More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0142 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0142  ribonuclease II  100 
 
 		 439 aa  900    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3094  Exoribonuclease II  80.6 
 
 		 432 aa  725    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1295  Exoribonuclease II  78.8 
 
 		 432 aa  711    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0272  ribonuclease II  86.18 
 
 		 437 aa  778    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.588423  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0359  ribonuclease II  72.92 
 
 		 433 aa  638    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  34.8 
 
 		 535 aa  193  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  36.02 
 
 		 801 aa  192  8e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  35.68 
 
 		 759 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  35.22 
 
 		 763 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  35.14 
 
 		 737 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  32.61 
 
 		 1182 aa  187  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  33.79 
 
 		 694 aa  187  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  32.59 
 
 		 708 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  34.23 
 
 		 752 aa  186  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  32.58 
 
 		 813 aa  186  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  32.27 
 
 		 818 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  32.41 
 
 		 836 aa  182  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  35.19 
 
 		 737 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  33.76 
 
 		 777 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  34.42 
 
 		 735 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  32.08 
 
 		 838 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  34.28 
 
 		 749 aa  180  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  33.99 
 
 		 736 aa  180  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  34.24 
 
 		 758 aa  179  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  34.23 
 
 		 716 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  34.21 
 
 		 763 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1522  ribonuclease R  33.03 
 
 		 827 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351431  normal  0.0857248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1066  ribonuclease R  33.03 
 
 		 827 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152985  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  33.03 
 
 		 827 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  33.66 
 
 		 886 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  33.5 
 
 		 720 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  30.99 
 
 		 795 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0543  exoribonuclease II  31.77 
 
 		 649 aa  176  9e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  32.2 
 
 		 758 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2519  ribonuclease R  31.41 
 
 		 895 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000714577  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  32.59 
 
 		 705 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  32.59 
 
 		 750 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  33.42 
 
 		 863 aa  175  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  33.78 
 
 		 906 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  31.1 
 
 		 825 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  33.88 
 
 		 876 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  32.52 
 
 		 706 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1816  ribonuclease R  31.53 
 
 		 886 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1021  ribonuclease R  31.53 
 
 		 838 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.204339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1798  ribonuclease R  31.53 
 
 		 838 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0807236  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1747  ribonuclease R  31.53 
 
 		 896 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1970  ribonuclease R  31.53 
 
 		 896 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0145  ribonuclease R  31.53 
 
 		 838 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0667377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1263  ribonuclease R  31.53 
 
 		 812 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  33.78 
 
 		 907 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.89 
 
 		 877 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  32.89 
 
 		 877 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  29.76 
 
 		 794 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  33.24 
 
 		 859 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  34.16 
 
 		 737 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  33.33 
 
 		 695 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  31.87 
 
 		 701 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  32.59 
 
 		 819 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4688  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II/ribonuclease R  32.11 
 
 		 828 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00492754  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  32.33 
 
 		 817 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  36.56 
 
 		 808 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  32.33 
 
 		 817 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  33.42 
 
 		 722 aa  171  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0659  ribonuclease R  33.91 
 
 		 842 aa  171  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  33.16 
 
 		 857 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  29.94 
 
 		 762 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  31.36 
 
 		 692 aa  170  5e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  33.16 
 
 		 857 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  33.88 
 
 		 880 aa  170  5e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  33.25 
 
 		 705 aa  170  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  35.31 
 
 		 833 aa  169  7e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  35.42 
 
 		 819 aa  169  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  32.89 
 
 		 857 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  33.01 
 
 		 1037 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  32.2 
 
 		 828 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  31.55 
 
 		 722 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0532  RNAse R  32.89 
 
 		 876 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2388  ribonuclease R  32.9 
 
 		 815 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  32.52 
 
 		 709 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  34.55 
 
 		 826 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  34.53 
 
 		 834 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  32.46 
 
 		 702 aa  166  5e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3355  ribonuclease R  36.17 
 
 		 829 aa  166  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.334074  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  32.96 
 
 		 746 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  29.74 
 
 		 735 aa  166  5.9999999999999996e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  32.96 
 
 		 746 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  31.37 
 
 		 788 aa  166  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  35.15 
 
 		 824 aa  166  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  33.8 
 
 		 821 aa  166  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  32.3 
 
 		 803 aa  166  9e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  32.51 
 
 		 716 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  32.76 
 
 		 870 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  35.76 
 
 		 817 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  32.55 
 
 		 804 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  32.49 
 
 		 706 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  30.75 
 
 		 619 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  33.33 
 
 		 770 aa  163  5.0000000000000005e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  34.41 
 
 		 715 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  33.15 
 
 		 757 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2972  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  32.52 
 
 		 805 aa  163  6e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>