1830  exoribonuclease II  29.02 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.336461  hitchhiker  0.00426066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  29.66 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1448  exoribonuclease II  29.02 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0894921  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  26.42 
 
 		 694 aa  126  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1825  exoribonuclease II  29.27 
 
 		 644 aa  127  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.517880000000001e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  28.07 
 
 		 763 aa  126  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  28.08 
 
 		 819 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1923  exoribonuclease II  31.02 
 
 		 644 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0111084  hitchhiker  0.000000000153264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  28.72 
 
 		 857 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  30.64 
 
 		 824 aa  126  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  27.53 
 
 		 763 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1841  exoribonuclease II  31.02 
 
 		 644 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.816503  hitchhiker  0.00000000000000293222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1491  exoribonuclease II  31.02 
 
 		 644 aa  125  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0726624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>