More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2599 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2599  ribonuclease II  100 
 
 		 615 aa  1277    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4610  ribonuclease II  35.67 
 
 		 635 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.715919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4448  ribonuclease II  29.89 
 
 		 617 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.345616 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  31.96 
 
 		 710 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  32.06 
 
 		 710 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  32.35 
 
 		 766 aa  154  7e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  31.71 
 
 		 716 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  34.05 
 
 		 706 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  32.94 
 
 		 706 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  31.76 
 
 		 704 aa  144  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  30.55 
 
 		 751 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  28.37 
 
 		 737 aa  142  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  34.93 
 
 		 715 aa  142  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  33.33 
 
 		 751 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  32.42 
 
 		 722 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  29.68 
 
 		 751 aa  140  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  32.32 
 
 		 762 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  31.58 
 
 		 758 aa  139  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  30.37 
 
 		 702 aa  139  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  29.82 
 
 		 694 aa  139  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  34.01 
 
 		 720 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  31.79 
 
 		 757 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  33.13 
 
 		 1182 aa  137  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3965  ribonuclease R  31.06 
 
 		 827 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120955  normal  0.449748 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  32.42 
 
 		 813 aa  136  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  32.19 
 
 		 763 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  29.48 
 
 		 716 aa  134  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  30.38 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  30.38 
 
 		 806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  30.38 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  30.38 
 
 		 804 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  30.38 
 
 		 810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  30.38 
 
 		 806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  30.38 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  30.38 
 
 		 812 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  30.38 
 
 		 806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0097  3'-5' exoribonuclease  28.83 
 
 		 704 aa  131  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  30.47 
 
 		 814 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  28.53 
 
 		 695 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0037  ribonuclease R  33.02 
 
 		 745 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.03 
 
 		 762 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1342  exoribonuclease R  30.12 
 
 		 667 aa  130  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  30.46 
 
 		 795 aa  130  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.09 
 
 		 619 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  32.44 
 
 		 788 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  31.27 
 
 		 770 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.89 
 
 		 665 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  30.67 
 
 		 863 aa  129  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  30.77 
 
 		 790 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  29.44 
 
 		 701 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  31.18 
 
 		 803 aa  128  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  30.77 
 
 		 790 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  30.43 
 
 		 718 aa  128  4.0000000000000003e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  30.03 
 
 		 801 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  28.23 
 
 		 718 aa  127  5e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  29.94 
 
 		 666 aa  127  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1295  Exoribonuclease II  33.05 
 
 		 432 aa  127  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  30.09 
 
 		 792 aa  126  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0949  ribonuclease R  31.38 
 
 		 646 aa  126  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  29.56 
 
 		 674 aa  126  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1755  ribonuclease R  32.62 
 
 		 792 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  29.49 
 
 		 759 aa  126  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1502  ribonuclease R  30.66 
 
 		 777 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.68898  normal  0.0835717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  28.27 
 
 		 880 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  29.85 
 
 		 795 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  30.06 
 
 		 770 aa  125  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2663  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.31 
 
 		 833 aa  125  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  31.43 
 
 		 755 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  29.63 
 
 		 857 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  31.27 
 
 		 794 aa  124  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3160  ribonuclease R  29.23 
 
 		 701 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  29.41 
 
 		 770 aa  124  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3094  Exoribonuclease II  33.43 
 
 		 432 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3536  ribonuclease R  33.44 
 
 		 781 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.589347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  30.37 
 
 		 714 aa  124  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl209  virulence associated protein, ribonuclease R  28.61 
 
 		 704 aa  124  6e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000726605  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0356  ribonuclease R  31.23 
 
 		 778 aa  124  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  30.37 
 
 		 857 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  30.6 
 
 		 808 aa  123  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  31.25 
 
 		 709 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  29.54 
 
 		 792 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3203  RNAse R  31.83 
 
 		 842 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.62845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2337  ribonuclease R  32.49 
 
 		 795 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  27.72 
 
 		 708 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0915  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.34 
 
 		 756 aa  123  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  26.43 
 
 		 750 aa  123  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  31.17 
 
 		 705 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  29.33 
 
 		 842 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0372  ribonuclease R  28.13 
 
 		 641 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  29.72 
 
 		 791 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1294  ribonuclease R  30.96 
 
 		 790 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.501938  decreased coverage  0.00167989 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1713  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  32.92 
 
 		 782 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.631532  normal  0.56941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  30.48 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1353  ribonuclease R  33.05 
 
 		 765 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  31.58 
 
 		 737 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1274  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.02 
 
 		 670 aa  122  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  31.58 
 
 		 737 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  30.03 
 
 		 777 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3034  ribonuclease R  30.79 
 
 		 781 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0258557  normal  0.241672 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  29.6 
 
 		 817 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>