287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1234 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0536  ribonuclease II  52.2 
 
 		 617 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1234  ribonuclease II  100 
 
 		 622 aa  1283    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.334774 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3678  ribonuclease II  52.67 
 
 		 635 aa  635    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2575  ribonuclease II  51.52 
 
 		 619 aa  627  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.103427 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3909  ribonuclease II  48.55 
 
 		 637 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0537  ribonuclease II  48.13 
 
 		 696 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.731192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2773  ribonuclease II  49.28 
 
 		 690 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0513  ribonuclease II  48.64 
 
 		 696 aa  569  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3694  ribonuclease II  48.17 
 
 		 695 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0580  ribonuclease II  48.17 
 
 		 696 aa  561  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000257704 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0129  ribonuclease II  48.01 
 
 		 694 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0612  ribonuclease II  48.01 
 
 		 694 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3459  ribonuclease II (RNB)-like protein  48.02 
 
 		 692 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0538  putative ribonuclease II  47.77 
 
 		 709 aa  556  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3497  ribonuclease II (RNB)-like protein  48.02 
 
 		 692 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2495  ribonuclease II (RNB) family protein  47.86 
 
 		 692 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3290  ribonuclease II (RNB)-like protein  47.86 
 
 		 692 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0415  ribonuclease II (RNB) family protein  47.86 
 
 		 692 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0351971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1275  ribonuclease II (RNB) family protein  47.86 
 
 		 692 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3420  ribonuclease II  46.82 
 
 		 705 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108028 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2623  ribonuclease II  46.97 
 
 		 701 aa  535  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2857  ribonuclease II  46.27 
 
 		 714 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3056  ribonuclease II  44.98 
 
 		 712 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.235713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3494  ribonuclease II (RNB) family protein  48.27 
 
 		 639 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1170  ribonuclease II  47.79 
 
 		 637 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3023  ribonuclease II  44.88 
 
 		 698 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.58589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2613  ribonuclease II  44.88 
 
 		 698 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3199  hypothetical protein  43.47 
 
 		 685 aa  498  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0554772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2779  hypothetical protein  44.62 
 
 		 693 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.100642 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0843  ribonuclease II  44.79 
 
 		 693 aa  491  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16653 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3405  ribonuclease II  44.01 
 
 		 707 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.185041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1089  ribonuclease II  42.77 
 
 		 691 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3654  ribonuclease II  42.52 
 
 		 695 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.55944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1484  ribonuclease II  43.68 
 
 		 692 aa  474  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.35292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0937  ribonuclease II  43.61 
 
 		 686 aa  457  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.371224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2964  ribonuclease II  40.75 
 
 		 723 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3980  ribonuclease II  40.34 
 
 		 705 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000301096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3411  ribonuclease II  42.32 
 
 		 695 aa  451  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2195  ribonuclease II  41.52 
 
 		 702 aa  442  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0215  ribonuclease II  38.67 
 
 		 676 aa  416  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0236  ribonuclease II  38.74 
 
 		 680 aa  411  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  27.29 
 
 		 659 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  29.05 
 
 		 680 aa  122  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0173  RNB-like family protein  24.24 
 
 		 698 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  29.39 
 
 		 666 aa  115  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1943  ribonuclease II  27.55 
 
 		 735 aa  107  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0179  ribonuclease II  28.11 
 
 		 698 aa  103  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.35632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  25.71 
 
 		 671 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  25.71 
 
 		 670 aa  99  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  22.97 
 
 		 671 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  22.97 
 
 		 671 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  25.27 
 
 		 676 aa  93.2  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0103  ribonuclease II  25.89 
 
 		 735 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  24.68 
 
 		 645 aa  92  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  23.03 
 
 		 674 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  26.09 
 
 		 686 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3021  ribonuclease II  25.26 
 
 		 680 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2285  ribonuclease II  23.7 
 
 		 689 aa  84  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  26.71 
 
 		 646 aa  82.4  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  25.3 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  27.12 
 
 		 683 aa  80.5  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  24.29 
 
 		 602 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1825  exoribonuclease II  24.62 
 
 		 644 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.517880000000001e-23 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1830  exoribonuclease II  24.62 
 
 		 644 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.336461  hitchhiker  0.00426066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1448  exoribonuclease II  24.62 
 
 		 644 aa  77.8  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0894921  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1630  exoribonuclease II  24.31 
 
 		 644 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000100585 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1887  exoribonuclease II  24.31 
 
 		 644 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0154652  hitchhiker  0.00000000880902 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  25.28 
 
 		 671 aa  75.9  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1225  exoribonuclease II  30.63 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  25.07 
 
 		 667 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  25 
 
 		 676 aa  73.6  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2631  exoribonuclease II  26.3 
 
 		 644 aa  71.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.950688  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2357  exoribonuclease II  24.56 
 
 		 644 aa  70.5  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.804019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  27.43 
 
 		 751 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2270  exoribonuclease II  24.58 
 
 		 656 aa  70.1  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0115056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  24.72 
 
 		 704 aa  69.7  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  25.96 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2360  exoribonuclease II  24.27 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00712354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1923  exoribonuclease II  24.27 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0111084  hitchhiker  0.000000000153264 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1520  exoribonuclease II  24.27 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1710  exoribonuclease II  23.74 
 
 		 657 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1491  exoribonuclease II  24.27 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0726624  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2599  ribonuclease II  23.13 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1841  exoribonuclease II  24.27 
 
 		 644 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.816503  hitchhiker  0.00000000000000293222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  26.13 
 
 		 623 aa  68.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2339  exoribonuclease II  24.27 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185583 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1399  exoribonuclease II  24.27 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0060132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2180  exoribonuclease II  24.7 
 
 		 644 aa  67.8  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00801772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  26.48 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  26.48 
 
 		 710 aa  68.2  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01263  exoribonuclease II  23.98 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  24.78 
 
 		 674 aa  67.4  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01274  hypothetical protein  23.98 
 
 		 644 aa  67.4  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  23.93 
 
 		 678 aa  66.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1743  exoribonuclease II  22.88 
 
 		 643 aa  67  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  23.75 
 
 		 810 aa  67  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  22.85 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2638  exoribonuclease II  21.47 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.76344  normal  0.010179 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  27.43 
 
 		 706 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  23.4 
 
 		 758 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>