More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0236 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0236  ribonuclease II  100 
 
 		 680 aa  1399    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0215  ribonuclease II  84.71 
 
 		 676 aa  1189    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3056  ribonuclease II  50.84 
 
 		 712 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.235713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2857  ribonuclease II  49.63 
 
 		 714 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236401  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3023  ribonuclease II  49.01 
 
 		 698 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2613  ribonuclease II  49.16 
 
 		 698 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2779  hypothetical protein  48.55 
 
 		 693 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0538  putative ribonuclease II  45.98 
 
 		 709 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2623  ribonuclease II  45.98 
 
 		 701 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2773  ribonuclease II  46.12 
 
 		 690 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0580  ribonuclease II  44.93 
 
 		 696 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0129  ribonuclease II  45.36 
 
 		 694 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0612  ribonuclease II  45.36 
 
 		 694 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3694  ribonuclease II  45.21 
 
 		 695 aa  558  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3420  ribonuclease II  45.98 
 
 		 705 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108028 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0537  ribonuclease II  44.78 
 
 		 696 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.731192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0513  ribonuclease II  44.9 
 
 		 696 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1275  ribonuclease II (RNB) family protein  45.65 
 
 		 692 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2495  ribonuclease II (RNB) family protein  45.65 
 
 		 692 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3290  ribonuclease II (RNB)-like protein  45.65 
 
 		 692 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0415  ribonuclease II (RNB) family protein  45.65 
 
 		 692 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0351971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3459  ribonuclease II (RNB)-like protein  45.65 
 
 		 692 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3497  ribonuclease II (RNB)-like protein  45.65 
 
 		 692 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1170  ribonuclease II  45.51 
 
 		 637 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3494  ribonuclease II (RNB) family protein  46.66 
 
 		 639 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3654  ribonuclease II  40 
 
 		 695 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.55944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2964  ribonuclease II  39.19 
 
 		 723 aa  462  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3678  ribonuclease II  40.42 
 
 		 635 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0843  ribonuclease II  40.23 
 
 		 693 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3980  ribonuclease II  41.82 
 
 		 705 aa  458  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000301096 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3199  hypothetical protein  41.33 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0554772 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2575  ribonuclease II  41.54 
 
 		 619 aa  450  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0536  ribonuclease II  39.97 
 
 		 617 aa  452  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1484  ribonuclease II  40.03 
 
 		 692 aa  451  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3909  ribonuclease II  39.85 
 
 		 637 aa  442  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3405  ribonuclease II  39.88 
 
 		 707 aa  443  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.185041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1089  ribonuclease II  40.49 
 
 		 691 aa  443  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0937  ribonuclease II  40.74 
 
 		 686 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.371224  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3411  ribonuclease II  39.43 
 
 		 695 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2195  ribonuclease II  37.98 
 
 		 702 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1234  ribonuclease II  38.95 
 
 		 622 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.334774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  28.22 
 
 		 659 aa  144  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  27.32 
 
 		 666 aa  125  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  25.39 
 
 		 671 aa  124  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  25.39 
 
 		 671 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  24.04 
 
 		 676 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  26.6 
 
 		 671 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  31.39 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0179  ribonuclease II  30.03 
 
 		 698 aa  107  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  28.33 
 
 		 683 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  26.65 
 
 		 686 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  26.73 
 
 		 670 aa  97.8  6e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  25 
 
 		 671 aa  97.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  28.73 
 
 		 698 aa  94.4  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  22.74 
 
 		 674 aa  94  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1225  exoribonuclease II  27.71 
 
 		 646 aa  93.6  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  25.3 
 
 		 645 aa  92.4  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0297  exoribonuclease II  25.83 
 
 		 645 aa  92  3e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  24.6 
 
 		 394 aa  91.7  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1943  ribonuclease II  26.19 
 
 		 735 aa  90.5  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  24.56 
 
 		 667 aa  90.5  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  27.3 
 
 		 735 aa  88.6  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  23.78 
 
 		 751 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  23.78 
 
 		 751 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  26.95 
 
 		 678 aa  85.5  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2638  exoribonuclease II  26.65 
 
 		 644 aa  84.7  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.76344  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  22.64 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  25.14 
 
 		 680 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1743  exoribonuclease II  25.73 
 
 		 643 aa  84.3  0.000000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2631  exoribonuclease II  26.1 
 
 		 644 aa  84.3  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.950688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  23.89 
 
 		 656 aa  83.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2180  exoribonuclease II  25.33 
 
 		 644 aa  82.8  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801772 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2244  exoribonuclease II  25.51 
 
 		 644 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.469162  normal  0.153134 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2016  exoribonuclease II  25.51 
 
 		 644 aa  83.2  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2357  exoribonuclease II  26.33 
 
 		 644 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.804019  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  26.48 
 
 		 676 aa  82  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1825  exoribonuclease II  25.07 
 
 		 644 aa  82  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.517880000000001e-23 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  25.43 
 
 		 863 aa  82.4  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  24.92 
 
 		 394 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1904  exoribonuclease II  25.51 
 
 		 644 aa  81.3  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.629828  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1887  exoribonuclease II  25.07 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0154652  hitchhiker  0.00000000880902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1630  exoribonuclease II  25.07 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000100585 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  27.03 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1830  exoribonuclease II  25.07 
 
 		 644 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.336461  hitchhiker  0.00426066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1448  exoribonuclease II  25.07 
 
 		 644 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0894921  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2360  exoribonuclease II  25.5 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00712354  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  26.37 
 
 		 680 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1520  exoribonuclease II  25.5 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1710  exoribonuclease II  25.51 
 
 		 657 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1491  exoribonuclease II  25.5 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0726624  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1841  exoribonuclease II  25.33 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.816503  hitchhiker  0.00000000000000293222 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1923  exoribonuclease II  25 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0111084  hitchhiker  0.000000000153264 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1399  exoribonuclease II  25.33 
 
 		 644 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0060132  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2339  exoribonuclease II  25.33 
 
 		 644 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  25.34 
 
 		 689 aa  78.2  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  24.73 
 
 		 623 aa  78.2  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  24.35 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01263  exoribonuclease II  25.21 
 
 		 644 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01274  hypothetical protein  25.21 
 
 		 644 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  24.27 
 
 		 737 aa  77.4  0.0000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>