More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1295 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1295  Exoribonuclease II  100 
 
 		 432 aa  891    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3094  Exoribonuclease II  90.74 
 
 		 432 aa  822    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0359  ribonuclease II  76.33 
 
 		 433 aa  679    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0142  ribonuclease II  78.8 
 
 		 439 aa  711    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0272  ribonuclease II  78.85 
 
 		 437 aa  728    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.588423  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1019  ribonuclease R  34.74 
 
 		 694 aa  192  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000144778  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  34.74 
 
 		 692 aa  191  2e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  35.18 
 
 		 535 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  34.97 
 
 		 716 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  33.42 
 
 		 708 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  32.77 
 
 		 1182 aa  186  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  33.41 
 
 		 763 aa  182  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  32.52 
 
 		 818 aa  179  7e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  32.32 
 
 		 705 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  34.79 
 
 		 757 aa  177  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  31.72 
 
 		 794 aa  176  6e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  31.26 
 
 		 795 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  33.57 
 
 		 759 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  33.33 
 
 		 788 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0774  ribonuclease R  33.33 
 
 		 886 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.223929 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0765  ribonuclease R  31.93 
 
 		 795 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.429506  normal  0.51814 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  30.65 
 
 		 836 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  31.51 
 
 		 863 aa  173  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  32.33 
 
 		 720 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5873  ribonuclease R  31.07 
 
 		 825 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  32.25 
 
 		 814 aa  171  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  32.43 
 
 		 752 aa  170  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0462  exoribonuclease II  30.26 
 
 		 750 aa  170  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  30.9 
 
 		 838 aa  170  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  31.7 
 
 		 777 aa  170  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  32.27 
 
 		 737 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  32.24 
 
 		 808 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  32 
 
 		 804 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1447  ribonuclease R  32.49 
 
 		 910 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  33.42 
 
 		 706 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  32.24 
 
 		 808 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  33.25 
 
 		 701 aa  168  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1319  hypothetical protein  32.18 
 
 		 718 aa  169  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.815351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  33.61 
 
 		 722 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  32 
 
 		 808 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  31.75 
 
 		 806 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  32 
 
 		 810 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  32 
 
 		 812 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  32 
 
 		 806 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03430  putative exoribonuclease  30.81 
 
 		 735 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  31.99 
 
 		 806 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  32.01 
 
 		 791 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3067  exoribonuclease II  34.66 
 
 		 808 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.802811  normal  0.171629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  32.27 
 
 		 737 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  34.42 
 
 		 751 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  32.53 
 
 		 763 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  32.48 
 
 		 749 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  32.51 
 
 		 758 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  33.41 
 
 		 705 aa  166  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  32.23 
 
 		 736 aa  166  8e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  33.24 
 
 		 746 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  33.24 
 
 		 746 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  30.96 
 
 		 819 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  30.42 
 
 		 803 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  30.38 
 
 		 813 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  32.05 
 
 		 722 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  34.22 
 
 		 801 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  30.52 
 
 		 842 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  31.99 
 
 		 762 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1407  ribonuclease R  34.42 
 
 		 880 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.243044  normal  0.755444 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  32.66 
 
 		 737 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  32.84 
 
 		 858 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  32.68 
 
 		 758 aa  164  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  32.5 
 
 		 792 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0925  ribonuclease R  32.84 
 
 		 1037 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  31.55 
 
 		 718 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  33.82 
 
 		 695 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  34.29 
 
 		 826 aa  163  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3417  ribonuclease R  34.26 
 
 		 834 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.629084 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0668  ribonuclease R  30.73 
 
 		 795 aa  162  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000570881  normal  0.0119217 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  32.84 
 
 		 857 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3590  ribonuclease R  32.85 
 
 		 819 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0101048  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  33.33 
 
 		 710 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03463  ribonuclease R  33.43 
 
 		 805 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  31.66 
 
 		 735 aa  162  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0511  ribonuclease R  33.64 
 
 		 817 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  32.76 
 
 		 833 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  33.05 
 
 		 710 aa  160  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  31.14 
 
 		 770 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  32.01 
 
 		 702 aa  160  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  33.9 
 
 		 833 aa  160  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0543  exoribonuclease II  31.27 
 
 		 649 aa  159  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5695  exoribonuclease R  33.15 
 
 		 813 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2136  ribonuclease R  31.73 
 
 		 714 aa  159  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.101446  normal  0.136172 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  31.91 
 
 		 791 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  31.96 
 
 		 706 aa  158  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04046  exoribonuclease R, RNase R  33.15 
 
 		 813 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.765624  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2177  ribonuclease R  32.6 
 
 		 821 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000855619  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  30.07 
 
 		 762 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0362  exoribonuclease R  32.32 
 
 		 824 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00569814 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4650  exoribonuclease R  33.15 
 
 		 813 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.526461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002268  ribonuclease R  33.24 
 
 		 834 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4738  exoribonuclease R  33.15 
 
 		 813 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.604978  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1447  ribonuclease R  32.43 
 
 		 817 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1468  ribonuclease R  32.43 
 
 		 817 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>