More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1825 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 886 aa  1692    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  45.78 
 
 		 824 aa  581  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  43.46 
 
 		 799 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  39.48 
 
 		 818 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3610  transcriptional regulator, LuxR family  38.06 
 
 		 840 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  35.68 
 
 		 792 aa  350  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  42.8 
 
 		 1085 aa  343  5.999999999999999e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 781 aa  335  2e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  37.09 
 
 		 999 aa  333  1e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  45.87 
 
 		 827 aa  330  9e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  40.54 
 
 		 1125 aa  329  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  47.29 
 
 		 1050 aa  320  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 1137 aa  317  6e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0802  transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 755 aa  314  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.616223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  40.03 
 
 		 1056 aa  313  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.46 
 
 		 816 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 882 aa  308  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  38.64 
 
 		 1227 aa  306  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  38.82 
 
 		 840 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.01 
 
 		 1102 aa  303  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.86 
 
 		 1092 aa  301  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0719  transcriptional regulator, LuxR family  34.56 
 
 		 768 aa  300  9e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.141698  hitchhiker  0.00663122 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 775 aa  300  9e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  37.32 
 
 		 1119 aa  299  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  38.72 
 
 		 1042 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 1058 aa  296  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 814 aa  295  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.46 
 
 		 1017 aa  294  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 1085 aa  293  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  37.64 
 
 		 1087 aa  290  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  43.9 
 
 		 887 aa  286  9e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  41.69 
 
 		 1055 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  36.95 
 
 		 960 aa  279  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.02 
 
 		 1103 aa  279  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 901 aa  274  5.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.38 
 
 		 1049 aa  271  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.91 
 
 		 1060 aa  271  5e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  33.95 
 
 		 701 aa  271  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  42.43 
 
 		 1066 aa  267  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  43.46 
 
 		 765 aa  266  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  37.05 
 
 		 1110 aa  263  8.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.55 
 
 		 1097 aa  262  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  41.83 
 
 		 916 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  40.86 
 
 		 760 aa  253  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  39.09 
 
 		 950 aa  253  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  43.02 
 
 		 966 aa  252  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  43.09 
 
 		 1043 aa  250  8e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 921 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  40.93 
 
 		 1058 aa  249  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1058  protein kinase  37.32 
 
 		 678 aa  246  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  42.8 
 
 		 1094 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1855  XRE family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 831 aa  245  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 799 aa  243  9e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  41.2 
 
 		 877 aa  243  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  43.29 
 
 		 776 aa  243  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  36.03 
 
 		 1036 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1195  putative regulator  41.14 
 
 		 780 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 1100 aa  239  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  36.64 
 
 		 1072 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  41.75 
 
 		 972 aa  238  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  30.11 
 
 		 975 aa  238  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 1093 aa  238  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 601 aa  237  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 1082 aa  235  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  42.47 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0434  tetratricopeptide TPR_4  37.89 
 
 		 907 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.253283  hitchhiker  0.000288682 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  43.7 
 
 		 591 aa  234  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  39.05 
 
 		 1010 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  43.97 
 
 		 948 aa  232  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  44.12 
 
 		 591 aa  230  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  41.99 
 
 		 1005 aa  230  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  40.25 
 
 		 943 aa  227  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  43.39 
 
 		 948 aa  227  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 658 aa  227  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  48.55 
 
 		 1158 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0684  transcriptional regulator, XRE family  35.18 
 
 		 779 aa  225  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  38.49 
 
 		 1001 aa  224  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 973 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  42.34 
 
 		 973 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  33.28 
 
 		 1018 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 393 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  37.62 
 
 		 957 aa  221  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1866  XRE family transcriptional regulator  28.01 
 
 		 812 aa  221  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  39.26 
 
 		 973 aa  220  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0364  adenylate cyclase  33.95 
 
 		 982 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  36.53 
 
 		 969 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 928 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1608  XRE family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 802 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3739  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 910 aa  214  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0768606  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  36.99 
 
 		 961 aa  213  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  38.88 
 
 		 952 aa  212  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 		 736 aa  211  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 872 aa  210  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  33.63 
 
 		 1048 aa  210  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  39.61 
 
 		 1014 aa  210  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 490 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  40.41 
 
 		 1064 aa  207  5e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  41.51 
 
 		 1131 aa  206  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6249  transcriptional regulator  34.39 
 
 		 1079 aa  203  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>