More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0272 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1295  Exoribonuclease II  78.85 
 
 		 432 aa  728    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0359  ribonuclease II  73.44 
 
 		 433 aa  642    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3094  Exoribonuclease II  81.01 
 
 		 432 aa  743    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0272  ribonuclease II  100 
 
 		 437 aa  893    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.588423  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0142  ribonuclease II  86.18 
 
 		 439 aa  778    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  37.91 
 
 		 535 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  33.26 
 
 		 813 aa  200  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  36.41 
 
 		 716 aa  196  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  33.02 
 
 		 1182 aa  194  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  35.92 
 
 		 801 aa  192  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  35.87 
 
 		 694 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  34.86 
 
 		 777 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  36.19 
 
 		 759 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  33.17 
 
 		 863 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  32.44 
 
 		 818 aa  182  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  36.21 
 
 		 763 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  34.45 
 
 		 692 aa  182  1e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  32.09 
 
 		 701 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  33.58 
 
 		 708 aa  182  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  34.67 
 
 		 1037 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  35.51 
 
 		 695 aa  181  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  32.79 
 
 		 752 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  34.49 
 
 		 886 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  35.64 
 
 		 735 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  34.33 
 
 		 880 aa  179  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  35.22 
 
 		 737 aa  179  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  36.14 
 
 		 808 aa  178  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  33.25 
 
 		 722 aa  178  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  31.75 
 
 		 836 aa  177  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  35.01 
 
 		 906 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  35.01 
 
 		 907 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  32.75 
 
 		 859 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  34.42 
 
 		 815 aa  176  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0543  exoribonuclease II  33 
 
 		 649 aa  176  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  34.51 
 
 		 757 aa  176  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  32.51 
 
 		 750 aa  176  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  32.51 
 
 		 857 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  32.51 
 
 		 705 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  32.51 
 
 		 857 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  34.73 
 
 		 749 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  34.45 
 
 		 736 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  32.26 
 
 		 857 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  31.76 
 
 		 838 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  36.12 
 
 		 834 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  35.14 
 
 		 737 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  33.17 
 
 		 705 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  33.16 
 
 		 828 aa  172  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  33.75 
 
 		 763 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  36.86 
 
 		 819 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  36.68 
 
 		 817 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  31.86 
 
 		 788 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.12 
 
 		 619 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  34.31 
 
 		 858 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  31.59 
 
 		 718 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  31.7 
 
 		 877 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  31.08 
 
 		 718 aa  171  3e-41  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  32.11 
 
 		 877 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  35.26 
 
 		 826 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  30.83 
 
 		 795 aa  170  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  34.16 
 
 		 710 aa  170  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  32.43 
 
 		 758 aa  170  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  31.41 
 
 		 827 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  31.41 
 
 		 827 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  31.41 
 
 		 827 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  33.88 
 
 		 710 aa  169  8e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  32.59 
 
 		 720 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  33.61 
 
 		 737 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  34.64 
 
 		 706 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  33.33 
 
 		 716 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  30.9 
 
 		 819 aa  169  1e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  32.27 
 
 		 876 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  33 
 
 		 706 aa  169  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3264  RNAse R  35.92 
 
 		 808 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000483036  decreased coverage  0.00000524837 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0683  RNAse R  35.92 
 
 		 808 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0668572  hitchhiker  0.000463961 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0728  ribonuclease R  35.67 
 
 		 807 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.14505  hitchhiker  0.000000257568 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  35.45 
 
 		 824 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0737  ribonuclease R  35.67 
 
 		 807 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.034125  hitchhiker  0.00132247 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  35.53 
 
 		 829 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0707  ribonuclease R  35.67 
 
 		 807 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.419789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0697  RNAse R  35.92 
 
 		 809 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00112836  hitchhiker  0.000328486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3935  ribonuclease R  35.92 
 
 		 808 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  34.07 
 
 		 857 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  33.73 
 
 		 803 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  30.95 
 
 		 828 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0749  ribonuclease R  35.63 
 
 		 807 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000988982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  32.33 
 
 		 762 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0994  ribonuclease R  33.51 
 
 		 810 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  34.58 
 
 		 833 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  33.87 
 
 		 665 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  31.34 
 
 		 791 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  31.89 
 
 		 758 aa  167  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  32.62 
 
 		 704 aa  167  5e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  33.73 
 
 		 805 aa  167  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  31.11 
 
 		 895 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3647  ribonuclease R  35.38 
 
 		 807 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0028274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  32.33 
 
 		 817 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  32.33 
 
 		 817 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  34.34 
 
 		 755 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  32.12 
 
 		 722 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  35.08 
 
 		 821 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>