More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3094 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3094  Exoribonuclease II  100 
 
 		 432 aa  889    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0142  ribonuclease II  80.6 
 
 		 439 aa  725    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0272  ribonuclease II  81.01 
 
 		 437 aa  743    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.588423  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0359  ribonuclease II  77.26 
 
 		 433 aa  681    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1295  Exoribonuclease II  90.74 
 
 		 432 aa  822    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  37.15 
 
 		 535 aa  202  8e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  34.64 
 
 		 694 aa  196  5.000000000000001e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  35.89 
 
 		 716 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  35.71 
 
 		 708 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  32.85 
 
 		 1182 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  33.08 
 
 		 705 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  32.78 
 
 		 750 aa  184  3e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  33.33 
 
 		 692 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  35.89 
 
 		 757 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  32.76 
 
 		 763 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  32.39 
 
 		 759 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  33.25 
 
 		 818 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  32.51 
 
 		 863 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  33.58 
 
 		 788 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  32.38 
 
 		 825 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  33.08 
 
 		 777 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  32.88 
 
 		 752 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  30.9 
 
 		 836 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  32.51 
 
 		 735 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  36.91 
 
 		 801 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  33.25 
 
 		 737 aa  174  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  31.48 
 
 		 795 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  32.77 
 
 		 763 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  32.83 
 
 		 886 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  32.26 
 
 		 718 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  34.15 
 
 		 770 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  34.27 
 
 		 710 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  33.01 
 
 		 706 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  33.15 
 
 		 704 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.02 
 
 		 791 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  32.51 
 
 		 720 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  31.66 
 
 		 838 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  31.93 
 
 		 795 aa  171  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  32.43 
 
 		 737 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  33.99 
 
 		 710 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  34.16 
 
 		 705 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  34.9 
 
 		 695 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  30.9 
 
 		 794 aa  170  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  33.33 
 
 		 722 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  32.43 
 
 		 737 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  31.34 
 
 		 813 aa  169  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  33.24 
 
 		 714 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  32.34 
 
 		 749 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  34.33 
 
 		 880 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  32.09 
 
 		 736 aa  169  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  32.07 
 
 		 746 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  32.07 
 
 		 746 aa  168  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  35.12 
 
 		 808 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  32.69 
 
 		 706 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  32.49 
 
 		 814 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  33.8 
 
 		 709 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  32.12 
 
 		 762 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  32.6 
 
 		 702 aa  165  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  31.53 
 
 		 762 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  32.58 
 
 		 716 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  31.77 
 
 		 758 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  31.02 
 
 		 701 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  35.2 
 
 		 821 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  32.95 
 
 		 910 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  34.32 
 
 		 817 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  31.27 
 
 		 718 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  36.03 
 
 		 842 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  31.74 
 
 		 808 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  31.74 
 
 		 804 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  31.74 
 
 		 810 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  31.74 
 
 		 806 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  32.89 
 
 		 791 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  30.38 
 
 		 735 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  31.74 
 
 		 808 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  31.74 
 
 		 812 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  31.74 
 
 		 808 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  31.49 
 
 		 806 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  31.47 
 
 		 819 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  31.25 
 
 		 803 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  31.23 
 
 		 806 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  34.62 
 
 		 809 aa  163  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  32.66 
 
 		 1037 aa  163  7e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  34.32 
 
 		 808 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  34.41 
 
 		 829 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  30.27 
 
 		 770 aa  162  9e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  34.1 
 
 		 758 aa  162  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0543  exoribonuclease II  31.2 
 
 		 649 aa  162  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  34.32 
 
 		 808 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  34.32 
 
 		 808 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  34.93 
 
 		 834 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  31.16 
 
 		 842 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  34.29 
 
 		 755 aa  161  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  31.52 
 
 		 722 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  33.92 
 
 		 819 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  34.66 
 
 		 810 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  34.12 
 
 		 826 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  34.05 
 
 		 807 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  34.02 
 
 		 807 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  34.05 
 
 		 807 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  34.05 
 
 		 807 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>