More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0823 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  46.02 
 
 		 813 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 817 aa  1669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  41.54 
 
 		 812 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  36.38 
 
 		 802 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  34.01 
 
 		 934 aa  436  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  35.52 
 
 		 829 aa  432  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  34.05 
 
 		 973 aa  430  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 853 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 869 aa  393  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 812 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 852 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 832 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 810 aa  313  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 766 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 821 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 830 aa  300  6e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 810 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 808 aa  290  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 819 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 824 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 828 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 818 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.37 
 
 		 894 aa  253  1e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 822 aa  251  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.28 
 
 		 715 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 791 aa  240  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  27.58 
 
 		 815 aa  240  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 818 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 826 aa  231  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 866 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 813 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.98 
 
 		 805 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 897 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 803 aa  216  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 820 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 847 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 827 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 816 aa  206  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 813 aa  204  6e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 817 aa  190  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 705 aa  184  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 799 aa  175  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 795 aa  173  9e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.52 
 
 		 820 aa  162  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 883 aa  162  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  34.8 
 
 		 804 aa  159  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  44.44 
 
 		 823 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 805 aa  151  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  38.06 
 
 		 814 aa  146  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 793 aa  144  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 		 725 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 611 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 		 800 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  34.05 
 
 		 814 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 794 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 		 806 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 998 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  30.92 
 
 		 961 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 805 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  29.32 
 
 		 946 aa  98.2  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 748 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  29.96 
 
 		 965 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 705 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  22.68 
 
 		 782 aa  80.9  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 760 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  27.31 
 
 		 872 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  30.43 
 
 		 952 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27.98 
 
 		 904 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  26.86 
 
 		 936 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  30.73 
 
 		 772 aa  76.6  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.2 
 
 		 924 aa  75.1  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  27.69 
 
 		 995 aa  74.3  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.62 
 
 		 944 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 972 aa  72.8  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  29.32 
 
 		 920 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  29.06 
 
 		 915 aa  70.5  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.63 
 
 		 887 aa  69.7  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  21.12 
 
 		 927 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  34.19 
 
 		 709 aa  67.8  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 946 aa  67.4  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 1004 aa  67  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  25.77 
 
 		 930 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 897 aa  67  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  23.86 
 
 		 926 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  28.34 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 1066 aa  64.7  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  25.52 
 
 		 847 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1094 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.82 
 
 		 929 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  28.68 
 
 		 808 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  34.13 
 
 		 767 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.14 
 
 		 921 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.23 
 
 		 891 aa  62.8  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  26.05 
 
 		 931 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 920 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 938 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  25.3 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  37.34 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0587  hemin uptake system outer membrane receptor  26.2 
 
 		 771 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.75575  normal  0.678568 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3260  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 739 aa  61.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>