More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1686 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  72.8 
 
 		 676 aa  962    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  59.18 
 
 		 686 aa  822    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  56.73 
 
 		 670 aa  739    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  99.55 
 
 		 671 aa  1365    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  61.44 
 
 		 683 aa  805    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  62.05 
 
 		 671 aa  843    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  64.17 
 
 		 674 aa  853    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  100 
 
 		 671 aa  1371    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  34.79 
 
 		 645 aa  350  5e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  32.61 
 
 		 674 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  38.36 
 
 		 676 aa  294  3e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  33.56 
 
 		 683 aa  292  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  30.03 
 
 		 623 aa  243  9e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  29.52 
 
 		 666 aa  231  4e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  31.86 
 
 		 659 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  32.48 
 
 		 424 aa  219  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  32.3 
 
 		 427 aa  217  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  32.26 
 
 		 424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  34.2 
 
 		 469 aa  204  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  31.83 
 
 		 602 aa  200  6e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  29.62 
 
 		 680 aa  198  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  31.69 
 
 		 394 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  31.97 
 
 		 394 aa  194  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  30.68 
 
 		 394 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  31.23 
 
 		 394 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  32.18 
 
 		 813 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  26.54 
 
 		 689 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  28.66 
 
 		 665 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  27.42 
 
 		 751 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0215  ribonuclease II  25 
 
 		 676 aa  140  6e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  27.17 
 
 		 863 aa  140  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  28.57 
 
 		 718 aa  139  2e-31  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  30.95 
 
 		 667 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1089  ribonuclease II  27.48 
 
 		 691 aa  139  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  27.19 
 
 		 751 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  28.11 
 
 		 710 aa  137  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  30.27 
 
 		 671 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  25.2 
 
 		 680 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  27.9 
 
 		 710 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  30.08 
 
 		 715 aa  134  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  27.51 
 
 		 810 aa  134  6e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  27.61 
 
 		 692 aa  134  7.999999999999999e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  25.18 
 
 		 581 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3405  ribonuclease II  26.58 
 
 		 707 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.185041 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  30.95 
 
 		 678 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  25.7 
 
 		 694 aa  131  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  27.21 
 
 		 706 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  24.12 
 
 		 698 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3654  ribonuclease II  26.56 
 
 		 695 aa  128  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.55944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  27.01 
 
 		 667 aa  128  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  27.53 
 
 		 791 aa  127  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  27.07 
 
 		 774 aa  127  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  24.77 
 
 		 857 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  24.77 
 
 		 857 aa  127  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  25.78 
 
 		 788 aa  127  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  24.79 
 
 		 705 aa  127  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2244  exoribonuclease II  31.75 
 
 		 644 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.469162  normal  0.153134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  26.09 
 
 		 722 aa  126  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  24.55 
 
 		 859 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  27.38 
 
 		 1182 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  29.31 
 
 		 706 aa  126  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  28.53 
 
 		 763 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2016  exoribonuclease II  31.75 
 
 		 644 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134803  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  25.31 
 
 		 709 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  25.52 
 
 		 813 aa  125  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1520  exoribonuclease II  31.04 
 
 		 644 aa  125  3e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  24.55 
 
 		 857 aa  125  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3056  ribonuclease II  26.94 
 
 		 712 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.235713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  26.71 
 
 		 770 aa  124  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1923  exoribonuclease II  30.75 
 
 		 644 aa  124  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0111084  hitchhiker  0.000000000153264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1399  exoribonuclease II  30.75 
 
 		 644 aa  124  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0060132  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2195  ribonuclease II  24.31 
 
 		 702 aa  124  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  27.42 
 
 		 535 aa  123  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2339  exoribonuclease II  30.75 
 
 		 644 aa  124  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  26.7 
 
 		 656 aa  124  8e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2360  exoribonuclease II  30.75 
 
 		 644 aa  123  9e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00712354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1841  exoribonuclease II  30.75 
 
 		 644 aa  123  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.816503  hitchhiker  0.00000000000000293222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1491  exoribonuclease II  30.75 
 
 		 644 aa  123  9e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0726624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1904  exoribonuclease II  31.45 
 
 		 644 aa  123  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.629828  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  26.54 
 
 		 910 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  28.85 
 
 		 762 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01263  exoribonuclease II  30.45 
 
 		 644 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01274  hypothetical protein  30.45 
 
 		 644 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  27.51 
 
 		 759 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  29.55 
 
 		 646 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  27.29 
 
 		 757 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3199  hypothetical protein  25.57 
 
 		 685 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0554772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  26.31 
 
 		 763 aa  122  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  27.9 
 
 		 752 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1710  exoribonuclease II  31.53 
 
 		 657 aa  122  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1225  exoribonuclease II  28.82 
 
 		 646 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0236  ribonuclease II  25.22 
 
 		 680 aa  121  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1630  exoribonuclease II  29.31 
 
 		 644 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000100585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1887  exoribonuclease II  29.31 
 
 		 644 aa  121  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0154652  hitchhiker  0.00000000880902 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  25.17 
 
 		 716 aa  121  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  24.43 
 
 		 702 aa  120  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  27.17 
 
 		 722 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1825  exoribonuclease II  29.31 
 
 		 644 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.517880000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1830  exoribonuclease II  29.31 
 
 		 644 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.336461  hitchhiker  0.00426066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1448  exoribonuclease II  29.31 
 
 		 644 aa  120  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0894921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>